More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0110 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_07361  carboxyl-terminal processing protease  97.7 
 
 		 434 aa  845    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775451 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0110  C-terminal processing peptidase-2  100 
 
 		 434 aa  860    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.196179  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07911  carboxyl-terminal processing protease  64.19 
 
 		 450 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal  0.0109245 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  58.51 
 
 		 449 aa  509  1e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  62.91 
 
 		 453 aa  501  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  59.6 
 
 		 444 aa  487  1e-136  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  55.76 
 
 		 444 aa  471  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  56.84 
 
 		 444 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07301  carboxyl-terminal processing protease  57.14 
 
 		 444 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07501  carboxyl-terminal processing protease  59.2 
 
 		 433 aa  461  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  51.29 
 
 		 425 aa  427  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  54.26 
 
 		 429 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  51.99 
 
 		 430 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  51.74 
 
 		 430 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  51.21 
 
 		 427 aa  409  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  51.49 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  53.42 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  51.95 
 
 		 426 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  46.34 
 
 		 431 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  44.88 
 
 		 413 aa  346  4e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  46.29 
 
 		 434 aa  345  1e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  46.03 
 
 		 446 aa  340  2e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  44.53 
 
 		 447 aa  340  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  42.27 
 
 		 407 aa  337  2.9999999999999997e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3440  C-terminal processing peptidase-2  43.31 
 
 		 417 aa  335  7e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0509581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  44.5 
 
 		 440 aa  325  8.000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  42.96 
 
 		 412 aa  323  4e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  42.57 
 
 		 434 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1614  carboxyl-terminal protease  44.13 
 
 		 458 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1589  carboxyl-terminal protease  44.13 
 
 		 458 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  45.31 
 
 		 409 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  40.44 
 
 		 413 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  40.44 
 
 		 413 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2052  carboxyl-terminal protease  44.18 
 
 		 416 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.774311 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  41.64 
 
 		 440 aa  309  6.999999999999999e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4901  carboxyl-terminal protease  38 
 
 		 410 aa  262  8e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  38.53 
 
 		 394 aa  256  8e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1850  peptidase S41A, C-terminal protease  37.63 
 
 		 429 aa  251  2e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333848  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  37.3 
 
 		 457 aa  240  4e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  37.3 
 
 		 436 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21861  carboxyl-terminal protease  31.75 
 
 		 446 aa  236  8e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  35.96 
 
 		 436 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13600  predicted protein  38.35 
 
 		 389 aa  233  3e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.29725  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  37.22 
 
 		 429 aa  233  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  36.6 
 
 		 410 aa  233  5e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  35.97 
 
 		 398 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  43.05 
 
 		 426 aa  232  1e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  43.69 
 
 		 418 aa  232  1e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  36.15 
 
 		 441 aa  231  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  37.18 
 
 		 431 aa  231  3e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  42.72 
 
 		 452 aa  229  5e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  42.38 
 
 		 439 aa  228  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  41.35 
 
 		 400 aa  228  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  36.08 
 
 		 427 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  36.36 
 
 		 428 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  39.44 
 
 		 444 aa  227  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  43.23 
 
 		 423 aa  227  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  40.37 
 
 		 439 aa  225  1e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  39.46 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  39.46 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  44.22 
 
 		 428 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  42.68 
 
 		 440 aa  224  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  41.78 
 
 		 456 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  41.69 
 
 		 444 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  41.77 
 
 		 443 aa  223  7e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  41.45 
 
 		 457 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  37.87 
 
 		 428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  41.12 
 
 		 458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  40.13 
 
 		 446 aa  220  3e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  40.92 
 
 		 451 aa  220  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  40.81 
 
 		 440 aa  221  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  40.59 
 
 		 451 aa  220  5e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  34.81 
 
 		 482 aa  219  6e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  34.81 
 
 		 482 aa  219  6e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  41.39 
 
 		 397 aa  219  7e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  40.46 
 
 		 452 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  39.94 
 
 		 439 aa  219  8.999999999999998e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  41.97 
 
 		 440 aa  218  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  38.26 
 
 		 401 aa  218  1e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  39.17 
 
 		 468 aa  218  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  41.46 
 
 		 443 aa  218  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  40.4 
 
 		 438 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  40.86 
 
 		 433 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  43.38 
 
 		 441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  42.9 
 
 		 438 aa  217  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  42.81 
 
 		 443 aa  217  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  41.25 
 
 		 429 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  33.16 
 
 		 432 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  39.94 
 
 		 478 aa  215  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  32.56 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  40.99 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  41.74 
 
 		 445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  41.74 
 
 		 445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  40.24 
 
 		 455 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  40.73 
 
 		 472 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  37.58 
 
 		 457 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  39.8 
 
 		 387 aa  214  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  34.04 
 
 		 475 aa  213  4.9999999999999996e-54  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  39.29 
 
 		 444 aa  213  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  41.07 
 
 		 444 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>