More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3283 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_38560  putative MFS transporter  98.44 
 
 
450 aa  860    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020424  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  81.92 
 
 
465 aa  661    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3283  MFS family transporter  100 
 
 
450 aa  874    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170295  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  41.37 
 
 
453 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  41.65 
 
 
452 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  41.65 
 
 
452 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  42.46 
 
 
453 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  41.69 
 
 
453 aa  306  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  39.86 
 
 
451 aa  294  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  40.76 
 
 
453 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  38.83 
 
 
454 aa  291  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  37.47 
 
 
441 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  40.67 
 
 
451 aa  289  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  40.67 
 
 
451 aa  289  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  39.82 
 
 
449 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  40.36 
 
 
451 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  40.88 
 
 
451 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  40.88 
 
 
451 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  40.88 
 
 
451 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  40.88 
 
 
451 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  38.08 
 
 
449 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  41.36 
 
 
450 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  40.55 
 
 
453 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  41.06 
 
 
454 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  41.13 
 
 
475 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  36.19 
 
 
438 aa  278  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  38.1 
 
 
459 aa  277  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  41.38 
 
 
579 aa  276  7e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  38.24 
 
 
448 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  39.9 
 
 
455 aa  274  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  37.22 
 
 
454 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  36.6 
 
 
457 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  39.58 
 
 
452 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  37.89 
 
 
448 aa  270  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  41.77 
 
 
446 aa  269  7e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  39.19 
 
 
449 aa  269  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  38.91 
 
 
450 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  38 
 
 
448 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  41.58 
 
 
454 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  40.71 
 
 
453 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  40.71 
 
 
453 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  38.48 
 
 
448 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  36.96 
 
 
452 aa  264  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  40.93 
 
 
441 aa  264  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  36.51 
 
 
452 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  41.77 
 
 
458 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  38.69 
 
 
447 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  41.92 
 
 
449 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  39.95 
 
 
453 aa  260  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  37.2 
 
 
447 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2766  MFS family transporter  42.93 
 
 
449 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  39.85 
 
 
457 aa  256  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  34.87 
 
 
452 aa  257  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  34.37 
 
 
452 aa  256  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4944  major facilitator transporter  38.28 
 
 
456 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  37.95 
 
 
451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2418  4-hydroxybenzoate transporter  38 
 
 
452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364564  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  36.76 
 
 
465 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  39.9 
 
 
448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4904  major facilitator transporter  39.3 
 
 
446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2325  4-hydroxybenzoate transporter  38 
 
 
452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  39.9 
 
 
448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2414  4-hydroxybenzoate transporter  38 
 
 
452 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2369  4-hydroxybenzoate transporter  38.23 
 
 
452 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.708273  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  38.8 
 
 
452 aa  253  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  37.47 
 
 
461 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  33.72 
 
 
448 aa  252  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2696  MFS superfamily protocatechuate transporter  36.55 
 
 
458 aa  252  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309624  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  35.54 
 
 
452 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  35.01 
 
 
465 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  38.26 
 
 
458 aa  251  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  37.38 
 
 
461 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  35.78 
 
 
458 aa  250  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  38.18 
 
 
468 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  33.49 
 
 
447 aa  249  5e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  34.76 
 
 
452 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  41.5 
 
 
453 aa  247  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  34.37 
 
 
454 aa  246  9e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2340  4-hydroxybenzoate transporter  36.92 
 
 
449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.934409  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2690  major facilitator transporter  37.04 
 
 
455 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  35.06 
 
 
454 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1205  4-hydroxybenzoate transporter  39.91 
 
 
451 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0050  4-hydroxybenzoate transporter  39.91 
 
 
451 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1488  4-hydroxybenzoate transporter  39.91 
 
 
451 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0061  4-hydroxybenzoate transporter  39.91 
 
 
451 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586422  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0733  major facilitator transporter  36.82 
 
 
454 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2526  4-hydroxybenzoate transporter  38.23 
 
 
452 aa  242  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  36.62 
 
 
449 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2748  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  39.42 
 
 
450 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  35.51 
 
 
453 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3941  major facilitator transporter  40.18 
 
 
449 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.939508 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4030  major facilitator superfamily MFS_1  39.3 
 
 
463 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  34.28 
 
 
439 aa  237  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  39.09 
 
 
451 aa  237  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0717  major facilitator transporter  35.51 
 
 
530 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.320017 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32660  MFS family transporter  41.25 
 
 
448 aa  236  7e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00466329  hitchhiker  0.0000329882 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0059  4-hydroxybenzoate transporter  39.35 
 
 
451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1558  4-hydroxybenzoate transporter  39.35 
 
 
451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787543  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0072  4-hydroxybenzoate transporter  39.22 
 
 
451 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279221  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  38.06 
 
 
442 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>