More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3685 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3685  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
546 aa  1087    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1789  chemotaxis sensory transducer  85.71 
 
 
546 aa  921    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.478165  decreased coverage  0.000703042 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1353  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.72 
 
 
547 aa  549  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.769572  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.04 
 
 
547 aa  519  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0341  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.61 
 
 
544 aa  445  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0513  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.87 
 
 
542 aa  323  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0065  methyl-accepting chemotaxis protein  31.57 
 
 
548 aa  267  2.9999999999999995e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.826549  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2256  chemotaxis sensory transducer  33.48 
 
 
548 aa  253  8.000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000776973  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1636  methyl-accepting chemotaxis protein  32.01 
 
 
547 aa  250  6e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0033  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.14 
 
 
593 aa  243  7e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.684678  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.36 
 
 
638 aa  226  8e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.79 
 
 
640 aa  224  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.57 
 
 
640 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2395  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.78 
 
 
572 aa  210  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  38.36 
 
 
712 aa  211  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  40.83 
 
 
642 aa  210  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2968  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.78 
 
 
572 aa  209  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.536058 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  38.11 
 
 
712 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.15 
 
 
638 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43220  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  41.24 
 
 
652 aa  209  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.62 
 
 
638 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2538  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.49 
 
 
521 aa  207  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0549264  normal  0.252917 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  40.28 
 
 
642 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.35 
 
 
541 aa  207  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.11 
 
 
639 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  37.89 
 
 
629 aa  206  9e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2634  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.12 
 
 
542 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.917034  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.65 
 
 
650 aa  204  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.23 
 
 
638 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.8 
 
 
638 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3680  methyl-accepting chemotaxis protein  41.95 
 
 
676 aa  203  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3580  methyl-accepting chemotaxis protein  36.97 
 
 
546 aa  203  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0728  chemotaxis sensory transducer  40.92 
 
 
639 aa  203  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.76 
 
 
646 aa  203  7e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  32.86 
 
 
541 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3351  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.27 
 
 
570 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540062  normal  0.0241334 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.8 
 
 
637 aa  202  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.25 
 
 
638 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1150  chemotaxis sensory transducer  35.06 
 
 
551 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  41.85 
 
 
681 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.55 
 
 
638 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  44.29 
 
 
647 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.81 
 
 
634 aa  201  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4192  chemotaxis sensory transducer  40.56 
 
 
654 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.66 
 
 
668 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.17 
 
 
425 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.817651  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1334  methyl-accepting chemotaxis protein  34.57 
 
 
550 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.74 
 
 
639 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.66043 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  33.09 
 
 
541 aa  197  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 
636 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5092  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.5 
 
 
640 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.44 
 
 
552 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14959  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.46 
 
 
552 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5553  methyl-accepting chemotaxis protein  38.48 
 
 
640 aa  197  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1007  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.66 
 
 
573 aa  196  9e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.02936  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4706  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  32.21 
 
 
541 aa  196  9e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.53 
 
 
773 aa  196  9e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.4 
 
 
638 aa  195  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0755  chemotaxis sensory transducer  30.78 
 
 
567 aa  196  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.93 
 
 
541 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.32 
 
 
541 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2268  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.9 
 
 
541 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255239  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0712  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.4 
 
 
624 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  38.44 
 
 
633 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5160  methyl-accepting chemotaxis protein  42.55 
 
 
647 aa  194  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.391343  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.54 
 
 
541 aa  194  4e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  41.12 
 
 
713 aa  194  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.97 
 
 
544 aa  194  5e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3979  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.56 
 
 
552 aa  193  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.594367  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0633  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.56 
 
 
552 aa  193  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.23 
 
 
543 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5159  methyl-accepting chemotaxis protein  40.4 
 
 
638 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3218  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.27 
 
 
551 aa  192  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.359634  normal  0.412717 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.1 
 
 
495 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000865197  normal  0.384283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.78 
 
 
739 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247309  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  32.09 
 
 
541 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.1 
 
 
495 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00108184  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.36 
 
 
542 aa  192  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.34 
 
 
632 aa  191  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.24 
 
 
541 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.722367  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.25 
 
 
619 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0379  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  41.98 
 
 
647 aa  191  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.454626  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1022  methyl-accepting chemotaxis protein  40.74 
 
 
628 aa  191  4e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.771007  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.24 
 
 
541 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  decreased coverage  0.0000342214 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.44 
 
 
541 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.582352  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0671  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
531 aa  190  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178659  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.82 
 
 
495 aa  190  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299178  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.68 
 
 
637 aa  190  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0265  methyl-accepting chemotaxis protein  36.72 
 
 
561 aa  189  9e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2451  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.06 
 
 
655 aa  189  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.932747 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.89 
 
 
634 aa  189  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.93 
 
 
647 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0828859  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3279  methyl-accepting chemotaxis protein  31.5 
 
 
541 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149652  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3666  chemotaxis transducer  32.67 
 
 
541 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.260935  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.93 
 
 
541 aa  189  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43710  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  32.6 
 
 
541 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4658  chemotaxis sensory transducer, Pas/Pac sensor  43.79 
 
 
529 aa  189  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.89 
 
 
638 aa  189  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.22 
 
 
647 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.95 
 
 
639 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.886367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>