More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1481 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1481  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 380 aa  751    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0928  glutamyl-tRNA reductase  64.04 
 
 		 387 aa  478  1e-134  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.878615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1917  glutamyl-tRNA reductase  55.16 
 
 		 393 aa  359  5e-98  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.406636 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0096  glutamyl-tRNA reductase  54.08 
 
 		 393 aa  345  6e-94  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2034  glutamyl-tRNA reductase  56.28 
 
 		 391 aa  343  2e-93  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000938392 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2261  glutamyl-tRNA reductase  52.57 
 
 		 403 aa  326  5e-88  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.200572  normal  0.0151163 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1730  glutamyl-tRNA reductase  36.05 
 
 		 406 aa  199  6e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0393271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1462  glutamyl-tRNA reductase  28.69 
 
 		 449 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3246  glutamyl-tRNA reductase  33.05 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3451  glutamyl-tRNA reductase  28.1 
 
 		 409 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.341697  normal  0.0956626 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  26.85 
 
 		 442 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0214  glutamyl-tRNA reductase  29.11 
 
 		 424 aa  136  5e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000943569  normal  0.0144632 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  30.34 
 
 		 440 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1219  glutamyl-tRNA reductase  28.74 
 
 		 457 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  30.58 
 
 		 434 aa  130  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  33.82 
 
 		 458 aa  129  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2132  glutamyl-tRNA reductase  30.57 
 
 		 447 aa  126  6e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  31.91 
 
 		 419 aa  125  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1229  glutamyl-tRNA reductase  29.91 
 
 		 422 aa  125  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000302896  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1100  glutamyl-tRNA reductase  29.27 
 
 		 379 aa  124  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  29.36 
 
 		 464 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1087  glutamyl-tRNA reductase  27.42 
 
 		 382 aa  124  4e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6499  glutamyl-tRNA reductase  27.53 
 
 		 440 aa  123  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.595047 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1296  glutamyl-tRNA reductase  26.21 
 
 		 425 aa  123  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  29.97 
 
 		 430 aa  123  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  32.28 
 
 		 443 aa  123  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0052  glutamyl-tRNA reductase  27.67 
 
 		 383 aa  122  9e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0279425  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1588  glutamyl-tRNA reductase  27.22 
 
 		 382 aa  122  9e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.082883  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0676  glutamyl-tRNA reductase  32.77 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0669  glutamyl-tRNA reductase  32.77 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0689  glutamyl-tRNA reductase  32.77 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1160  glutamyl-tRNA reductase  28.25 
 
 		 426 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.319065  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2825  glutamyl-tRNA reductase  31.07 
 
 		 438 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.546073  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  29.61 
 
 		 464 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2122  glutamyl-tRNA reductase  29.76 
 
 		 432 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0115057  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  32.18 
 
 		 432 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  30.64 
 
 		 434 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  33.85 
 
 		 461 aa  119  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0706  glutamyl-tRNA reductase  27.8 
 
 		 368 aa  119  7e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  30.49 
 
 		 446 aa  119  9e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0859  glutamyl-tRNA reductase  28.09 
 
 		 382 aa  119  9e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146184  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  28.66 
 
 		 450 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0091  glutamyl-tRNA reductase  30.1 
 
 		 340 aa  119  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  32.7 
 
 		 446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  31.51 
 
 		 434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  29.23 
 
 		 458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2211  glutamyl-tRNA reductase  29.41 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.271306  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  29.7 
 
 		 442 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  31.16 
 
 		 434 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  27.22 
 
 		 428 aa  117  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  26.9 
 
 		 428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  29.62 
 
 		 434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1612  glutamyl-tRNA reductase  30.67 
 
 		 447 aa  116  7.999999999999999e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.284753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  29.41 
 
 		 443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0685  glutamyl-tRNA reductase  28.82 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.310076  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2128  glutamyl-tRNA reductase  32.18 
 
 		 365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  30.82 
 
 		 424 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  30.12 
 
 		 443 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  30.12 
 
 		 443 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4440  glutamyl-tRNA reductase  30.21 
 
 		 434 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0844  glutamyl-tRNA reductase  34.29 
 
 		 456 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0729524  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  31.48 
 
 		 446 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  30.15 
 
 		 453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1516  glutamyl-tRNA reductase  28.88 
 
 		 426 aa  113  6e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0317  glutamyl-tRNA reductase  26.05 
 
 		 395 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  27.27 
 
 		 441 aa  112  8.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  30.82 
 
 		 414 aa  112  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  33 
 
 		 436 aa  112  9e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  30.58 
 
 		 436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  31.8 
 
 		 429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  28.91 
 
 		 454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0581  glutamyl-tRNA reductase  29.18 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.226139 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  30.19 
 
 		 446 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  25.77 
 
 		 428 aa  111  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  28.69 
 
 		 426 aa  111  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0067  glutamyl-tRNA reductase  30.75 
 
 		 455 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00785406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54134  glutamyl-trna reductase  29.82 
 
 		 512 aa  110  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0214782  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1456  glutamyl-tRNA reductase  25.34 
 
 		 414 aa  109  6e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.449307  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  29.73 
 
 		 443 aa  109  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0859  glutamyl-tRNA reductase  27.56 
 
 		 432 aa  109  7.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0924191  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  29.13 
 
 		 425 aa  109  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  27.95 
 
 		 426 aa  109  8.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  28.96 
 
 		 421 aa  109  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  30.13 
 
 		 432 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  30.56 
 
 		 446 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  31.77 
 
 		 438 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  26.51 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  30 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  33.1 
 
 		 440 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1228  glutamyl-tRNA reductase  28.62 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  26.51 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  30.56 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0810  glutamyl-tRNA reductase  27.73 
 
 		 459 aa  107  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  30.13 
 
 		 434 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  30.13 
 
 		 434 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  30.13 
 
 		 432 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  25.21 
 
 		 434 aa  107  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  30.13 
 
 		 434 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  30.13 
 
 		 434 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0049  glutamyl-tRNA reductase  31.6 
 
 		 411 aa  107  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>