84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1763 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1763  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  100 
 
 
1475 aa  3006    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.923912 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4212  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.35 
 
 
1234 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0570  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.87 
 
 
1235 aa  386  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.466575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0049  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.54 
 
 
944 aa  385  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229879  normal  0.368167 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0553  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.77 
 
 
1235 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0622  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  33.83 
 
 
872 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2638  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  37.8 
 
 
852 aa  293  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.637289 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.14 
 
 
1343 aa  176  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  25.02 
 
 
1148 aa  137  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  22.72 
 
 
1349 aa  105  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  26.61 
 
 
1224 aa  91.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.7 
 
 
725 aa  89.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  24.87 
 
 
958 aa  87.8  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  26.76 
 
 
644 aa  84.7  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.03 
 
 
510 aa  80.5  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1185  hypothetical protein  25.72 
 
 
647 aa  80.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.132787  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  28.41 
 
 
1094 aa  78.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  22.14 
 
 
1339 aa  77.4  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  20.57 
 
 
1237 aa  76.3  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.97 
 
 
942 aa  74.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  23.85 
 
 
1049 aa  74.3  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  21.95 
 
 
1345 aa  73.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1602  signal transduction protein  23.59 
 
 
1002 aa  73.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1465  signal transduction protein  23.77 
 
 
570 aa  72.4  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5124  hypothetical protein  23.96 
 
 
951 aa  72  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  21.53 
 
 
1742 aa  71.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  22 
 
 
773 aa  71.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.13 
 
 
1067 aa  70.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.92 
 
 
323 aa  70.1  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.36 
 
 
1004 aa  68.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.38 
 
 
888 aa  68.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.33 
 
 
908 aa  67.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.96 
 
 
798 aa  67  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2529  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.36 
 
 
1174 aa  67  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250967  normal  0.208659 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  23.8 
 
 
1133 aa  66.6  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1642  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.87 
 
 
911 aa  66.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.409211 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  26.72 
 
 
783 aa  65.9  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.57 
 
 
649 aa  65.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  23.49 
 
 
1150 aa  63.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5122  signal transduction protein  22.75 
 
 
953 aa  63.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  27.13 
 
 
951 aa  63.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5163  signal transduction protein  24.46 
 
 
969 aa  63.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.64 
 
 
1183 aa  62.8  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1940  SH3 type 3 domain-containing protein  29.24 
 
 
522 aa  62.8  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5123  hypothetical protein  22.95 
 
 
949 aa  62.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  22.04 
 
 
1216 aa  62.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3244  signal transduction protein  22.16 
 
 
799 aa  61.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0094323  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.29 
 
 
997 aa  61.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.49 
 
 
762 aa  60.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.49 
 
 
762 aa  60.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  28.87 
 
 
773 aa  60.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  20.85 
 
 
766 aa  59.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.51 
 
 
1044 aa  59.3  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  22.49 
 
 
923 aa  59.3  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  24.37 
 
 
2216 aa  58.9  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.51 
 
 
805 aa  58.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4394  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.24 
 
 
851 aa  58.5  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  21.78 
 
 
1091 aa  58.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4227  HEAT domain containing protein  29.78 
 
 
756 aa  58.2  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  22.04 
 
 
2194 aa  58.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  23.48 
 
 
960 aa  57.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.79 
 
 
524 aa  57.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  21.3 
 
 
1049 aa  57  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  23.6 
 
 
1581 aa  56.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  21.94 
 
 
1053 aa  53.1  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0996  HEAT repeat-containing PBS lyase  21.73 
 
 
1110 aa  52.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.399368  normal  0.160233 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  27.98 
 
 
493 aa  52.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.42 
 
 
1023 aa  52  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2754  HEAT domain containing protein  27.04 
 
 
273 aa  50.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.202465  normal  0.0148799 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1133  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.76 
 
 
951 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  21.75 
 
 
1328 aa  50.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.81 
 
 
887 aa  49.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.88 
 
 
370 aa  48.5  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  21.43 
 
 
1064 aa  48.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  24.18 
 
 
1492 aa  47.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.03 
 
 
490 aa  47.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0119  signal transduction protein  25.17 
 
 
1075 aa  47.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.955952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8620  putative signal transduction protein with Nacht domain  30 
 
 
1239 aa  47.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00545608  normal  0.590106 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  29.32 
 
 
1766 aa  47.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  28.42 
 
 
501 aa  47.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  22.52 
 
 
1080 aa  46.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.78 
 
 
1181 aa  45.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01700  26S proteasome regulatory subunit Rpn2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08480)  22.64 
 
 
1144 aa  45.4  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0581702 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.45 
 
 
666 aa  45.1  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>