More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00191 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00191  Mg-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase  100 
 
 		 506 aa  1043    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0875  radical SAM family Fe-S protein  47.67 
 
 		 495 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0876  radical SAM family Fe-S protein  34.23 
 
 		 461 aa  258  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1626  Radical SAM domain protein  27.05 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  25.33 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1338  radical SAM/B12 binding domain protein  26.32 
 
 		 494 aa  118  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_101  radical SAM/B12 binding domain protein  26.32 
 
 		 494 aa  118  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0108  radical SAM domain-containing protein  25.98 
 
 		 494 aa  117  6e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2195  Radical SAM domain protein  27.53 
 
 		 460 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.565929  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0279  radical SAM domain-containing protein  25.72 
 
 		 494 aa  114  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  25.52 
 
 		 1250 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  26.9 
 
 		 450 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  27.34 
 
 		 451 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  24.69 
 
 		 472 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1693  radical SAM family protein  29.64 
 
 		 467 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2416  radical SAM domain-containing protein  24.49 
 
 		 469 aa  107  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  27.01 
 
 		 563 aa  101  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  23.61 
 
 		 472 aa  99.8  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2638  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  27.01 
 
 		 512 aa  97.8  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  24.51 
 
 		 441 aa  97.1  7e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  25.94 
 
 		 489 aa  96.3  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  24.27 
 
 		 441 aa  95.1  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3195  Radical SAM domain protein  24.07 
 
 		 552 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554212 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1134  putative Fe-S oxidoreductase  23.51 
 
 		 425 aa  94.4  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4090  radical SAM domain-containing protein  24.1 
 
 		 462 aa  94.7  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  27.44 
 
 		 473 aa  92.8  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  25.71 
 
 		 554 aa  92.8  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1590  Radical SAM domain protein  24.88 
 
 		 488 aa  93.2  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2472  radical SAM domain-containing protein  26.41 
 
 		 507 aa  92.8  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  24.45 
 
 		 533 aa  92.4  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  22.84 
 
 		 472 aa  92.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0762  Fe-S oxidoreductase  25.38 
 
 		 484 aa  91.7  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151938  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2393  radical SAM domain-containing protein  24.94 
 
 		 490 aa  91.3  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.386797  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2479  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  24.03 
 
 		 484 aa  91.3  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.515921  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  22.51 
 
 		 459 aa  90.5  6e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3608  radical SAM domain-containing protein  27.75 
 
 		 459 aa  89.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0820  Radical SAM domain protein  32.29 
 
 		 583 aa  89.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3390  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  30.05 
 
 		 485 aa  89  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0874  radical SAM family Fe-S protein  26.42 
 
 		 501 aa  87.8  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2407  radical SAM domain-containing protein  25.88 
 
 		 471 aa  87.8  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4225  radical SAM domain-containing protein  32.52 
 
 		 576 aa  87.4  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  25.69 
 
 		 1288 aa  87  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1927  cobalamin B12-binding domain protein  22.4 
 
 		 288 aa  87  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2434  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  26.34 
 
 		 424 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  24.81 
 
 		 518 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0454  radical SAM domain-containing protein  32.04 
 
 		 576 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  24.74 
 
 		 471 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0353  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  25.77 
 
 		 485 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.90319 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4199  cobalamin B12-binding:radical SAM family protein  21.72 
 
 		 548 aa  84.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.122489 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  27.51 
 
 		 488 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4087  radical SAM domain-containing protein  25.93 
 
 		 458 aa  83.6  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1369  radical SAM domain-containing protein  24.61 
 
 		 556 aa  83.6  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805279  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0238  radical SAM domain-containing protein  25.7 
 
 		 461 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140637  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1836  radical SAM domain-containing protein  28.79 
 
 		 474 aa  82  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  22.19 
 
 		 473 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3401  Radical SAM domain protein  23.5 
 
 		 484 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1976  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.18 
 
 		 546 aa  81.6  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.175578  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05330  Fe-S oxidoreductase  28.39 
 
 		 495 aa  81.3  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  22.36 
 
 		 461 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0878  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  29.08 
 
 		 473 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.858521  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3382  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  29.61 
 
 		 473 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  26.13 
 
 		 864 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0138  Radical SAM domain protein  25.78 
 
 		 608 aa  80.1  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000809293  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0516  radical SAM domain-containing protein  24.23 
 
 		 501 aa  80.1  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0942  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.11 
 
 		 528 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0893  Radical SAM domain protein  23.82 
 
 		 681 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.878222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1602  radical SAM family Fe-S protein  20.56 
 
 		 487 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0906  cobalamin B12-binding domain protein  23.86 
 
 		 456 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0597  radical SAM family protein  23.53 
 
 		 501 aa  79  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.678652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3533  Radical SAM domain protein  24.87 
 
 		 506 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  30.32 
 
 		 487 aa  79  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3130  Radical SAM domain protein  22.9 
 
 		 448 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3553  Radical SAM domain protein  25.19 
 
 		 474 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0873  radical SAM family Fe-S protein  30.41 
 
 		 501 aa  77.8  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2281  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.16 
 
 		 520 aa  77.8  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3408  radical SAM family protein  28.08 
 
 		 473 aa  77.4  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2434  radical SAM domain-containing protein  27.34 
 
 		 520 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0251  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  22.68 
 
 		 546 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.42517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  26.65 
 
 		 564 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3569  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  31.56 
 
 		 478 aa  77.4  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.663184 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2319  radical SAM family Fe-S protein  25.96 
 
 		 501 aa  77  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2158  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.02 
 
 		 546 aa  77  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1157  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2315  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  22.68 
 
 		 546 aa  77  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.03087  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2209  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  22.66 
 
 		 546 aa  77  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.561885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1165  Radical SAM domain protein  24.11 
 
 		 506 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1584  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.11 
 
 		 527 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3552  Radical SAM domain protein  26.69 
 
 		 488 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  23.61 
 
 		 468 aa  76.3  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3467  Radical SAM domain protein  24.11 
 
 		 506 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1699  Radical SAM domain protein  25.32 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000206113  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  24.09 
 
 		 529 aa  75.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0233  Radical SAM domain protein  22.66 
 
 		 723 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.677011 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0229  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  22.16 
 
 		 547 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2433  radical SAM domain-containing protein  23.3 
 
 		 502 aa  74.3  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0030  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  24.92 
 
 		 647 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  26.36 
 
 		 520 aa  73.6  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3364  Radical SAM domain protein  29.67 
 
 		 564 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.669906 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4964  radical SAM family protein  27.83 
 
 		 476 aa  73.6  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.576294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4173  radical SAM domain-containing protein  26.21 
 
 		 513 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0027  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  25.38 
 
 		 651 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>