More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_35766 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06330  elongation factor 2 (Eurofung)  61.34 
 
 		 844 aa  1072    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66828  Elongation factor  61.12 
 
 		 842 aa  1056    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND06220  translation elongation factor 2  62 
 
 		 826 aa  1064    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52010  predicted protein  59.26 
 
 		 848 aa  1015    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0299674  hitchhiker  0.00863878 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35766  predicted protein  100 
 
 		 828 aa  1721    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.412602  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35547  predicted protein  35.84 
 
 		 974 aa  556  1e-157  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.531902 
 
 
-
 
NC_006686  CND02170  116 kda u5 small nuclear ribonucleoprotein component, putative  36.76 
 
 		 994 aa  555  1e-156  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01408  hypothetical U5 snRNP component (Eurofung)  34.23 
 
 		 985 aa  531  1e-149  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0125227 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45319  predicted protein  34.47 
 
 		 1013 aa  511  1e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678444  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0084  elongation factor EF-2  35.06 
 
 		 736 aa  478  1e-133  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000102607 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1785  translation elongation factor aEF-2  34.81 
 
 		 736 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0976726  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0613  elongation factor EF-2  35.31 
 
 		 734 aa  472  1.0000000000000001e-131  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.472828  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0748  elongation factor EF-2  34.42 
 
 		 730 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.259195 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0072  translation elongation factor aEF-2  34.75 
 
 		 734 aa  437  1e-121  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000119399  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36041  ATP dependent RNA helicase and U5 mRNA splicing factor  29.87 
 
 		 978 aa  425  1e-117  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.556904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1090  elongation factor EF-2  34.92 
 
 		 740 aa  420  1e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0970791  hitchhiker  0.00132795 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_438  predicted protein  32.21 
 
 		 1001 aa  419  9.999999999999999e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1957  elongation factor EF-2  35.04 
 
 		 740 aa  414  1e-114  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  7.15133e-18 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2139  elongation factor EF-2  34.76 
 
 		 740 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2168  translation elongation factor aEF-2  33.25 
 
 		 728 aa  405  1e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1613  elongation factor EF-2  33.98 
 
 		 732 aa  403  1e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.502666 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0938  elongation factor EF-2  33.49 
 
 		 740 aa  400  9.999999999999999e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0213  elongation factor EF-2  34.43 
 
 		 740 aa  402  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.551385 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0783  elongation factor EF-2  33.21 
 
 		 727 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0366  translation elongation factor aEF-2  33.13 
 
 		 728 aa  392  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2874  elongation factor EF-2  32.28 
 
 		 729 aa  392  1e-107  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2828  elongation factor EF-2  32.53 
 
 		 731 aa  381  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0263  elongation factor EF-2  32.69 
 
 		 731 aa  380  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0279  elongation factor EF-2  36.03 
 
 		 730 aa  317  6e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0211327  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0820  elongation factor EF-2  36.71 
 
 		 730 aa  315  2.9999999999999996e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2205  elongation factor EF-2  37.24 
 
 		 730 aa  312  2e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.909125  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1171  elongation factor EF-2  33.46 
 
 		 730 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.368378  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3686  elongation factor EF-2  33.07 
 
 		 730 aa  268  4e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.913887  normal  0.280674 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0614  elongation factor EF-2  32.16 
 
 		 727 aa  257  6e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0209  elongation factor EF-2  32.09 
 
 		 727 aa  257  7e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0679  elongation factor EF-2  32.02 
 
 		 727 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1304  elongation factor EF-2  31.77 
 
 		 727 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0152  elongation factor EF-2  31.35 
 
 		 729 aa  250  6e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36549  Translation elongation factor 2/ribosome biogenesis protein RIA1 and related proteins  34.86 
 
 		 1035 aa  238  5.0000000000000005e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.346459  decreased coverage  0.00970244 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0504  elongation factor EF-2  30.65 
 
 		 729 aa  236  1.0000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.505462  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00330  translation elongation factor 2, putative  33.73 
 
 		 1115 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20188  predicted protein  29.73 
 
