51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3060 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3060  hypothetical protein  100 
 
 
405 aa  840    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5742  hypothetical protein  62.08 
 
 
470 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3967  hypothetical protein  45.05 
 
 
446 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2208  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
877 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.177654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4264  Toll-interleukin receptor  44.51 
 
 
627 aa  318  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1625  hypothetical protein  40 
 
 
466 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.236851 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1449  hypothetical protein  42.08 
 
 
456 aa  302  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1420  hypothetical protein  41.83 
 
 
456 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3808  hypothetical protein  47.62 
 
 
456 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4407  hypothetical protein  37.41 
 
 
475 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.684073 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3032  diguanylate cyclase  47.35 
 
 
547 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2972  hypothetical protein  44.75 
 
 
537 aa  289  6e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1512  TIR protein  44.75 
 
 
638 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00867702 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1328  diguanylate cyclase  42.55 
 
 
648 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2158  hypothetical protein  45.1 
 
 
456 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.621981 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2114  hypothetical protein  45.1 
 
 
456 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4253  serine/threonine protein kinase  40.61 
 
 
662 aa  276  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.0204039 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0813  hypothetical protein  35.56 
 
 
491 aa  272  8.000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4878  hypothetical protein  43.56 
 
 
457 aa  269  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5745  hypothetical protein  42.72 
 
 
384 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3861  hypothetical protein  41.61 
 
 
450 aa  259  8e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.124994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1168  TIR protein  40.56 
 
 
520 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3077  toll-interleukin receptor  37.88 
 
 
623 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783629 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4814  hypothetical protein  41.84 
 
 
534 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592191  normal  0.650141 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0227  hypothetical protein  36.55 
 
 
438 aa  205  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1814  hypothetical protein  32.21 
 
 
511 aa  158  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  hitchhiker  0.000537026 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1808  TIR protein  26.57 
 
 
500 aa  107  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  24.91 
 
 
902 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  24.91 
 
 
902 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1446  hypothetical protein  41.67 
 
 
117 aa  66.6  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.712743  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  24.39 
 
 
1367 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  26.45 
 
 
1908 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  24.49 
 
 
1214 aa  63.9  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  25.37 
 
 
781 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  25.82 
 
 
1209 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  25.57 
 
 
891 aa  56.6  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  27.17 
 
 
1190 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  23.72 
 
 
1932 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  28.1 
 
 
1161 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  28.1 
 
 
1161 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  24.51 
 
 
1477 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  23.51 
 
 
1914 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  23.55 
 
 
2077 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.46 
 
 
1163 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5743  TPR repeat-containing protein  22.37 
 
 
335 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  24.9 
 
 
1177 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  24.44 
 
 
1164 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4702  WD-40 repeat-containing protein  46.51 
 
 
464 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0228  putative Chase2 sensor protein  24.09 
 
 
787 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.433927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  22.22 
 
 
1176 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  32.81 
 
 
1190 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>