More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1034 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1034  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 244 aa  505  9.999999999999999e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000170601 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1498  ABC transporter related  58.26 
 
 		 256 aa  295  5e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1212  ABC transporter related  59.41 
 
 		 267 aa  293  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00512006  hitchhiker  0.000000000503976 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0450  ABC transporter related  55.37 
 
 		 254 aa  285  2.9999999999999996e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07670  ABC transporter, ATP-binding protein  53.31 
 
 		 254 aa  285  5.999999999999999e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0821592  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3462  ABC transporter related  56.9 
 
 		 250 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0534254 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2195  ABC transporter, ATP-binding protein  54.96 
 
 		 248 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00836348 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1029  hypothetical protein  54.55 
 
 		 250 aa  278  7e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5159  ABC transporter related protein  55.37 
 
 		 248 aa  277  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364497 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  52.89 
 
 		 248 aa  271  7e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  45.08 
 
 		 252 aa  214  9e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  42.86 
 
 		 249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  42.08 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  42.8 
 
 		 248 aa  191  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  41.91 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  42.68 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  42.19 
 
 		 268 aa  186  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  43.22 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  43.1 
 
 		 245 aa  185  6e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  41.56 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  41.56 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  42.68 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  41.35 
 
 		 260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  41.08 
 
 		 255 aa  182  6e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  41.38 
 
 		 256 aa  181  9.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0535  ABC transporter related  39.24 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  40.08 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3691  ABC transporter related  40.91 
 
 		 245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.896312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1495  ABC transporter related  43.04 
 
 		 267 aa  178  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00076856  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  39.24 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  39.84 
 
 		 263 aa  175  7e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  43.98 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0160  ABC transporter related  41.2 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.609677 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  38.14 
 
 		 296 aa  172  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  38.4 
 
 		 273 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0441  ATPase  37.96 
 
 		 244 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  38.4 
 
 		 248 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  40.42 
 
 		 261 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3315  ABC transporter related  37.55 
 
 		 258 aa  171  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000690504 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  43.72 
 
 		 344 aa  171  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  38.82 
 
 		 273 aa  171  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  37.97 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3986  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.33 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  39.83 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  37.97 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1487  ABC transporter related  41.7 
 
 		 340 aa  170  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000017469  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  39.41 
 
 		 258 aa  169  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  36.51 
 
 		 279 aa  169  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1712  ABC transporter-related protein  38.89 
 
 		 252 aa  169  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000576973 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  37.97 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  37.97 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  37.97 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  37.97 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1395  ABC transporter related  39.63 
 
 		 337 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1695  ABC transporter related  37.14 
 
 		 244 aa  169  5e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  37.97 
 
 		 273 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  37.55 
 
 		 272 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  39.67 
 
 		 255 aa  168  6e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0967  ABC transporter ATP-binding protein  37.97 
 
 		 322 aa  168  6e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  37.55 
 
 		 273 aa  168  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2909  ABC transporter component  43.19 
 
 		 277 aa  168  7e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3403  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  42.2 
 
 		 343 aa  168  8e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000150207  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00198  DL-methionine transporter subunit  41.74 
 
 		 343 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000236  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0210  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.74 
 
 		 343 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000485974  normal  0.606224 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0193  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.74 
 
 		 343 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000317621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0206  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.74 
 
 		 343 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462586  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1342  ABC transporter related  37.5 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0588086  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3137  ABC transporter, ATPase subunit  38.66 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.297163  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  40.25 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0211  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.74 
 
 		 343 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000167757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  37.04 
 
 		 283 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0203  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.74 
 
 		 343 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442829  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3460  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.74 
 
 		 343 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00197  hypothetical protein  41.74 
 
 		 343 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000135351  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.74 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255507  hitchhiker  0.00172815 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2336  ABC transporter-like  39.15 
 
 		 266 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2298  ATPase  37.55 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102276  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  38.94 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3791  ABC transporter related  38.84 
 
 		 377 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1057  ABC transporter related  38.89 
 
 		 298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.184914  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1533  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  39.66 
 
 		 345 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0757943  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25830  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  39.57 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  38.86 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3768  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.01 
 
 		 331 aa  166  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2673  ABC transporter-like  38.06 
 
 		 260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1229  ABC transporter related  41.36 
 
 		 264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.380088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  37.24 
 
 		 271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2019  ABC transporter related  39.91 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000471026 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2536  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.74 
 
 		 352 aa  165  8e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0300192  normal  0.239692 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  39 
 
 		 256 aa  164  8e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0189  ABC transporter related  36.25 
 
 		 254 aa  164  8e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0746681  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0847  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  40.64 
 
 		 343 aa  164  9e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3228  ABC transporter, ATP-binding protein  37.77 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2726  ABC transporter, ATP-binding protein  37.77 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3704  putative ABC transporter ATP-binding subunit  37.77 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0644  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3677  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  37.77 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0124064  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2636  ABC transporter related  39.37 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3884  ABC transporter-related protein  40.19 
 
 		 351 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2776  ABC transporter, ATP-binding protein  37.77 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.849481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>