More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4356 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4356  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 104 aa  216  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4051  regulatory protein, ArsR  94.23 
 
 		 104 aa  208  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0987  ArsR family transcriptional regulator  81 
 
 		 100 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179786 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4467  ArsR family transcriptional regulator  77 
 
 		 100 aa  167  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0921  ArsR family transcriptional regulator  77 
 
 		 100 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0964497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1284  ArsR family transcriptional regulator  77 
 
 		 100 aa  166  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0960  regulatory protein, ArsR  77 
 
 		 100 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.123294 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37790  ArsR family regulatory protein  72.92 
 
 		 100 aa  148  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4925  hypothetical protein  66 
 
 		 100 aa  147  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56620  hypothetical protein  66 
 
 		 100 aa  147  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5520  ArsR family transcriptional regulator  67.65 
 
 		 102 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.906756 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4674  ArsR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 102 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3604  ArsR family transcriptional regulator  67.65 
 
 		 102 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.887196  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4149  ArsR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 102 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4763  ArsR family transcriptional regulator  67.65 
 
 		 102 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1121  ArsR family transcriptional regulator  68.37 
 
 		 106 aa  141  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.534807 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0952  ArsR family transcriptional regulator  67.65 
 
 		 102 aa  140  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3893  ArsR family transcriptional regulator  69.07 
 
 		 102 aa  140  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2017  ArsR family transcriptional regulator  63 
 
 		 100 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0103246 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2723  putative transcriptional regulator, ArsR family  62.24 
 
 		 97 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0152441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4809  ArsR family transcriptional regulator  65.31 
 
 		 109 aa  130  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.276728 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2984  putative transcriptional regulator, ArsR family  61.22 
 
 		 97 aa  130  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1246  regulatory protein ArsR  62.77 
 
 		 96 aa  128  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.675599  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4065  ArsR family transcriptional regulator  60.2 
 
 		 117 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1211  ArsR family transcriptional regulator  62.38 
 
 		 101 aa  124  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.418515  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1355  ArsR family transcriptional regulator  62.38 
 
 		 101 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2475  ArsR family transcriptional regulator  62.38 
 
 		 101 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187417  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0952  ArsR family transcriptional regulator  62.38 
 
 		 101 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0339  ArsR family transcriptional regulator  62.38 
 
 		 101 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627396  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0618  ArsR family transcriptional regulator  62.38 
 
 		 101 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.982996  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1284  ArsR family transcriptional regulator  62.38 
 
 		 101 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0563641  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1522  ArsR family transcriptional regulator  61.39 
 
 		 165 aa  124  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5804  transcriptional regulator, ArsR family  60.64 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832353  normal  0.28843 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3142  transcriptional regulator ArsR family  60.42 
 
 		 95 aa  121  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315203  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1467  regulatory protein ArsR  57.45 
 
 		 102 aa  114  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18400  regulatory protein, ArsR family  51.55 
 
 		 101 aa  110  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0903  ArsR family transcriptional regulator  59.3 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0846  ArsR family transcriptional regulator  59.3 
 
 		 127 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.760794  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2484  ArsR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 101 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3338  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 100 aa  104  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3384  regulatory protein, ArsR  54.55 
 
 		 100 aa  104  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1500  ArsR family transcriptional regulator  49 
 
 		 100 aa  101  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.574004  normal  0.560617 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5009  ArsR family transcriptional regulator  56.63 
 
 		 115 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799446  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2915  ArsR family transcriptional regulator  49 
 
 		 100 aa  99.4  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1460  regulatory protein ArsR  51.16 
 
 		 100 aa  99  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.481156  normal  0.479599 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5640  ArsR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.694385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1732  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 115 aa  96.3  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44825  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1745  putative transcriptional regulator, ArsR family  47 
 
 		 100 aa  96.7  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0405672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1336  transcriptional regulator, ArsR family  50.54 
 
 		 98 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0571  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 100 aa  95.1  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1152  regulatory protein, ArsR  48.39 
 
 		 102 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6888  ArsR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 100 aa  92.8  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14310  putative transcriptional regulator  48 
 
 		 100 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4298  regulatory protein, ArsR  39.8 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0868  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 103 aa  87.8  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06305  transcriptional regulator, ArsR family protein  40.86 
 
 		 100 aa  84  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2780  hypothetical protein  40 
 
 		 99 aa  82.8  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1476  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2058  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1845  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5129  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.465873  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3270  ArsR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 99 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2954  ArsR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2912  ArsR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6910  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.772723  normal  0.418498 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4173  ArsR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4824  ArsR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337473  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3342  ArsR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  37.08 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0534  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3094  ArsR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 110 aa  52.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556039  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1936  ArsR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4024  transcriptional regulator, ArsR family  34.52 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0486243  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3288  transcriptional regulator, ArsR family  34.65 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0616099  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  33.77 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  33.77 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3194  transcriptional regulator, ArsR family  34.65 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0329  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1200  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 98 aa  50.1  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1644  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  35.23 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14690  regulatory protein ArsR  30.59 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.27611e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  32.1 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1719  ArsR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  32.97 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 96 aa  48.9  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>