More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0313 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0313  putative CoA transferase, subunit B  100 
 
 		 260 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02770  putative CoA transferase, subunit B  98.85 
 
 		 260 aa  521  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0187646 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38210  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  88.46 
 
 		 260 aa  473  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305454  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1268  coenzyme A transferase  88.93 
 
 		 259 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4012  glutaconate CoA-transferase  86.56 
 
 		 259 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0155612 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4308  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  86.17 
 
 		 259 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2824  coenzyme A transferase  63.64 
 
 		 256 aa  343  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0300  coenzyme A transferase  64 
 
 		 258 aa  332  5e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1583  glutaconate CoA-transferase  62.65 
 
 		 269 aa  319  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.485468  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3047  coenzyme A transferase  57.3 
 
 		 277 aa  318  7e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292404  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7929  3-oxoadipate CoA-transferase  65.98 
 
 		 251 aa  317  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331501  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2327  3-oxoadipate CoA-transferase  63.35 
 
 		 253 aa  314  8e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.656893 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12990  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit  62.6 
 
 		 259 aa  314  9.999999999999999e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2284  coenzyme A transferase  61.16 
 
 		 251 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.263478 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2836  coenzyme A transferase  62.92 
 
 		 251 aa  295  5e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.478676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5086  Glutaconate CoA-transferase  62.5 
 
 		 251 aa  286  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3922  coenzyme A transferase  47.11 
 
 		 271 aa  221  9.999999999999999e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1891  glutaconate CoA-transferase  36.84 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.514889  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1643  coenzyme A transferase  39.76 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2560  coenzyme A transferase  35.2 
 
 		 264 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1481  glutaconate CoA-transferase  35.63 
 
 		 271 aa  148  7e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1907  coenzyme A transferase  34.29 
 
 		 270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0720648 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0404  glutaconate CoA-transferase  32.39 
 
 		 269 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00014468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3034  glutaconate CoA-transferase  32.4 
 
 		 275 aa  138  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1708  coenzyme A transferase  31.6 
 
 		 273 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.993873 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0809  glutaconate CoA-transferase  33.6 
 
 		 274 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.402177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2127  Glutaconate CoA-transferase  35.56 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1388  coenzyme A transferase  32.38 
 
 		 274 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.939402 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2970  coenzyme A transferase  34.41 
 
 		 256 aa  129  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0885606  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2824  coenzyme A transferase  31.56 
 
 		 274 aa  129  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2697  coenzyme A transferase  33.73 
 
 		 269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1039  putative coenzyme A transferase, subunit B  36.14 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000541022  normal  0.887029 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1132  glutaconate CoA-transferase  31.98 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0489191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4179  coenzyme A transferase  33.2 
 
 		 257 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4812  glutaconate CoA-transferase  30.52 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0754543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5071  coenzyme A transferase  29.89 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000546344  normal  0.377928 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4843  glutaconate CoA-transferase  30.52 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321655  normal  0.834327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  32.67 
 
 		 590 aa  99  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2063  acyl CoA:acetate  33.73 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2606  coenzyme A transferase  30.28 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2805  coenzyme A transferase  31.33 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000176999 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2155  coenzyme A transferase  29.92 
 
 		 276 aa  93.6  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1889  putative glutaconate CoA-transferase, subunit B  34.18 
 
 		 248 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.694614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4599  putative CoA transferase, subunit B  31.96 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3828  coenzyme A transferase  32.68 
 
 		 247 aa  89.7  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2752  putative acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit, AtoA-like  29.3 
 
 		 312 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00379387  normal  0.241661 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1433  Acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit  30.94 
 
 		 265 aa  86.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2745  putative CoA transferase beta subunit  30.59 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3296  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  29.48 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  28.46 
 
 		 599 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1471  coenzyme A transferase  30.13 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.60655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3616  putative CoA transferase, subunit B  32.93 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0480669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1559  putative CoA transferase beta subunit  32.8 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1379  coenzyme A transferase  27.45 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5133  coenzyme A transferase  33.55 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2059  coenzyme A transferase  28.19 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.581965  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2071  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  27.84 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1222  coenzyme A transferase  34.97 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3752  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  28.22 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1077  CoA transferase, subunit B  35.8 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4620  coenzyme A transferase  29.92 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1075  coenzyme A transferase, beta subunit  29.22 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.425854 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1204  putative CoA transferase, subunit B  35.19 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3983  coenzyme A transferase  27.43 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08490  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  29.63 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.506696 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3054  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.1 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0826  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.56 
 
 		 216 aa  68.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2075  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  28.21 
 
 		 221 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4771  putative CoA transferase beta subunit  25.97 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5070  putative CoA transferase beta subunit  25.97 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.214302  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4685  putative CoA transferase beta subunit  25.97 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1488  putative CoA transferase beta subunit  27.31 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07040  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  30.63 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.238632 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1013  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.35 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.300705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5268  putative CoA transferase beta subunit  26.61 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02904  glutaconate CoA transferase subunit B  60.38 
 
 		 67 aa  64.7  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4338  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  30.08 
 
 		 222 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0323675  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2734  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  26.92 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7913  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  30 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3085  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.82 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3123  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  26.92 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3238  3-oxoacid CoA-transferase  27.35 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2432  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  26.92 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2593  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  26.92 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13585  CoA-transferase subunit beta  24.51 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0392184  normal  0.0501609 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3848  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  26.46 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0238959  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1407  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.75 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217887 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1389  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  30.57 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51600  3-oxoacid CoA-transferase  28.09 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0519  3-oxoacid CoA-transferase  26.92 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3294  putative CoA transferase, subunit B  28.63 
 
 		 218 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15294  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38640  putative CoA transferase, subunit B  28.63 
 
 		 218 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1669  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  26.92 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3456  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B family  27.78 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0591  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.83 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2355  putative CoA transferase beta subunit  30.77 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18940  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  29.22 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0409943  normal  0.556426 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.8 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1471  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  27.27 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155964  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  27.35 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>