126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0258 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 97 aa  198  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  72.16 
 
 		 97 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  72.16 
 
 		 97 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  65.98 
 
 		 97 aa  135  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  62.89 
 
 		 102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3146  DNA polymerase beta domain protein region  61.86 
 
 		 98 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  56.7 
 
 		 97 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2705  DNA polymerase, beta-like region  51.04 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 98 aa  90.1  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  44.33 
 
 		 96 aa  89  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  45.36 
 
 		 96 aa  87.8  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  46.88 
 
 		 114 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  51.09 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  43.96 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1298  hypothetical protein  48.35 
 
 		 97 aa  77  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  43.48 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  46.74 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  42.39 
 
 		 93 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  38.64 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  37.11 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2672  DNA polymerase, beta-like region  37.36 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.836328  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  43.16 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  39.6 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  37.11 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1104  DNA polymerase beta domain protein region  39.8 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0953254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  39.29 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  36.9 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2452  DNA polymerase, beta-like region  40.21 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000219498  normal  0.98292 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  44.87 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  38.64 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  42.27 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  36.73 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5352  DNA polymerase, beta-like region  38.95 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  36.46 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  36.36 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1221  nucleotidyltransferase domain-containing protein  51.85 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.795397  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  40.26 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0703  DNA polymerase beta domain protein region  39.24 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000025763  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10090  predicted nucleotidyltransferase  39.74 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4165  DNA polymerase beta subunit  36.78 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1102  hypothetical protein  44.44 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.836571  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  32.26 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2288  DNA polymerase, beta-like region  40.66 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  37.8 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0142  nucleotidyltransferase  39.24 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  45.83 
 
 		 101 aa  53.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  32.26 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4395  hypothetical protein  46.94 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0622266 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  37.8 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  44.93 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  36.46 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1812  DNA polymerase beta subunit  38.95 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.337517  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1527  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  35.37 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  39.77 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  31.03 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  29.29 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  37.21 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  28.42 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3907  DNA polymerase beta domain protein region  35.35 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  35.06 
 
 		 108 aa  50.4  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  34.09 
 
 		 109 aa  50.4  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  31.18 
 
 		 96 aa  50.1  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  39.29 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  34.41 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  28.57 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  35.9 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  30.11 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1733  DNA polymerase beta domain protein region  38.67 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.3433 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  37.08 
 
 		 100 aa  47.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3260  transcriptional regulator, XRE family  34.67 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  31.11 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  33.67 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2453  DNA polymerase beta domain protein region  32.97 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  30.77 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  35.48 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1879  DNA polymerase beta domain protein region  32.04 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3557  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 254 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1853  DNA polymerase beta domain protein region  32.04 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  34.69 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1295  DNA polymerase beta domain protein region  40.96 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0315  DNA polymerase beta domain protein region  34.21 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0889475 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  35.82 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2148  DNA polymerase beta domain protein region  36.17 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1652  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  42.65 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175672 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  38.16 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  37.18 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  36.71 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0369  DNA polymerase beta subunit  30.26 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.832865  normal  0.194305 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3538  DNA polymerase beta subunit  34.62 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19940  predicted nucleotidyltransferase  47.62 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0104125 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  32.61 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  32.61 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26330  predicted nucleotidyltransferase  34.62 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155672  normal  0.055633 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  33.7 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1408  DNA polymerase beta subunit  35.11 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3203  DNA polymerase beta subunit  36.11 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  37.14 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  30.59 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>