More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3065 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3065  hypothetical protein  100 
 
 		 448 aa  921    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0139193  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4836  FAD dependent oxidoreductase  67.19 
 
 		 448 aa  623  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0458657 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5280  FAD dependent oxidoreductase  64.73 
 
 		 448 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7256  oxidoreductase  64.96 
 
 		 448 aa  585  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4005  oxidoreductase, NAD-binding site  45.66 
 
 		 446 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0756508  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4751  FAD dependent oxidoreductase  43.67 
 
 		 447 aa  357  1.9999999999999998e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.563662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4774  FAD dependent oxidoreductase  40.36 
 
 		 448 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.952242  normal  0.115123 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4822  FAD dependent oxidoreductase  39.6 
 
 		 448 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537727  normal  0.272998 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4112  FAD dependent oxidoreductase  35.07 
 
 		 439 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09750  putative oxidoreductase  36.3 
 
 		 439 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1374  FAD dependent oxidoreductase  34.44 
 
 		 439 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0470201 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6865  FAD dependent oxidoreductase  34.39 
 
 		 443 aa  269  7e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5757  FAD dependent oxidoreductase  34.09 
 
 		 443 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2818  FAD dependent oxidoreductase  34.46 
 
 		 439 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001295  glycine/D-amino acid oxidase  32.57 
 
 		 438 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5370  oxidoreductase-related protein  33.26 
 
 		 442 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.195 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2113  putative oxidoreductase protein  32.47 
 
 		 387 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0578145  normal  0.36209 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2297  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 446 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4199  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 		 437 aa  212  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1106  FAD dependent oxidoreductase  32.36 
 
 		 439 aa  208  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4482  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 437 aa  203  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2476  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 430 aa  172  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.326489  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 		 472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  25.11 
 
 		 470 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  25.63 
 
 		 428 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 437 aa  104  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  25.95 
 
 		 482 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 		 426 aa  99.8  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4439  FAD dependent oxidoreductase  25.62 
 
 		 453 aa  99.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  0.839002 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4329  FAD dependent oxidoreductase  25.62 
 
 		 453 aa  99.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2743  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  26.93 
 
 		 455 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0233618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 		 430 aa  97.1  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  23.85 
 
 		 427 aa  96.7  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 494 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  23.75 
 
 		 427 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  24 
 
 		 427 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 		 425 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  23.83 
 
 		 433 aa  95.5  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  23.95 
 
 		 427 aa  95.5  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  22.6 
 
 		 437 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  24.56 
 
 		 423 aa  94.4  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 		 433 aa  93.6  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  22.58 
 
 		 439 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  24.26 
 
 		 443 aa  92.8  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0887  putative FAD-binding oxidoreductase  25.76 
 
 		 426 aa  92.8  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 		 473 aa  92.8  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 		 436 aa  92  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5032  FAD dependent oxidoreductase  25.22 
 
 		 494 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5828  FAD dependent oxidoreductase  25.22 
 
 		 494 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  23.39 
 
 		 453 aa  91.3  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3597  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 425 aa  91.3  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4280  FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 		 441 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.372193 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 		 480 aa  89.7  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 		 482 aa  89.7  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  24.49 
 
 		 433 aa  89.7  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  22.94 
 
 		 439 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  27.85 
 
 		 433 aa  89.4  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2376  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 		 427 aa  89.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2808  oxidoreductase, putative  25.81 
 
 		 455 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  26.2 
 
 		 468 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  26.2 
 
 		 468 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6580  FAD dependent oxidoreductase  25.61 
 
 		 442 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785564  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  24.57 
 
 		 433 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  23.33 
 
 		 431 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3719  FAD dependent oxidoreductase  25.42 
 
 		 429 aa  87.4  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.0527853 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  26.17 
 
 		 428 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3730  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 423 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4808  FAD dependent oxidoreductase  26.28 
 
 		 429 aa  86.7  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 		 425 aa  86.7  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0378  FAD dependent oxidoreductase  24.57 
 
 		 422 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0322129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4014  hypothetical protein  24.94 
 
 		 427 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  23.79 
 
 		 427 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  23.99 
 
 		 427 aa  86.3  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5383  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.199839  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  24.47 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 		 496 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0778  FAD dependent oxidoreductase  24.18 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0594018  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  24.02 
 
 		 427 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  24.26 
 
 		 433 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  23.23 
 
 		 432 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  23.75 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  26.52 
 
 		 443 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3264  FAD dependent oxidoreductase  22.7 
 
 		 427 aa  84.3  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  23.57 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  23.02 
 
 		 465 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  24.94 
 
 		 428 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  21.5 
 
 		 436 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  24.39 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3463  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 		 429 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4903  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 		 429 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  24.43 
 
 		 449 aa  83.6  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3449  FAD dependent oxidoreductase  24.57 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  23.49 
 
 		 434 aa  83.6  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  27.04 
 
 		 430 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 469 aa  83.2  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  24.33 
 
 		 433 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  21.82 
 
 		 433 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>