More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_58482 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_58482  predicted protein  100 
 
 		 376 aa  779    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.901315  normal  0.257892 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0137  peptide chain release factor 1  41.23 
 
 		 361 aa  280  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  0.125169 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  46.89 
 
 		 361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2999  peptide chain release factor 1  42.73 
 
 		 359 aa  267  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  40.27 
 
 		 357 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1869  peptide chain release factor 1  42.69 
 
 		 359 aa  265  7e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  40.33 
 
 		 356 aa  265  1e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1800  peptide chain release factor 1  42.69 
 
 		 377 aa  265  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0955  peptide chain release factor 1  41.05 
 
 		 361 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0150049  normal  0.0330786 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0918  peptide chain release factor 1  41.05 
 
 		 361 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.629192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7604  peptide chain release factor 1  41.56 
 
 		 361 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111197 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1036  peptide chain release factor 1  42.86 
 
 		 357 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.125967  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0980  peptide chain release factor 1  41.55 
 
 		 356 aa  260  2e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000659041  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  45.27 
 
 		 355 aa  260  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1564  peptide chain release factor 1  41.62 
 
 		 360 aa  259  4e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370048 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1044  peptide chain release factor 1  44.16 
 
 		 364 aa  259  4e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2563  peptide chain release factor 1  41.98 
 
 		 362 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.273749  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  41.19 
 
 		 355 aa  259  6e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3816  peptide chain release factor 1  41.57 
 
 		 359 aa  258  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3524  peptide chain release factor 1  40.7 
 
 		 359 aa  259  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0894  peptide chain release factor 1  40.39 
 
 		 361 aa  259  8e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0894  peptide chain release factor 1  39.54 
 
 		 351 aa  258  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188141  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3955  peptide chain release factor 1  42.09 
 
 		 359 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2623  peptide chain release factor 1  42.43 
 
 		 360 aa  258  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2309  peptide chain release factor 1  40.48 
 
 		 358 aa  257  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.321803  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  39.07 
 
 		 357 aa  258  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0144  peptide chain release factor 1  44.27 
 
 		 363 aa  257  2e-67  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372762  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  40.45 
 
 		 355 aa  258  2e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  40.81 
 
 		 359 aa  258  2e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1733  peptide chain release factor 1  40.54 
 
 		 351 aa  257  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  40.53 
 
 		 367 aa  257  3e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  42.72 
 
 		 363 aa  257  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0075  peptide chain release factor 1  40.99 
 
 		 361 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439429  normal  0.176298 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0610  peptide chain release factor 1  41.43 
 
 		 361 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0905177  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0359  peptide chain release factor 1  41.12 
 
 		 359 aa  255  8e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0377  peptide chain release factor 1  40.9 
 
 		 358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117375  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  45.12 
 
 		 360 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  42.02 
 
 		 362 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  40.93 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41024  predicted protein  43.4 
 
 		 373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.129157 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  40.88 
 
 		 363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  41.57 
 
 		 363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4748  peptide chain release factor 1  40.51 
 
 		 359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.681376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2912  peptide chain release factor 1  40.25 
 
 		 361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107492  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0740  peptide chain release factor 1  42.11 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.759458  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0470  peptide chain release factor 1  40.92 
 
 		 361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.807242  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3169  peptide chain release factor 1  41.01 
 
 		 363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0797  peptide chain release factor 1  41.01 
 
 		 363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0297796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3614  peptide chain release factor 1  38.55 
 
 		 363 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000815596  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0097  peptide chain release factor 1  40.81 
 
 		 361 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.208503 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2502  peptide chain release factor 1  40.35 
 
 		 360 aa  253  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.135893 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0696  peptide chain release factor 1  38.83 
 
 		 363 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0264279  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3546  peptide chain release factor 1  38.83 
 
 		 363 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00646422  hitchhiker  0.0000410243 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1607  peptide chain release factor 1  41.27 
 
 		 363 aa  252  7e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.317089  normal  0.894834 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1113  peptide chain release factor 1  39.6 
 
 		 351 aa  252  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.0276117 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03462  mitochondrial translation release factor (RF-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05410)  37.29 
 
 		 418 aa  252  8.000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.232043  hitchhiker  0.0000000000484362 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  41.92 
 
 		 363 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0279  peptide chain release factor 1  41.59 
 
 		 347 aa  252  8.000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.156801  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3737  peptide chain release factor 1  38.55 
 
 		 363 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  43.61 
 
 		 359 aa  251  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4995  peptide chain release factor 1  40.71 
 
 		 357 aa  251  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  0.116267 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl634  peptide chain release factor 1  38.65 
 
 		 363 aa  251  1e-65  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2530  peptide chain release factor 1  41.19 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0340  peptide chain release factor 1  42.81 
 
 		 361 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0769  peptide chain release factor 1  40.69 
 
 		 363 aa  251  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.081149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3599  peptide chain release factor 1  44.13 
 
 		 362 aa  250  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3833  peptide chain release factor 1  40.51 
 
 		 363 aa  251  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0112  peptide chain release factor 1  40.23 
 
 		 359 aa  251  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1618  peptide chain release factor 1  43.46 
 
 		 355 aa  251  2e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  41.16 
 
 		 359 aa  250  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  40.87 
 
 		 361 aa  250  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  41.51 
 
 		 361 aa  250  3e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0836  peptide chain release factor 1  40.85 
 
 		 356 aa  250  3e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  41.16 
 
 		 359 aa  250  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  40.97 
 
 		 362 aa  250  3e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  40.97 
 
 		 362 aa  250  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  39.47 
 
 		 360 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  41.51 
 
 		 361 aa  250  3e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  39.47 
 
 		 360 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  42.21 
 
 		 360 aa  250  3e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1856  peptide chain release factor 1  42.11 
 
 		 361 aa  250  3e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227654  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  39.47 
 
 		 360 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1552  peptide chain release factor 1  38.86 
 
 		 351 aa  250  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00635005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  41.3 
 
 		 362 aa  250  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  45.72 
 
 		 360 aa  249  5e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1719  peptide chain release factor 1  42.41 
 
 		 355 aa  249  5e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0801  peptide chain release factor 1  39.32 
 
 		 363 aa  249  6e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00710906  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2907  peptide chain release factor 1  38.86 
 
 		 351 aa  249  6e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0597  peptide chain release factor 1  43.79 
 
 		 359 aa  249  6e-65  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.349785  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0015  peptide chain release factor 1  41.96 
 
 		 355 aa  249  6e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0775  peptide chain release factor 1  40.17 
 
 		 373 aa  249  7e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2714  peptide chain release factor 1  41.69 
 
 		 355 aa  249  7e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.64557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  41.38 
 
 		 361 aa  248  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  41.96 
 
 		 355 aa  248  1e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1966  peptide chain release factor 1  40.68 
 
 		 355 aa  248  1e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  39.12 
 
 		 360 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0941  peptide chain release factor 1  39.89 
 
 		 350 aa  248  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.301393 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1599  peptide chain release factor 1  40.68 
 
 		 355 aa  248  2e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  40.83 
 
 		 360 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  41.69 
 
 		 362 aa  247  2e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>