More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1243 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  40.74 
 
 		 870 aa  636    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18351  DNA mismatch repair protein MutS  51.87 
 
 		 913 aa  942    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  45.86 
 
 		 888 aa  785    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  45.97 
 
 		 888 aa  786    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  45.56 
 
 		 854 aa  748    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18541  DNA mismatch repair protein MutS  51.04 
 
 		 913 aa  931    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1243  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 926 aa  1891    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.32952  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  46.86 
 
 		 854 aa  778    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3815  DNA mismatch repair protein MutS  44.7 
 
 		 907 aa  758    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.548974 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0081  DNA mismatch repair protein MutS  53.39 
 
 		 905 aa  971    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294772  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0078  DNA mismatch repair protein MutS  54.43 
 
 		 903 aa  976    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.167909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1737  DNA mismatch repair protein MutS  51.55 
 
 		 913 aa  934    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0169322  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  47.91 
 
 		 882 aa  802    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00881  DNA mismatch repair protein MutS  55.38 
 
 		 927 aa  1021    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0543692 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17711  DNA mismatch repair protein MutS  58.85 
 
 		 908 aa  1023    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  45.21 
 
 		 885 aa  769    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18351  DNA mismatch repair protein MutS  51.79 
 
 		 914 aa  936    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21131  DNA mismatch repair protein MutS  84.56 
 
 		 926 aa  1620    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0652427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  45.38 
 
 		 901 aa  763    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  39.37 
 
 		 870 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  40.02 
 
 		 932 aa  615  9.999999999999999e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  39.64 
 
 		 872 aa  612  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  39.38 
 
 		 869 aa  610  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  39.24 
 
 		 891 aa  598  1e-169  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  37.86 
 
 		 871 aa  596  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  38.83 
 
 		 873 aa  596  1e-169  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  39.52 
 
 		 872 aa  595  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  40.43 
 
 		 859 aa  592  1e-168  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  39.55 
 
 		 896 aa  590  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  39.03 
 
 		 857 aa  592  1e-167  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  39.79 
 
 		 900 aa  586  1e-166  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  38.23 
 
 		 869 aa  585  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  38.46 
 
 		 870 aa  588  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  38.04 
 
 		 853 aa  580  1e-164  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  38.82 
 
 		 868 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  38.05 
 
 		 889 aa  578  1.0000000000000001e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  37.45 
 
 		 868 aa  575  1.0000000000000001e-162  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  38.73 
 
 		 823 aa  575  1.0000000000000001e-162  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  39.18 
 
 		 867 aa  570  1e-161  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  37.46 
 
 		 881 aa  570  1e-161  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  38.32 
 
 		 863 aa  569  1e-161  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  38.24 
 
 		 882 aa  570  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  38.44 
 
 		 910 aa  570  1e-161  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  37.93 
 
 		 857 aa  570  1e-161  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  38.75 
 
 		 871 aa  565  1e-160  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  38.97 
 
 		 897 aa  569  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  38.91 
 
 		 863 aa  566  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  38.32 
 
 		 910 aa  568  1e-160  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  38.63 
 
 		 859 aa  566  1e-160  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  38.27 
 
 		 872 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  36.59 
 
 		 880 aa  565  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  37.32 
 
 		 851 aa  557  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  36.06 
 
 		 874 aa  558  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  38.14 
 
 		 887 aa  558  1e-157  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  36.32 
 
 		 882 aa  558  1e-157  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  39.62 
 
 		 863 aa  555  1e-156  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  36.85 
 
 		 859 aa  553  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  38.03 
 
 		 856 aa  552  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  37.59 
 
 		 854 aa  555  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  37.8 
 
 		 868 aa  553  1e-156  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  36.71 
 
 		 854 aa  550  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  38.35 
 
 		 850 aa  550  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  37.59 
 
 		 854 aa  551  1e-155  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  37.36 
 
 		 848 aa  551  1e-155  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  37.19 
 
 		 858 aa  550  1e-155  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  37.4 
 
 		 854 aa  550  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  37.11 
 
 		 896 aa  549  1e-154  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  36.51 
 
 		 873 aa  546  1e-154  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  35.75 
 
 		 872 aa  546  1e-154  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  36.88 
 
 		 872 aa  546  1e-154  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  36.98 
 
 		 872 aa  549  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  36.17 
 
 		 860 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  37.31 
 
 		 873 aa  546  1e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  38.7 
 
 		 898 aa  544  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  36.4 
 
 		 859 aa  544  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  36.72 
 
 		 854 aa  545  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  36.73 
 
 		 856 aa  545  1e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  36.4 
 
 		 853 aa  539  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  38 
 
 		 878 aa  541  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  37.02 
 
 		 856 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  36.97 
 
 		 852 aa  536  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  37.48 
 
 		 858 aa  538  1e-151  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  37.59 
 
 		 862 aa  536  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  36.9 
 
 		 855 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  37.14 
 
 		 853 aa  537  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  36.91 
 
 		 887 aa  538  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  36.23 
 
 		 862 aa  538  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3263  DNA mismatch repair protein MutS  36.97 
 
 		 889 aa  536  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  36.24 
 
 		 861 aa  536  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  36.78 
 
 		 855 aa  535  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  36.78 
 
 		 855 aa  535  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  36.3 
 
 		 851 aa  534  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  36.48 
 
 		 868 aa  535  1e-150  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  36.96 
 
 		 858 aa  533  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  36.78 
 
 		 855 aa  535  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  36.66 
 
 		 855 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  36.78 
 
 		 854 aa  535  1e-150  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  35.51 
 
 		 875 aa  533  1e-150  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  36.18 
 
 		 851 aa  531  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  36.2 
 
 		 856 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>