173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_57408 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_57408  predicted protein  100 
 
 		 211 aa  441  1e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.241449  normal  0.12604 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10348  RNA exonuclease Rex2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11820)  45.86 
 
 		 194 aa  171  6.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.111499 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0907  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  44.44 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.206307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2269  oligoribonuclease  45.86 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1083  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  42.37 
 
 		 212 aa  154  9e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00161655  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3716  oligoribonuclease  42.86 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.952269  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2680  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  44.13 
 
 		 198 aa  152  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0564  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  42.54 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.686303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1900  oligoribonuclease  39.27 
 
 		 216 aa  145  5e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1056  oligoribonuclease  42.94 
 
 		 208 aa  145  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0686541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7676  putative oligoribonuclease; K01175  42.94 
 
 		 200 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1466  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  41.24 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3335  oligoribonuclease  42.22 
 
 		 179 aa  143  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.475979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24870  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  40.11 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.82834 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5510  oligoribonuclease  40.68 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15717  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02760  oligoribonuclease, putative  48.65 
 
 		 184 aa  142  5e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09680  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  42.53 
 
 		 208 aa  141  6e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.508062  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1343  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  41.62 
 
 		 229 aa  141  8e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.801458  hitchhiker  0.000880887 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1782  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  40.11 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00227296  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1351  oligoribonuclease  41.81 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2185  oligoribonuclease  37.85 
 
 		 208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000203098 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2655  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  38.8 
 
 		 235 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.785262 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1126  oligoribonuclease  41.24 
 
 		 198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.499716  normal  0.391456 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28650  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  40.68 
 
 		 202 aa  138  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0552434 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2783  oligoribonuclease  42.54 
 
 		 181 aa  138  7e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5970  oligoribonuclease  41.11 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1017  oligoribonuclease  40.68 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4379  oligoribonuclease  40.88 
 
 		 181 aa  136  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2435  oligoribonuclease  39.55 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0500585  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2743  oligoribonuclease  42.86 
 
 		 181 aa  136  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000147297  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1040  oligoribonuclease  40.68 
 
 		 250 aa  135  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1649  oligoribonuclease  41.24 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.554791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1081  exonuclease  40.11 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0811  oligoribonuclease  40.45 
 
 		 193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0543642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2638  oligoribonuclease  40.11 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0115664  hitchhiker  0.0000000947663 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5181  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  39.66 
 
 		 187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2543  oligoribonuclease  36.41 
 
 		 214 aa  131  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00112  oligoribonuclease  41.21 
 
 		 181 aa  131  7.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2676  oligoribonuclease  40.88 
 
 		 181 aa  131  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3640  oligoribonuclease  39.55 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00635145  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3713  oligoribonuclease  39.55 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3645  oligoribonuclease  39.55 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002252  oligoribonuclease  40.66 
 
 		 181 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000410797  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1100  oligoribonuclease  39.55 
 
 		 184 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0275698  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  35.91 
 
 		 634 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04032  oligoribonuclease  40.44 
 
 		 181 aa  129  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000706599  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3828  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  40.44 
 
 		 181 aa  129  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000318857  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3753  oligoribonuclease  40.66 
 
 		 180 aa  129  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3848  oligoribonuclease  40.44 
 
 		 181 aa  129  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000498222  hitchhiker  0.0000133205 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4633  oligoribonuclease  40.44 
 
 		 181 aa  129  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387491  normal  0.0592166 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03994  hypothetical protein  40.44 
 
 		 181 aa  129  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000413347  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4694  oligoribonuclease  40.44 
 
 		 181 aa  129  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  4.76072e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4403  oligoribonuclease  40.44 
 
 		 181 aa  129  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000656326  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4719  oligoribonuclease  40.44 
 
 		 181 aa  129  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000375023  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2426  oligoribonuclease  38.86 
 
 		 190 aa  129  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4100  oligoribonuclease  35 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0350683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0633  oligoribonuclease  38.46 
 
 		 184 aa  128  6e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3808  oligoribonuclease  38.67 
 
 		 181 aa  128  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000372044  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3661  oligoribonuclease  38.67 
 
 		 181 aa  128  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474416  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5678  oligoribonuclease  40.44 
 
 		 181 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000295119  normal  0.99134 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0708  oligoribonuclease  38.67 
 
 		 181 aa  127  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.367398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0907  oligoribonuclease  38.5 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1254  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  37.85 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12533  oligoribonuclease  38.42 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601507 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1339  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  39.23 
 
 		 198 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0942  oligoribonuclease  37.17 
 
 		 219 aa  125  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.012478 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1270  oligoribonuclease  40.22 
 
 		 187 aa  126  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.768994  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3931  oligoribonuclease  40.66 
 
 		 180 aa  125  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0348  oligoribonuclease  39.78 
 
 		 181 aa  126  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000355346  unclonable  0.00000209228 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08840  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  37.5 
 
 		 223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0178877  normal  0.0713087 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1566  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  37.64 
 
 		 183 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0387  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  38.67 
 
 		 180 aa  125  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1425  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  38.3 
 
 		 191 aa  124  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2776  oligoribonuclease  39.89 
 
 		 180 aa  124  9e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0476  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  39.34 
 
 		 180 aa  124  9e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459407  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4628  oligoribonuclease  39.34 
 
 		 181 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4711  oligoribonuclease  39.34 
 
 		 181 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.036759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4768  oligoribonuclease  39.34 
 
 		 181 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.198283  normal  0.0613691 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4619  oligoribonuclease  39.34 
 
 		 181 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2012  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  38.07 
 
 		 194 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4747  oligoribonuclease  39.34 
 
 		 181 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00828868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2574  oligoribonuclease  37.5 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65410  oligoribonuclease  38.59 
 
 		 180 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0813  oligoribonuclease  37.95 
 
 		 219 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5680  oligoribonuclease  38.59 
 
 		 180 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0884  oligoribonuclease  37.44 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.373133 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0424  oligoribonuclease  37.1 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000286047  hitchhiker  0.000000586556 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4950  oligoribonuclease  40.45 
 
 		 178 aa  121  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1700  oligoribonuclease  39.13 
 
 		 187 aa  122  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.104292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0564  oligoribonuclease  40.45 
 
 		 178 aa  121  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1552  oligoribonuclease  39.33 
 
 		 195 aa  121  8e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000145931  normal  0.275073 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1734  oligoribonuclease  38.76 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0026371  normal  0.333729 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3481  oligoribonuclease  38.89 
 
 		 181 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122162  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1470  oligoribonuclease  39.13 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.255303 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0225  oligoribonuclease  37.08 
 
 		 183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0254555  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0592  oligoribonuclease  37.91 
 
 		 181 aa  119  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1847  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  36.52 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0353601 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00920  oligoribonuclease  38.2 
 
 		 194 aa  119  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0529998  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0559  oligoribonuclease  37.64 
 
 		 181 aa  119  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.143761  normal  0.198605 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3032  oligoribonuclease  38.76 
 
 		 181 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.102944  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>