More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_41686 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_41686  predicted protein  100 
 
 
430 aa  901    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8945  aminotransferase  66.02 
 
 
412 aa  586  1e-166  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0358  hypothetical protein  36.69 
 
 
464 aa  262  8.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.175668 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1823  hypothetical protein  34.98 
 
 
464 aa  260  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440887  normal  0.352314 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0357  hypothetical protein  35.89 
 
 
459 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0347  hypothetical protein  35.89 
 
 
459 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0336  hypothetical protein  35.89 
 
 
459 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3118  hypothetical protein  37.53 
 
 
437 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0447  aminotransferase class-III  36.18 
 
 
461 aa  248  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4627  hypothetical protein  33.98 
 
 
435 aa  247  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0272  aminotransferase class-III  36.02 
 
 
462 aa  246  6e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5776  hypothetical protein  34.62 
 
 
484 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.246423 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1870  aminotransferase class-III  35.31 
 
 
444 aa  242  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1120  aminotransferase class-III  35.68 
 
 
446 aa  239  5e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.020832  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3751  aminotransferase class-III  34.91 
 
 
448 aa  237  3e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0034  hypothetical protein  34.21 
 
 
441 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2960  aminotransferase class-III  35.28 
 
 
457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0599689  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1055  hypothetical protein  34.15 
 
 
463 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5722  hypothetical protein  34.11 
 
 
446 aa  234  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24140  aminotransferase  34.69 
 
 
453 aa  229  8e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0158  hypothetical protein  34.31 
 
 
438 aa  228  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3443  aminotransferase class-III  31.52 
 
 
450 aa  227  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000605746  normal  0.17806 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00920  aminotransferase  34.12 
 
 
463 aa  221  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1438  aminotransferase class-III  33.81 
 
 
444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.662958  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1417  4-aminobutyrate aminotransferase  34.35 
 
 
441 aa  220  3e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2572  hypothetical protein  33.16 
 
 
437 aa  218  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0532  aminotransferase class-III  31.19 
 
 
444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410218  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1430  hypothetical protein  33.81 
 
 
448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6399  hypothetical protein  33.81 
 
 
448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755332  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  34.11 
 
 
450 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0841  aminotransferase class-III  32.67 
 
 
440 aa  205  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0797  aminotransferase class-III  32.63 
 
 
461 aa  203  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.277612 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4062  aminotransferase class-III  32.85 
 
 
443 aa  202  8e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  34.29 
 
 
450 aa  202  8e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2523  aminotransferase class-III  33.81 
 
 
443 aa  202  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  35.12 
 
 
457 aa  201  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2835  hypothetical protein  31.9 
 
 
467 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.561415  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  31.35 
 
 
451 aa  196  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  33.33 
 
 
470 aa  192  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3177  hypothetical protein  30.9 
 
 
467 aa  192  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.060239  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3534  hypothetical protein  30.9 
 
 
467 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.631271  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  30.65 
 
 
448 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  30.65 
 
 
448 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  30.65 
 
 
448 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  33.89 
 
 
449 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  32.21 
 
 
452 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  31.26 
 
 
457 aa  189  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  32.5 
 
 
457 aa  188  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1249  aminotransferase class-III  31.59 
 
 
456 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  33.91 
 
 
456 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  33.91 
 
 
456 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  31.94 
 
 
459 aa  188  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2911  hypothetical protein  30.7 
 
 
454 aa  187  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  34.24 
 
 
455 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  31.34 
 
 
460 aa  187  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  31.65 
 
 
453 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  31.89 
 
 
455 aa  186  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  32.87 
 
 
465 aa  186  6e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  30.5 
 
 
467 aa  186  8e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3738  aminotransferase  31.42 
 
 
461 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  32.87 
 
 
458 aa  185  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  32.23 
 
 
471 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  31.73 
 
 
452 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  31.64 
 
 
456 aa  185  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  32.13 
 
 
454 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  33.17 
 
 
464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  31.25 
 
 
455 aa  184  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  31.65 
 
 
457 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  31.46 
 
 
463 aa  184  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  31.73 
 
 
452 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  33.08 
 
 
454 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  31.92 
 
 
458 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  31.14 
 
 
463 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  31.65 
 
 
453 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  30.66 
 
 
460 aa  183  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  31.65 
 
 
453 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2025  aminotransferase, class III  29.82 
 
 
450 aa  183  7e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  31.92 
 
 
463 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5114  aminotransferase class-III  29.62 
 
 
436 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  29.6 
 
 
456 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  29.56 
 
 
460 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  31.54 
 
 
466 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0161  hypothetical protein  29.56 
 
 
442 aa  181  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  31.75 
 
 
459 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  31.65 
 
 
453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  30.37 
 
 
468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  30.17 
 
 
459 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  30.99 
 
 
485 aa  180  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3984  aminotransferase class-III  30.72 
 
 
453 aa  180  5.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.319262  normal  0.720199 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  30.48 
 
 
466 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0398  hypothetical protein  29.61 
 
 
441 aa  179  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3065  hypothetical protein  31.93 
 
 
459 aa  179  8e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0833151  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  29.33 
 
 
460 aa  179  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  29.36 
 
 
457 aa  179  9e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2033  aminotransferase class-III  30.39 
 
 
455 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0379  aminotransferase  30.63 
 
 
455 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.996959  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0857  aminotransferase class-III  29.93 
 
 
455 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0851  hypothetical protein  31.6 
 
 
460 aa  179  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718133  normal  0.0976867 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1524  aminotransferase  31.89 
 
 
450 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.642809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1704  aminotransferase  31.81 
 
 
450 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>