 		 693 aa  221  3.9999999999999997e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.248743  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0246  elongation factor G  28.12 
 
 		 695 aa  220  7.999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  28.41 
 
 		 692 aa  211  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  26.87 
 
 		 695 aa  209  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  26.67 
 
 		 703 aa  207  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0189  elongation factor G  27.44 
 
 		 703 aa  205  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0612  elongation factor G  26.82 
 
 		 688 aa  204  4e-51  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  27.78 
 
 		 692 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  26.66 
 
 		 697 aa  200  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  26.81 
 
 		 692 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  26.28 
 
 		 692 aa  198  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  26.7 
 
 		 689 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  27.51 
 
 		 692 aa  196  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_002950  PG1940  elongation factor G  27.05 
 
 		 707 aa  195  3e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  27.99 
 
 		 692 aa  194  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0716  translation elongation factor G  27.65 
 
 		 701 aa  194  7e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000130254  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5121  translation elongation factor G  25.62 
 
 		 704 aa  194  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.63953 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  27.53 
 
 		 692 aa  193  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  27.65 
 
 		 692 aa  192  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  27.74 
 
 		 692 aa  191  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  27.74 
 
 		 692 aa  191  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  27.74 
 
 		 692 aa  191  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  27.74 
 
 		 692 aa  191  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1014  elongation factor G  25.92 
 
 		 701 aa  191  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.203543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0986  elongation factor G  25.92 
 
 		 701 aa  191  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.798274  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0303  elongation factor G  26.79 
 
 		 700 aa  191  4e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383958 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1004  elongation factor G  25.92 
 
 		 701 aa  191  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.994777  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  27.62 
 
 		 692 aa  190  9e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1612  translation elongation factor G  27.14 
 
 		 715 aa  189  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3385  elongation factor G  26.23 
 
 		 703 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  26.35 
 
 		 693 aa  188  3e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1753  elongation factor G  26.13 
 
 		 703 aa  188  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.751097  normal  0.0412886 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5076  elongation factor G  25.61 
 
 		 700 aa  189  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf312  elongation factor G  26.58 
 
 		 697 aa  189  3e-46  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0497538  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4279  translation elongation factor G  27.4 
 
 		 697 aa  187  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000062878  unclonable  0.0000000000098696 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3146  translation elongation factor G  26.4 
 
 		 704 aa  187  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1617  translation elongation factor G  26.27 
 
 		 680 aa  187  6e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109921  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0125  elongation factor G  26.07 
 
 		 709 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  26.12 
 
 		 692 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0357  elongation factor G  27.5 
 
 		 696 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4111  elongation factor G  26.38 
 
 		 703 aa  185  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3684  elongation factor G  27.16 
 
 		 706 aa  185  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312611  hitchhiker  0.00286415 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  26.33 
 
 		 691 aa  185  3e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0584  translation elongation factor G  25.82 
 
 		 699 aa  185  4.0000000000000006e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19852  normal  0.151402 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0624  translation elongation factor G  26.52 
 
 		 705 aa  184  7e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0285  elongation factor G  24.72 
 
 		 683 aa  184  7e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  26.33 
 
 		 691 aa  182  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3467  translation elongation factor G  26.24 
 
 		 701 aa  182  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0283568  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  26.58 
 
 		 698 aa  181  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2821  elongation factor G  26.28 
 
 		 697 aa  181  7e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.114421 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1182  translation elongation factor G  25.45 
 
 		 699 aa  181  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566824  normal  0.0924393 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1337  translation elongation factor G  25.94 
 
 		 700 aa  180  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  27.72 
 
 		 692 aa  179  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4287  elongation factor G  26.44 
 
 		 704 aa  179  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  25 
 
 		 692 aa  178  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  25.86 
 
 		 691 aa  177  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0853  elongation factor G  25.85 
 
 		 707 aa  177  6e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.367581  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0663  elongation factor G  27.59 
 
 		 694 aa  177  6e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000168111  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0695  elongation factor G  27.59 
 
 		 694 aa  177  6e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000135868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>