More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42826 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42826  predicted protein  100 
 
 		 1192 aa  2466    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  32.2 
 
 		 605 aa  206  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  30.6 
 
 		 684 aa  206  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  29.16 
 
 		 682 aa  205  4e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  28.96 
 
 		 686 aa  204  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  28.82 
 
 		 694 aa  196  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0271  DNA primase  28.85 
 
 		 675 aa  194  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59752  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09191  DNA primase  29.53 
 
 		 677 aa  191  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09211  DNA primase  29.53 
 
 		 677 aa  191  7e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0860  DNA primase  29.41 
 
 		 677 aa  191  8e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262059  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  29.59 
 
 		 616 aa  188  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 604 aa  187  7e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  31.3 
 
 		 655 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  28.48 
 
 		 600 aa  184  7e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  27.63 
 
 		 539 aa  184  8.000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  29.04 
 
 		 640 aa  184  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  29.2 
 
 		 663 aa  183  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  28.57 
 
 		 646 aa  184  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  28.57 
 
 		 646 aa  184  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  29.41 
 
 		 664 aa  183  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10221  DNA primase  26.97 
 
 		 678 aa  181  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.081725  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  31.04 
 
 		 651 aa  181  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4297  DNA primase  31.18 
 
 		 640 aa  181  9e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  28.12 
 
 		 679 aa  181  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  29.38 
 
 		 627 aa  179  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  29.36 
 
 		 599 aa  179  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5107  DNA primase  29.3 
 
 		 634 aa  179  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  28.22 
 
 		 632 aa  179  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7022  DNA primase  31 
 
 		 700 aa  176  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210771  normal  0.1359 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  30.25 
 
 		 652 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  29.37 
 
 		 544 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  30.15 
 
 		 619 aa  176  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1464  DNA primase  33.03 
 
 		 639 aa  174  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  29.83 
 
 		 660 aa  173  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1824  DNA primase  28.04 
 
 		 690 aa  173  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.982037  normal  0.672025 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  28.06 
 
 		 675 aa  173  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  29.62 
 
 		 660 aa  173  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  28.66 
 
 		 601 aa  173  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  29.41 
 
 		 660 aa  172  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  28.91 
 
 		 595 aa  172  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  31.81 
 
 		 576 aa  172  5e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  29.41 
 
 		 660 aa  171  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  30.19 
 
 		 663 aa  171  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  30.43 
 
 		 703 aa  171  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0795  DNA primase  28.6 
 
 		 572 aa  171  7e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  28.91 
 
 		 595 aa  171  8e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  29.98 
 
 		 593 aa  171  8e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  30.61 
 
 		 614 aa  171  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  29.51 
 
 		 614 aa  170  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  29.08 
 
 		 617 aa  169  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  28.75 
 
 		 587 aa  169  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  28.49 
 
 		 588 aa  169  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2703  DNA primase  30.73 
 
 		 666 aa  168  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1275  DNA primase  26.72 
 
 		 629 aa  168  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  27.47 
 
 		 599 aa  167  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  27.37 
 
 		 616 aa  167  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  29.83 
 
 		 638 aa  167  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  28.6 
 
 		 636 aa  166  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  29.13 
 
 		 581 aa  167  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  29.13 
 
 		 581 aa  167  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  31.58 
 
 		 587 aa  166  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  29.13 
 
 		 581 aa  167  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1531  DNA primase  30.92 
 
 		 535 aa  166  2.0000000000000002e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  29.13 
 
 		 581 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  29.13 
 
 		 581 aa  167  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1480  DNA primase  30.45 
 
 		 655 aa  166  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  30.26 
 
 		 613 aa  166  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  29.5 
 
 		 571 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3686  DNA primase  26.81 
 
 		 636 aa  166  4.0000000000000004e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1374  DNA primase  28.41 
 
 		 644 aa  165  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000143214 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  28.02 
 
 		 573 aa  165  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  29.66 
 
 		 581 aa  165  6e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  29.66 
 
 		 581 aa  165  6e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  29.84 
 
 		 587 aa  165  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  29.66 
 
 		 581 aa  165  6e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  28.46 
 
 		 605 aa  165  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  28.84 
 
 		 582 aa  165  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  29.66 
 
 		 581 aa  165  6e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  28.84 
 
 		 582 aa  165  6e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  29.66 
 
 		 581 aa  165  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  29.66 
 
 		 581 aa  165  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  28.84 
 
 		 582 aa  165  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  28.51 
 
 		 673 aa  164  1e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13800  DNA primase  27.17 
 
 		 657 aa  164  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0288236  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  28.21 
 
 		 652 aa  164  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2227  DNA primase  33.25 
 
 		 671 aa  164  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.914663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1978  DNA primase  27.31 
 
 		 552 aa  164  1e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1497  DNA primase  27.58 
 
 		 595 aa  164  1e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1686  DNA primase  30.18 
 
 		 656 aa  163  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481097  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  27.48 
 
 		 656 aa  163  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1436  DNA primase  29.89 
 
 		 681 aa  163  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09401  DNA primase  28.7 
 
 		 625 aa  163  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.029627  normal  0.0569121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2962  DNA primase  30.48 
 
 		 669 aa  163  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.137864 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  29.8 
 
 		 581 aa  163  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  28.51 
 
 		 564 aa  163  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  28.42 
 
 		 582 aa  163  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1932  DNA primase  30.94 
 
 		 648 aa  162  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0456378  hitchhiker  0.00240757 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  30.67 
 
 		 581 aa  162  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  30.67 
 
 		 581 aa  162  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  28.76 
 
 		 609 aa  162  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>