More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3203 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  100 
 
 		 396 aa  748    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  39.06 
 
 		 409 aa  232  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  39.73 
 
 		 414 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  43.58 
 
 		 409 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  39.77 
 
 		 402 aa  222  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4891  major facilitator transporter  43.58 
 
 		 409 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390253  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3273  major facilitator transporter  43.58 
 
 		 409 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0542458 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6916  major facilitator transporter  43.58 
 
 		 409 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6406  major facilitator transporter  43.58 
 
 		 409 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  34.28 
 
 		 403 aa  194  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  35.26 
 
 		 388 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0711  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 410 aa  176  6e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 397 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  34.4 
 
 		 381 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  26.36 
 
 		 423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  26.36 
 
 		 423 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  26.36 
 
 		 423 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  30.13 
 
 		 421 aa  132  7.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  33.13 
 
 		 404 aa  130  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 414 aa  122  8e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 408 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0679  major facilitator transporter  34.69 
 
 		 357 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3739  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 403 aa  106  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3637  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476152  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  26.39 
 
 		 373 aa  102  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 400 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2090  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 410 aa  97.4  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106737  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 		 385 aa  92  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  31.56 
 
 		 388 aa  90.5  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 		 383 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  29.64 
 
 		 386 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  28.66 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3646  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2079  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 423 aa  79.7  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.816032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2281  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  23.99 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  20.65 
 
 		 399 aa  66.2  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0947  drug resistance transporter  23.12 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  25.87 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  22.82 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  22.82 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0494  molybdopterin biosynthesis protein  23.75 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  22.69 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 397 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  32.12 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  26.78 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2460  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.42 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.154885  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.42 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1308  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000644714  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  32.06 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 405 aa  57  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.47 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2023  putative multidrug resistance protein  25.51 
 
 		 432 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.52874e-46 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1819  multidrug resistance protein  25.51 
 
 		 432 aa  56.6  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.310045  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  22.69 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  30.53 
 
 		 449 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  22.69 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  30 
 
 		 443 aa  56.6  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 421 aa  56.2  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  23.65 
 
 		 383 aa  55.8  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 421 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  22.16 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1833  multidrug efflux transport protein EefD  28.07 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.531383  hitchhiker  0.0000436585 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3218  major facilitator transporter  17.92 
 
 		 385 aa  54.3  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  28.42 
 
 		 407 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2371  major facilitator superfamily MFS_1  23.35 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  23.38 
 
 		 403 aa  54.7  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0813  major facilitator family transporter  23.42 
 
 		 393 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1930  multidrug efflux transport protein EefD  27.63 
 
 		 387 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624404 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  34 
 
 		 513 aa  54.3  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 414 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 		 426 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  27.95 
 
 		 479 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0134  major facilitator superfamily permease  22.28 
 
 		 332 aa  53.5  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  28.38 
 
 		 471 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0232  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 		 380 aa  52.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0530  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000669622  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  31.43 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0658  major facilitator transporter  21.3 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>