More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1747 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_18451  trigger factor  82.58 
 
 
473 aa  729    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.344876  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18641  trigger factor  95.86 
 
 
474 aa  836    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0250835  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1747  trigger factor  100 
 
 
481 aa  945    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18451  trigger factor  96.11 
 
 
477 aa  840    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.546976  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1253  trigger factor  52.73 
 
 
472 aa  465  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21241  trigger factor  53.3 
 
 
472 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0066  trigger factor  47.51 
 
 
469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17811  trigger factor  50.11 
 
 
471 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00701  trigger factor  48.67 
 
 
479 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0063  trigger factor  45.1 
 
 
447 aa  433  1e-120  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.461988  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  39.32 
 
 
471 aa  332  9e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  38.6 
 
 
485 aa  301  3e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  38.39 
 
 
479 aa  299  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2524  trigger factor  36.11 
 
 
474 aa  298  2e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4363  trigger factor  34.42 
 
 
500 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  35.65 
 
 
460 aa  290  4e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2925  trigger factor  33.02 
 
 
455 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3171  trigger factor  33.02 
 
 
455 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  31.16 
 
 
435 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  30.09 
 
 
433 aa  205  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  34.93 
 
 
432 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  34.64 
 
 
446 aa  196  6e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  30.77 
 
 
488 aa  196  7e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  29.33 
 
 
429 aa  196  9e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  30.62 
 
 
436 aa  191  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  29.04 
 
 
433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  29.04 
 
 
433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  34.65 
 
 
433 aa  189  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  31.68 
 
 
425 aa  187  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  31.68 
 
 
425 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  31.21 
 
 
425 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  31.44 
 
 
425 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  31.44 
 
 
425 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  31.44 
 
 
425 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  31.44 
 
 
425 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  31.44 
 
 
425 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  31.68 
 
 
425 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  31.21 
 
 
425 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  31.88 
 
 
438 aa  184  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  30.05 
 
 
438 aa  182  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  32.24 
 
 
427 aa  182  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  32.56 
 
 
439 aa  180  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  33.85 
 
 
431 aa  179  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  32.2 
 
 
449 aa  179  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  29.02 
 
 
426 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  30.21 
 
 
428 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  30.09 
 
 
433 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  27.06 
 
 
446 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  30.82 
 
 
435 aa  170  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  31.13 
 
 
435 aa  170  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  30 
 
 
434 aa  168  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  31.17 
 
 
428 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  29.57 
 
 
463 aa  164  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  28.61 
 
 
435 aa  163  7e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  31.56 
 
 
444 aa  163  8.000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  30.33 
 
 
424 aa  162  1e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  30.62 
 
 
436 aa  162  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  28.78 
 
 
427 aa  161  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  31.27 
 
 
434 aa  162  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  29.65 
 
 
434 aa  161  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  30.09 
 
 
427 aa  161  3e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  29.13 
 
 
428 aa  160  6e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  29.82 
 
 
435 aa  160  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  31.47 
 
 
441 aa  159  7e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  31.14 
 
 
428 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  31.14 
 
 
428 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  29.71 
 
 
427 aa  157  3e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  30.29 
 
 
434 aa  157  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  29.95 
 
 
436 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  31.34 
 
 
434 aa  157  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  28.19 
 
 
435 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2496  trigger factor  30.53 
 
 
434 aa  155  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000460382  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  31.36 
 
 
478 aa  155  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  28.1 
 
 
434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  29.74 
 
 
438 aa  153  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  29.02 
 
 
437 aa  154  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  29.77 
 
 
434 aa  153  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  30.63 
 
 
434 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  30.77 
 
 
434 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  30.53 
 
 
429 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  26.74 
 
 
448 aa  150  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0198  trigger factor  29.92 
 
 
435 aa  150  6e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  28.22 
 
 
451 aa  150  7e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  30.03 
 
 
434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  30.03 
 
 
434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  30.03 
 
 
434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  30.26 
 
 
429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  28.47 
 
 
434 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2597  trigger factor  28.47 
 
 
434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000131318  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  30.09 
 
 
434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0843  trigger factor  29.05 
 
 
544 aa  148  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.793444  normal  0.0950155 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  30.41 
 
 
434 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  30.41 
 
 
434 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  27.32 
 
 
440 aa  148  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  28.99 
 
 
445 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1830  trigger factor  28.81 
 
 
443 aa  147  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09080  trigger factor  28.38 
 
 
452 aa  147  4.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.985719  normal  0.0224029 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  30.63 
 
 
434 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1826  trigger factor  28.57 
 
 
443 aa  146  9e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  32.92 
 
 
436 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>