More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1687 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1687  HIT family protein  100 
 
 		 129 aa  265  1e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3809  histidine triad (HIT) protein  58.59 
 
 		 133 aa  170  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.197548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1241  histidine triad (HIT) protein  55.04 
 
 		 131 aa  158  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1632  HIT family protein  55.2 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0437202  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0302  histidine triad (HIT) protein  52.71 
 
 		 128 aa  150  4e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4584  histidine triad (HIT) protein  53.97 
 
 		 129 aa  147  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000842385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1055  histidine triad (HIT) protein  58.73 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01700  HIT family protein  50 
 
 		 129 aa  141  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127711  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1591  histidine triad (HIT) protein  49.21 
 
 		 129 aa  140  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0732  hypothetical protein  50.4 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3302  HIT family protein  51.56 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2900  histidine triad (HIT) protein  51.56 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.276504  normal  0.0712491 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10774  hypothetical protein  41.09 
 
 		 133 aa  105  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3629  histidine triad (HIT) protein  40.62 
 
 		 133 aa  104  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3102  histidine triad (HIT) protein  42.19 
 
 		 131 aa  103  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.550311  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1583  histidine triad (HIT) protein  39.84 
 
 		 134 aa  100  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5173  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 		 138 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707443 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0826  histidine triad (HIT) protein  40.62 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15219  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4588  histidine triad (HIT) protein  38.28 
 
 		 138 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4676  histidine triad (HIT) protein  38.28 
 
 		 138 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0370318  normal  0.851631 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4971  histidine triad (HIT) protein  38.28 
 
 		 138 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1815  histidine triad (HIT) protein  38.28 
 
 		 136 aa  96.7  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0400003  normal  0.0526222 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2413  histidine triad (HIT) protein  36.72 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0135198 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2633  histidine triad (HIT) protein  39.84 
 
 		 142 aa  93.6  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00206121  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07820  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  41.07 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2368  histidine triad (HIT) protein  38.4 
 
 		 142 aa  90.9  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014225 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1701  histidine triad (HIT) protein  35.94 
 
 		 143 aa  90.1  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  37.12 
 
 		 139 aa  86.7  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  39.1 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0519  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  44.66 
 
 		 117 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0832  histidine triad (HIT) protein  43.16 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1228  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  41.07 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0892724  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2416  histidine triad (HIT) protein  41.35 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0525465  normal  0.0378675 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  34.81 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  39.85 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2807  histidine triad (HIT) protein  39.62 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  40.74 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4476  putative histidine triad (HIT) protein  34.59 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000626279 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0746  histidine triad (HIT) protein  34.59 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337572 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  36.28 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  34.59 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  41.75 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4702  histidine triad (HIT) protein  33.83 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557305 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3968  histidine triad (HIT) protein  33.59 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  38.24 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1970  histidine triad (HIT) protein  35.51 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.939838  hitchhiker  0.0000383714 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  34.09 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  35.46 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03708  HIT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12680)  37.01 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.117728  normal  0.7439 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0579  histidine triad domain-containing protein  33.33 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0235717  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2405  histidine triad (HIT) protein  35.51 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112602  normal  0.457991 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  37.38 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  35.11 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3549  histidine triad (HIT) protein  39.6 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  35.34 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0494  putative HIT-like protein  32.33 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  34.35 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  36.44 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  36.44 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3753  histidine triad (HIT) protein  35.24 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1275  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  39.22 
 
 		 139 aa  72  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0952  histidine triad (HIT) protein  38.61 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117681  hitchhiker  0.00115812 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0207  HIT family protein  33.33 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0238  HIT family protein  33.33 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2559  HIT family protein  33.33 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0979  HIT family protein  33.33 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4709  histidine triad (HIT) protein  39.22 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3316  histidine triad (HIT) protein  38.32 
 
 		 142 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2451  histidine triad (HIT) protein  38.1 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94056  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0211  histidine triad (HIT) protein  32.85 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1382  HIT family protein  33.33 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2703  HIT family protein  33.33 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  37.68 
 
 		 142 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1579  HIT family protein  33.33 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380866  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1302  histidine triad (HIT) protein  34.59 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  32.09 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  32.09 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0492  HIT family protein  33.33 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1574  histidine triad (HIT) protein  35.56 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.650242  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2290  histidine triad (HIT) protein  35.34 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  35.29 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  31.25 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  38.89 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3416  histidine triad  35.58 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.621229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3517  hypothetical protein  35.58 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.810284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3351  histidine triad  35.58 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3422  histidine triad  35.58 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  37.69 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2926  histidine triad (HIT) protein  34.35 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1255  HIT family protein  41.58 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  33.33 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  31.4 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  33.33 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  35.61 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1076  histidine triad (HIT) protein  35.34 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3327  histidine triad (HIT) protein  31.01 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.036152 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  34.33 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1771  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  32.84 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1292  histidine triad (HIT) protein  35.58 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268815  normal  0.885199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>