52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_19025 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_19025  predicted protein  100 
 
 		 205 aa  421  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85470  predicted protein  50 
 
 		 191 aa  189  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.210117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45591  Ribosomal protein L9, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  53.12 
 
 		 191 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0366824  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00250  60s ribosomal protein l9, putative  44.72 
 
 		 191 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09465  60S ribosomal protein L9, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09100)  44.12 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.450894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1712  ribosomal protein L6  40.31 
 
 		 176 aa  126  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020525  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0458  50S ribosomal protein L6P  39.38 
 
 		 176 aa  125  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0268307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2237  50S ribosomal protein L6P  36.9 
 
 		 176 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000185455  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0548  50S ribosomal protein L6P  39.06 
 
 		 174 aa  122  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.329279  normal  0.17602 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0580  50S ribosomal protein L6P  36.13 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.141728  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0163  50S ribosomal protein L6P  35.75 
 
 		 182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00284437  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0660  50S ribosomal protein L6P  35.23 
 
 		 182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.238102  hitchhiker  0.000992525 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1762  ribosomal protein L6P  33.84 
 
 		 181 aa  114  8.999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.34503  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1258  50S ribosomal protein L6P  35.75 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.032606  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0608  ribosomal protein L6  32.35 
 
 		 191 aa  112  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00292124  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0726  50S ribosomal protein L6P  36.27 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.542747  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0226  ribosomal protein L6P  39.47 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0855462  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2234  ribosomal protein L6P  38.1 
 
 		 177 aa  108  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1400  50S ribosomal protein L6P  41.73 
 
 		 183 aa  107  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0017  50S ribosomal protein L6P  35.64 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  4.87132e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0094  50S ribosomal protein L6P  34.9 
 
 		 177 aa  104  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000167517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0097  50S ribosomal protein L6P  32.62 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1844  50S ribosomal protein L6P  33.33 
 
 		 178 aa  103  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1505  ribosomal protein L6P  29.9 
 
 		 178 aa  101  6e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.66484e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0107  50S ribosomal protein L6P  35.82 
 
 		 181 aa  100  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000249213  unclonable  0.000000420842 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2433  50S ribosomal protein L6P  34.55 
 
 		 177 aa  99.8  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1837  50S ribosomal protein L6P  34.16 
 
 		 195 aa  94.7  8e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2308  50S ribosomal protein L6P  29.53 
 
 		 178 aa  90.5  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0794  50S ribosomal protein L6  30.65 
 
 		 185 aa  89  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.284303 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1705  50S ribosomal protein L6P  30.77 
 
 		 196 aa  87.8  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0210193 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1514  50S ribosomal protein L6P  28.37 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.51305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1576  50S ribosomal protein L6P  29.19 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000756586 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0608  50S ribosomal protein L6P  28.57 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000239568 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  24.56 
 
 		 177 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  23.98 
 
 		 177 aa  49.3  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1307  50S ribosomal protein L6  29.78 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236844  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1379  50S ribosomal protein L6  29.78 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  27.33 
 
 		 177 aa  45.1  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1851  ribosomal protein L6  28.9 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.56126e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0441  50S ribosomal protein L6  25.15 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296356  hitchhiker  0.000109216 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0968  50S ribosomal protein L6  32.69 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.569336  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0928  50S ribosomal protein L6  24.55 
 
 		 179 aa  42.7  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000870536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  27.65 
 
 		 178 aa  42.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  22.8 
 
 		 177 aa  42.7  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0065  50S ribosomal protein L6  27.11 
 
 		 177 aa  42.4  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000654167  hitchhiker  0.0000000000000139653 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  28.19 
 
 		 179 aa  42  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  24.56 
 
 		 177 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0199  50S ribosomal protein L6  26.9 
 
 		 176 aa  42  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586968  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  33.66 
 
 		 180 aa  41.6  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0068  50S ribosomal protein L6  26.51 
 
 		 177 aa  41.6  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00100116  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  22.81 
 
 		 177 aa  41.2  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  27.18 
 
 		 177 aa  41.2  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>