More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_25830 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_25830  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  100 
 
 
264 aa  543  1e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  59.92 
 
 
344 aa  305  6e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1487  ABC transporter related  59.09 
 
 
340 aa  281  5.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000017469  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1503  ABC transporter related protein  53.57 
 
 
350 aa  276  3e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  58.09 
 
 
340 aa  274  9e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1557  ABC transporter related protein  53.09 
 
 
273 aa  270  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2430  hypothetical protein  56.2 
 
 
345 aa  267  1e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0121441  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  53.53 
 
 
339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4962  ABC transporter, ATP-binding protein  53.11 
 
 
339 aa  264  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  53.94 
 
 
342 aa  264  8.999999999999999e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23470  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  54.69 
 
 
349 aa  263  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00129815  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0236  ABC transporter-like  55.04 
 
 
374 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127209  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  52.28 
 
 
339 aa  262  4e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004238  methionine ABC transporter ATP-binding protein  52.82 
 
 
344 aa  262  4.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  53.11 
 
 
339 aa  261  8e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01202  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.82 
 
 
344 aa  261  8e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  53.11 
 
 
339 aa  260  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  52.55 
 
 
342 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  53.11 
 
 
339 aa  260  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0250  ABC transporter related protein  52.24 
 
 
400 aa  261  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  53.11 
 
 
339 aa  260  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  52.7 
 
 
339 aa  259  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  53.98 
 
 
339 aa  259  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  52.7 
 
 
339 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1230  ABC transporter related  50.38 
 
 
347 aa  259  4e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5188  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  52.82 
 
 
343 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  52.28 
 
 
339 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3582  ABC transporter-related protein  53.53 
 
 
341 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0126168  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5129  ABC transporter, ATP-binding protein  53.53 
 
 
397 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5125  ABC transporter, ATP-binding protein  53.11 
 
 
341 aa  257  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000057454  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4696  ABC transporter, ATP-binding protein  52.7 
 
 
341 aa  256  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000324387  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4809  ABC transporter related  52.7 
 
 
341 aa  257  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00917748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5092  ABC transporter, ATP-binding protein  52.7 
 
 
341 aa  256  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0111  ABC transporter, ATP-binding protein  53.11 
 
 
341 aa  256  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000413393  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3538  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.87 
 
 
344 aa  256  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0233022 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4711  ABC transporter, ATP-binding protein  52.7 
 
 
341 aa  255  4e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00233149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4855  ABC transporter ATP-binding protein  52.7 
 
 
341 aa  255  5e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248065  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22300  ABC transporter related  54.46 
 
 
352 aa  255  5e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.321678  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5222  ABC transporter ATP-binding protein  52.7 
 
 
341 aa  255  5e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0353533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5127  ABC transporter, ATP-binding protein  52.7 
 
 
341 aa  255  5e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000360492  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2365  ABC transporter related  54.67 
 
 
365 aa  255  5e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0817479  hitchhiker  0.00312127 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0785  ABC transporter related  48.65 
 
 
425 aa  254  8e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0429  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.21 
 
 
344 aa  254  8e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1908  ABC transporter-like protein  52.99 
 
 
318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.103908 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3029  ABC transporter related  52.23 
 
 
394 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193089  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5337  ABC transporter related  52.23 
 
 
394 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874002  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3248  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  51.04 
 
 
320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31520  ABC transporter, ATP-binding component  52.61 
 
 
385 aa  253  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4931  ABC transporter related  52.23 
 
 
392 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247063  normal  0.893842 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5160  ABC transporter related  50.2 
 
 
388 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2419  ABC transporter component  50.2 
 
 
258 aa  253  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4992  ABC transporter related  53.36 
 
 
369 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0244  ABC transporter related  53.36 
 
 
369 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177795  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0350  ABC transporter  50.81 
 
 
376 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100794  normal  0.782008 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0886  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.21 
 
 
344 aa  251  7e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0853  ABC methionine transporter, ATPase subunit  49.59 
 
 
386 aa  251  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00389788  hitchhiker  0.00726443 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4225  ABC transporter related  54.46 
 
 
384 aa  251  7e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00831393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0220  ABC transporter ATP-binding protein  52.52 
 
 
369 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.333916  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4539  ABC transporter related  50 
 
 
386 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.342354  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1145  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.24 
 
 
377 aa  250  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3393  ABC transporter related  51.63 
 
 
391 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.671185  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0235  ABC transporter related  52.52 
 
 
369 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3768  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.94 
 
 
331 aa  249  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0311  ABC metal ion transporter, ATPase subunit  52.07 
 
 
398 aa  249  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2123  ABC transporter related protein  50.41 
 
 
337 aa  249  4e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0097  ABC transporter, ATP-binding protein  46.36 
 
 
341 aa  248  6e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2457  ABC transporter related  50.2 
 
 
368 aa  248  6e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2630  ABC transporter related  52.28 
 
 
263 aa  248  7e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4335  ABC transporter related  52.67 
 
 
365 aa  248  8e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2100  ABC transporter related  49.21 
 
 
347 aa  248  8e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2301  ABC transporter related  50.2 
 
 
392 aa  248  9e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34270  putative ATP-binding component of ABC transporter  52.14 
 
 
369 aa  247  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850133 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0489  ABC transporter, ATP-binding protein  52.63 
 
 
341 aa  247  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2604  ABC transporter related  50.78 
 
 
354 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0166  ABC transporter, ATP-binding protein  47.69 
 
 
346 aa  246  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.766032  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.99 
 
 
343 aa  246  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5216  ABC transporter related  52.34 
 
 
391 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.329969 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1533  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.79 
 
 
345 aa  246  2e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0757943  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0198  ABC transporter, ATP-binding protein  49.59 
 
 
346 aa  247  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00198  DL-methionine transporter subunit  49.38 
 
 
343 aa  246  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000236  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3403  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  49.38 
 
 
343 aa  246  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000150207  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3460  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.38 
 
 
343 aa  246  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00197  hypothetical protein  49.38 
 
 
343 aa  246  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000135351  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0206  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.38 
 
 
343 aa  246  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462586  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0203  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.38 
 
 
343 aa  246  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442829  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0211  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.38 
 
 
343 aa  246  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000167757  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0193  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.38 
 
 
343 aa  246  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000317621  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0210  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.38 
 
 
343 aa  246  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000485974  normal  0.606224 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0196  ABC transporter, ATP-binding protein  49.17 
 
 
346 aa  245  4e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000216687  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3986  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.59 
 
 
343 aa  246  4e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0176  ABC transporter ATP-binding protein  49.59 
 
 
346 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00383755  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1342  ABC transporter related  51.04 
 
 
263 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0588086  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0174  ABC transporter ATP-binding protein  49.59 
 
 
346 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.157332  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0195  ABC transporter, ATP-binding protein  47.69 
 
 
346 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0218  ABC transporter, ATP-binding protein  49.17 
 
 
346 aa  245  6e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0961  ABC transporter, ATP-binding protein  48.43 
 
 
352 aa  245  6.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1439  ABC transporter, ATP-binding protein  52.36 
 
 
361 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3281  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.19 
 
 
355 aa  244  6.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4503  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.63 
 
 
335 aa  244  8e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5127  ABC transporter, ATP-binding protein  48.76 
 
 
346 aa  244  8e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>