159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1796 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1796  D-amino acid oxidase  100 
 
 		 360 aa  717    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229908  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18941  NAD binding site:D-amino acid oxidase  91.36 
 
 		 360 aa  633  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19131  NAD binding site:D-amino acid oxidase  85 
 
 		 360 aa  626  1e-178  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.119558  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18941  NAD binding site:D-amino acid oxidase  64.07 
 
 		 360 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21851  NAD binding site:D-amino acid oxidase  35.05 
 
 		 370 aa  252  9.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1312  FAD dependent oxidoreductase  34.51 
 
 		 368 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18391  NAD binding site:D-amino acid oxidase  33.7 
 
 		 371 aa  225  9e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.299081  normal  0.626898 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2673  D-amino acid oxidase  29.38 
 
 		 350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30031  NAD binding site:D-amino acid oxidase  28.7 
 
 		 372 aa  209  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2302  D-amino acid oxidase  30.79 
 
 		 302 aa  193  5e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5037  FAD dependent oxidoreductase  27.58 
 
 		 360 aa  137  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1793  FAD dependent oxidoreductase  27.58 
 
 		 389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.075637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0520  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 		 369 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0537  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 		 369 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1461  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 		 379 aa  120  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942129  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1783  FAD dependent oxidoreductase  26.04 
 
 		 381 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.359042  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0199  FAD dependent oxidoreductase  28.36 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  25.71 
 
 		 372 aa  97.8  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1677  hypothetical protein  25.29 
 
 		 365 aa  96.3  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.32351  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  24.4 
 
 		 369 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  24.4 
 
 		 369 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  23.71 
 
 		 369 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  23.35 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  23.51 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  23.41 
 
 		 385 aa  86.3  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  24.13 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  24.13 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  23.59 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  23.43 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  23.32 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  24.07 
 
 		 652 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  22.97 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  21.91 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  22.47 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  21.43 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  22.31 
 
 		 404 aa  69.3  0.00000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  24.56 
 
 		 367 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  19.56 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  21.37 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  21.37 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  20.56 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  19.44 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  20.73 
 
 		 361 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  21.88 
 
 		 375 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  20.77 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  24.82 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  20.28 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  22.1 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  20.22 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1370  FAD dependent oxidoreductase  22.07 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  22.1 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  25.27 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  20.34 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  19.94 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  25.25 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  25.82 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  23.26 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  20.92 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  19.94 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  20.06 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  19.94 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3929  FAD dependent oxidoreductase  17.13 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371488  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  21.14 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  19.83 
 
 		 440 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  22.49 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1302  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  19.38 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.490757  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  20.73 
 
 		 960 aa  60.1  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  20.44 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  25.71 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  20.05 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  20.51 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3505  FAD dependent oxidoreductase  23.06 
 
 		 465 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604467 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  20.39 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  21.61 
 
 		 666 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  16.99 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  21.61 
 
 		 666 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  21.02 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  20.68 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  20.39 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  20.92 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  21.27 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  22.85 
 
 		 394 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  22.65 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  21.14 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  26.28 
 
 		 365 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  20.67 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  20.97 
 
 		 371 aa  56.2  0.0000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  21.1 
 
 		 375 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  20.22 
 
 		 375 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  21.76 
 
 		 383 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  20.05 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  20.22 
 
 		 375 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  21.1 
 
 		 375 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  21.1 
 
 		 375 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 365 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  26.14 
 
 		 365 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8303  D-nopaline dehydrogenase  23.18 
 
 		 356 aa  53.9  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.039629  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1848  FAD dependent oxidoreductase  20 
 
 		 378 aa  53.5  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  19.55 
 
 		 349 aa  53.1  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>