99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3041 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3041  cointegrase  100 
 
 		 291 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2249  phage integrase family protein  38.57 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2511  phage integrase  37.99 
 
 		 448 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2976  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  35.64 
 
 		 319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0607408  normal  0.0219571 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3109  cointegrate resolution protein S  36.33 
 
 		 319 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00637573  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2981  Tn4652, cointegrate resolution protein S  36.33 
 
 		 323 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0457753 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2535  phage integrase family protein  37.72 
 
 		 326 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3181  phage integrase family site specific recombinase  37.72 
 
 		 316 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1640  integrase family protein  35.48 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5281  integrase family protein  35.48 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1987  phage integrase family protein  34.41 
 
 		 319 aa  179  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35820  cointegrate resolution protein S  37.32 
 
 		 323 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000225241  decreased coverage  6.17783e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3058  cointegrate resolution protein S  37.32 
 
 		 323 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2926  Phage integrase  34.89 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0537176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2669  integrase family protein  37.02 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2680  integrase family protein  36.68 
 
 		 316 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25710  cointegrate resolution protein S  36.33 
 
 		 325 aa  172  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2276  integrase family protein  33.93 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00370914  hitchhiker  0.000967634 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2392  integrase family protein  36.3 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0530338  normal  0.472164 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2105  integrase family protein  36.3 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5342  putative cointegrate resolution protein S / recombinase  34.65 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00624  cointegrase  33.92 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.281729  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1382  Phage integrase  30.88 
 
 		 335 aa  115  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1698  Phage integrase  30.39 
 
 		 328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3968  phage integrase family protein  28.89 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02951  Phage integrase  27.37 
 
 		 336 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0008  DNA integration/recombination/inversion protein  30.4 
 
 		 314 aa  99.4  6e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.856285  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4367  phage integrase family protein  27.84 
 
 		 335 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1962  AP endonuclease  26.74 
 
 		 326 aa  98.2  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4316  phage integrase family protein  28.21 
 
 		 340 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0918  integrase family protein  27.6 
 
 		 329 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3964  phage integrase family protein  24.1 
 
 		 380 aa  91.3  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00221994  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2304  phage integrase  30.83 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0327568  normal  0.0181167 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2995  integrase family protein  25.76 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.941848  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6972  integrase family protein  23.43 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0164563  normal  0.0336098 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8481  integrase family protein  23.62 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383754  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7902  integrase family protein  23.62 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.356547  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1883  site-specific recombinase XerD-like  26.15 
 
 		 649 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6128  integrase family protein  25.1 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1908  phage integrase family protein  24.6 
 
 		 338 aa  69.3  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.454202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0046  putative integrase  31.25 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6851  integrase family protein  24.48 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100628  normal  0.271303 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2466  integrase family protein  28.36 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0580014  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4157  integrase domain-containing protein  27.27 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2094  integrase family protein  24.58 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000349759  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1674  phage integrase family protein  24.11 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2382  integrase family protein  23.93 
 
 		 354 aa  67  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0941885  normal  0.501513 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2033  phage integrase family protein  29.18 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4680  integrase family protein  26.16 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1996  phage integrase family protein  29.18 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1943  phage integrase family protein  29.61 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171548  normal  0.0940691 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5646  integrase family protein  24.71 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.575287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2244  phage integrase family protein  24.44 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.111867  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2384  phage integrase family site specific recombinase  26.14 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3359  integrase family protein  29.96 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0031  DNA integration/recombination/inversion protein  30.41 
 
 		 163 aa  61.6  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.976428  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4027  integrase family protein  27.4 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.461361  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8553  integrase family protein  25.56 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453986  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2380  phage integrase family protein  26.5 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.503709  normal  0.032696 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2082  integrase family protein  26.5 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.024543  hitchhiker  0.000210845 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0638  putative phage recombinase  24.02 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0874979  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2092  phage integrase family protein  26.5 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2263  phage integrase family protein  26 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00650578  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6311  integrase family protein  27.22 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.692197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5471  integrase family protein  23.87 
 
 		 382 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3780  integrase family protein  24.39 
 
 		 383 aa  57  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.325182  normal  0.557184 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8006  integrase protein  25.52 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4524  phage integrase family protein  24.7 
 
 		 380 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6146  integrase family protein  24.29 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1553  putative integrase/recombinase  24.53 
 
 		 343 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3277  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  25.27 
 
 		 375 aa  54.3  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3434  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  25.27 
 
 		 375 aa  53.9  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9008  phage integrase family protein  25.17 
 
 		 377 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6161  integrase family protein  27.67 
 
 		 382 aa  52.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.365462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4516  phage integrase  26.42 
 
 		 422 aa  52  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7008  phage integrase family protein  24.49 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4511  phage integrase  25.32 
 
 		 369 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.694348  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4239  hypothetical protein  24.62 
 
 		 365 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0653636  normal  0.519885 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4820  phage integrase family protein  23.26 
 
 		 356 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2261  phage integrase  24.89 
 
 		 353 aa  50.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.245925  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9510  phage-related integrase  36.9 
 
 		 370 aa  49.7  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0464246  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5431  phage integrase family protein  38.1 
 
 		 391 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1804  integrase family protein  23.81 
 
 		 401 aa  48.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000010936 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3751  integrase family protein  24.91 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2752  integrase domain protein SAM domain protein  25.12 
 
 		 362 aa  47  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00014768  normal  0.023237 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4358  phage integrase  23.95 
 
 		 408 aa  47  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4792  integrase family protein  24.66 
 
 		 363 aa  46.6  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00356022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1972  integrase family protein  23.08 
 
 		 359 aa  45.8  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.713568  normal  0.0793814 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4579  phage integrase  23.71 
 
 		 406 aa  45.8  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.18624  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3773  integrase family protein  23.05 
 
 		 390 aa  45.8  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4716  phage integrase family protein  24.7 
 
 		 379 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6280  integrase family protein  25.12 
 
 		 335 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4195  phage integrase  25.15 
 
 		 408 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0564405  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2480  integrase family protein  23.61 
 
 		 354 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.608661 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4548  phage integrase  23.61 
 
 		 421 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.832393  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  29.48 
 
 		 312 aa  44.3  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  25.66 
 
 		 295 aa  43.5  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0663  tyrosine recombinase XerD  31.11 
 
 		 305 aa  42.7  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0057  tyrosine recombinase XerD  29.73 
 
 		 312 aa  42.7  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>