100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2794 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2794  CheW protein  100 
 
 		 165 aa  332  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0060  CheW protein  39.24 
 
 		 169 aa  127  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202075  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0857  CheW protein  39.19 
 
 		 168 aa  118  4.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.201526  normal  0.0222726 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1063  CheW protein  48.25 
 
 		 164 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.646648  hitchhiker  0.0000389195 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0414  CheW protein  38.26 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.557744  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4604  CheW protein  37.75 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.447747 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3338  CheW protein  34.5 
 
 		 180 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2779  CheW protein  34.5 
 
 		 180 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.773898 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1424  CheW protein  32.19 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.27097  normal  0.186163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2788  CheW protein  31.68 
 
 		 182 aa  80.9  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4056  CheW protein  29.03 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4018  CheW protein  29.03 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0507  CheW protein  31.17 
 
 		 176 aa  62  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3746  CheW protein  29.58 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3777  CheW protein  24.32 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3001  CheW protein  31.37 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3247  CheW protein  28.3 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1016  CheW protein  25.53 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  34.31 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4951  CheW protein  25.85 
 
 		 175 aa  53.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  31.62 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  32.48 
 
 		 205 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  33.04 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  30.6 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  30.69 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  37.97 
 
 		 173 aa  50.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0716  CheW protein  22.76 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  29.25 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  30.71 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0229  putative CheW protein  25.86 
 
 		 151 aa  49.3  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0227  CheW protein  25.86 
 
 		 148 aa  49.3  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3769  putative CheW protein  26.79 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2188  CheW protein  29.41 
 
 		 153 aa  48.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0721  CheW protein  25.87 
 
 		 176 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0750  CheW protein  25.87 
 
 		 176 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  29.41 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  33.72 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0329  CheW protein  33.33 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  33.33 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2361  CheW protein  25.25 
 
 		 342 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  29.17 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  31.03 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  27.78 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  27.78 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1415  CheW protein  28.57 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  29.9 
 
 		 146 aa  45.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  29.9 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  29.9 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0581  CheW protein  30.28 
 
 		 331 aa  45.1  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  36.49 
 
 		 158 aa  45.1  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  29.29 
 
 		 515 aa  44.7  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  28.87 
 
 		 162 aa  44.7  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  26.85 
 
 		 162 aa  44.7  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  30.34 
 
 		 479 aa  44.7  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0793  CheW protein  29.57 
 
 		 365 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1525  CheW protein  30.68 
 
 		 152 aa  44.3  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361906  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0761  CheW protein  33 
 
 		 475 aa  43.9  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.951826  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3802  CheW protein  28.1 
 
 		 164 aa  43.9  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  35.14 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4744  CheW protein  30.77 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001523 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2031  CheW protein  28.77 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.505139  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0320  CheW protein  33.98 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  24.37 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4246  CheW protein  28.1 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0691  putative CheW protein  28.74 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  31.2 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1768  CheW protein  29.41 
 
 		 514 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110635 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  27.43 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2102  CheW protein  24.79 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0517911  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0317  purine-binding chemotaxis protein  25.23 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0767  CheW protein  29.57 
 
 		 365 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  32.1 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  26.55 
 
 		 176 aa  42  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30980  CheW protein  31.82 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  27.21 
 
 		 533 aa  42.4  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  29.35 
 
 		 568 aa  42.4  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  35.14 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1871  CheW protein  28.23 
 
 		 185 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0690  purine-binding chemotaxis protein  25.78 
 
 		 466 aa  42.4  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00466397  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  30.77 
 
 		 531 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2458  CheW protein  28.33 
 
 		 149 aa  42  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211003  normal  0.0838028 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  21.74 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0510  twitching motility protein PilI  26.21 
 
 		 178 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  35 
 
 		 175 aa  42  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2825  CheW protein  30.34 
 
 		 179 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0169826  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05340  twitching motility protein PilI  26.21 
 
 		 178 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2917  CheW protein  30.34 
 
 		 179 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  30.59 
 
 		 174 aa  41.6  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  27.93 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  30.34 
 
 		 179 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  32.43 
 
 		 165 aa  41.2  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  32.94 
 
 		 166 aa  41.2  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  29.17 
 
 		 200 aa  41.2  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  28.09 
 
 		 189 aa  41.2  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  27.33 
 
 		 162 aa  40.8  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4034  CheW protein  29.13 
 
 		 172 aa  40.8  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.488441  normal  0.598337 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  31.63 
 
 		 159 aa  40.8  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  27.27 
 
 		 218 aa  40.8  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  32.04 
 
 		 159 aa  40.4  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3245  CheW protein  26.25 
 
 		 528 aa  40.4  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.128469  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>