More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0292 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0292  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
240 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.155159  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03131  ABC transporter ATP-binding protein  94.17 
 
 
240 aa  457  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03141  ABC transporter ATP-binding protein  93.75 
 
 
240 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03231  ABC transporter ATP-binding protein  84.58 
 
 
261 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.91104  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03161  ABC transporter ATP-binding protein  67.08 
 
 
270 aa  345  4e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25221  ABC transporter ATP-binding protein  64.85 
 
 
247 aa  332  4e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.862645 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0234  ATPase  66.23 
 
 
232 aa  318  3e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0207  ATPase  62.34 
 
 
248 aa  318  3e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0989114  normal  0.489158 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1656  ABC transporter ATP-binding protein  66.95 
 
 
261 aa  317  1e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03701  ABC transporter ATP-binding protein  66.95 
 
 
261 aa  317  1e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.569464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3808  ABC transporter related  48.1 
 
 
262 aa  228  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.140241  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0531  ABC transporter related  46.47 
 
 
261 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  hitchhiker  0.00910021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0514  ABC transporter related  46.47 
 
 
261 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0350  ATPase  45.57 
 
 
292 aa  215  5e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2164  ABC transporter related  45.8 
 
 
261 aa  214  9e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3036  ABC transporter related  44.12 
 
 
261 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.845975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2673  ABC transporter-like  45.38 
 
 
260 aa  210  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0997  ABC transporter-like protein protein  44.54 
 
 
260 aa  207  8e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0883738  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16468  ABC(ATP-binding) family transporter: toluene tolerance  42.11 
 
 
256 aa  202  4e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222539  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2585  ABC transporter related  40.42 
 
 
259 aa  198  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
248 aa  176  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  41.84 
 
 
250 aa  168  7e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  41.25 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  39.5 
 
 
248 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  41.91 
 
 
248 aa  164  8e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  36.4 
 
 
257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  40.69 
 
 
260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  39.58 
 
 
249 aa  159  3e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  37.76 
 
 
257 aa  159  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  37.66 
 
 
252 aa  159  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0662  ABC transporter related  38.89 
 
 
244 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4315  ABC transporter related  39.13 
 
 
259 aa  156  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696843  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1748  ABC transporter related  35.83 
 
 
264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.751418  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1816  toluene tolerance protein  36.25 
 
 
264 aa  155  6e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  39.15 
 
 
251 aa  154  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  37.3 
 
 
252 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  37.92 
 
 
255 aa  153  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  36.97 
 
 
248 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  36.13 
 
 
248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  36.13 
 
 
248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03211  ABC transporter ATP-binding protein  35.42 
 
 
264 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  36.55 
 
 
257 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  39.83 
 
 
273 aa  149  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  36.96 
 
 
252 aa  149  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1695  ABC transporter related  37.78 
 
 
244 aa  149  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  35.22 
 
 
296 aa  148  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0237  ABC transporter related  35.74 
 
 
268 aa  148  8e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1227  ABC transporter, ATP-binding protein  37.45 
 
 
272 aa  148  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  37.34 
 
 
260 aa  148  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  36.21 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4016  ABC transporter related  35.42 
 
 
265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.304399  normal  0.276484 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  36.84 
 
 
266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0189  ABC transporter related  37.66 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0746681  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1872  ABC transporter-related protein  37.78 
 
 
244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00971328 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2985  ABC-type organic solvent transporter, ATP-binding protein  37.93 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.444132  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  35.42 
 
 
270 aa  146  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0796  ABC transporter related  38.98 
 
 
255 aa  146  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  35.56 
 
 
256 aa  146  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  36.4 
 
 
268 aa  145  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  36.29 
 
 
245 aa  145  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  36.71 
 
 
262 aa  145  6e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  34.73 
 
 
256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3240  ABC transporter related  35.56 
 
 
277 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.738413  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2893  ABC transporter related  35.56 
 
 
277 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  34.18 
 
 
363 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  35.42 
 
 
264 aa  144  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2749  ABC transporter related  34.45 
 
 
270 aa  144  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1738  ABC transporter related  36.73 
 
 
244 aa  143  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5282  ABC transporter related  34.89 
 
 
248 aa  142  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17632 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1743  ABC transporter-related protein  35.96 
 
 
271 aa  142  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  35.15 
 
 
306 aa  141  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3315  ABC transporter related  36.09 
 
 
258 aa  141  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000690504 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0441  ATPase  35.84 
 
 
244 aa  141  9e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  32.64 
 
 
283 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  35.44 
 
 
262 aa  139  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  33.61 
 
 
275 aa  140  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2253  ABC transporter related  35.96 
 
 
244 aa  139  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.491715  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57880  ABC transporter ATP-binding protein  35.56 
 
 
269 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5028  ABC transporter ATP-binding protein  35.56 
 
 
269 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0863  ABC transporter-like  35.15 
 
 
270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  34.58 
 
 
293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  39.74 
 
 
248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1922  ABC transporter related  38.68 
 
 
259 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0797  ABC transporter related  37.66 
 
 
283 aa  138  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126555  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0646  ABC transporter, ATP-binding protein  37.66 
 
 
283 aa  138  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0479  ATPase  35.96 
 
 
244 aa  138  6e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119209  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0158  toluene ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.87 
 
 
276 aa  138  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0337  ABC transporter related  34.87 
 
 
274 aa  138  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.425163 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3122  ABC transporter related  33.47 
 
 
273 aa  138  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.701707  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  34.87 
 
 
271 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2292  ABC transporter related  36.17 
 
 
279 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  33.89 
 
 
273 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0096  ABC transporter related  33.89 
 
 
282 aa  138  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.568034  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0698  ABC transporter, ATP-binding protein  34.36 
 
 
242 aa  137  1e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1453  ABC transporter related  34.45 
 
 
257 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0793  ABC transporter related  34.58 
 
 
282 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215167  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  34.58 
 
 
273 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4484  ABC transporter related  34.87 
 
 
257 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  36.32 
 
 
261 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  33.91 
 
 
258 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>