161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2271 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2271  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  341  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0434  hypothetical protein  40.25 
 
 		 179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0551  membrane protein-like protein  41.98 
 
 		 180 aa  133  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937148 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  38.31 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3820  hypothetical protein  39.62 
 
 		 171 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  36.54 
 
 		 226 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  38.16 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1313  protein of unknown function DUF421  37.97 
 
 		 184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  36.36 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3285  membrane protein-like protein  38.71 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22155  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2641  hypothetical protein  34.38 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.865763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2686  hypothetical protein  34.38 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.565782  normal  0.0102559 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2670  hypothetical protein  34.38 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4346  protein of unknown function DUF421  38.12 
 
 		 174 aa  108  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0250687  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4212  protein of unknown function DUF421  33.77 
 
 		 188 aa  107  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6410  membrane protein-like protein  32.54 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  33.54 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  35.66 
 
 		 166 aa  99.8  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2201  membrane protein-like protein  31.79 
 
 		 186 aa  88.2  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2218  hypothetical protein  31.69 
 
 		 172 aa  85.9  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.450386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0399  protein of unknown function DUF421  33.12 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0914  hypothetical protein  29.75 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3836  hypothetical protein  36.89 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147989  normal  0.0810838 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  31.21 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11408  hypothetical protein  25.15 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0751825  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03310  hypothetical protein  30.83 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  28.87 
 
 		 232 aa  72  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  26.06 
 
 		 232 aa  67.4  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  26.35 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2237  hypothetical protein  27.86 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  26.95 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06995  hypothetical protein  28.48 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294218  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  21.99 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  21.66 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  24.83 
 
 		 258 aa  62  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  23.57 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  23.65 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3817  hypothetical protein  27.34 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4894  hypothetical protein  27.34 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  23.33 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3287  hypothetical protein  27.34 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.581053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  23.45 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1415  hypothetical protein  21.62 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.228022 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  24.32 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  23.74 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  26.24 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0127  hypothetical protein  24 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2030  hypothetical protein  26.06 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334364  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  21.32 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1012  protein of unknown function DUF421  23.26 
 
 		 243 aa  57  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0711  protein of unknown function DUF421  24.14 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2189  hypothetical protein  24 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000145811  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6439  conserved hypothetical membrane-anchored protein  26.24 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  25 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  25.17 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00910  conserved inner membrane protein  24.82 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  24.82 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  24.82 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0566  hypothetical protein  26.28 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  24.82 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1003  hypothetical protein  24.82 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0243553  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2690  hypothetical protein  24.82 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355377  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2215  hypothetical protein  24.82 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.297842 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5498  hypothetical protein  22.92 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  24.82 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  24.82 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3940  hypothetical protein  25.78 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4533  hypothetical protein  24.81 
 
 		 215 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0230316  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0071  hypothetical protein  27.52 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2791  hypothetical protein  26.57 
 
 		 272 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  22.79 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1130  hypothetical protein  26.57 
 
 		 272 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  22.46 
 
 		 227 aa  53.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  23.94 
 
 		 232 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2639  YdfS  24.68 
 
 		 236 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2115  hypothetical membrane associated protein  26.85 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4309  hypothetical protein  24.81 
 
 		 215 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126531  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4158  hypothetical protein  24.81 
 
 		 215 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0166527  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  21.13 
 
 		 172 aa  52.4  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4644  hypothetical protein  24.81 
 
 		 215 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4147  hypothetical protein  24.81 
 
 		 215 aa  52  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000615268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4494  hypothetical protein  24.81 
 
 		 215 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327358 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3510  hypothetical protein  26.53 
 
 		 146 aa  51.6  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1938  protein of unknown function DUF421  22.92 
 
 		 236 aa  51.2  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1339  hypothetical protein  25.78 
 
 		 167 aa  51.2  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3114  hypothetical protein  25.78 
 
 		 167 aa  51.2  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2990  hypothetical protein  25.78 
 
 		 167 aa  51.2  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.138787  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4261  hypothetical protein  25 
 
 		 218 aa  50.8  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00116962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  24.03 
 
 		 215 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  24.03 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3115  protein of unknown function DUF421  24.26 
 
 		 229 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0220  hypothetical protein  25 
 
 		 253 aa  50.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  20.92 
 
 		 230 aa  50.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1124  protein of unknown function DUF421  27.7 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2636  protein of unknown function DUF421  24.64 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.753675  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  21.85 
 
 		 211 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0707  hypothetical protein  26.62 
 
 		 150 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159977  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1009  hypothetical protein  25.37 
 
 		 230 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1074  hypothetical protein  25.37 
 
 		 230 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325553 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1089  hypothetical protein  25.37 
 
 		 230 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>