More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1222 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1222  ABC transporter related  100 
 
 		 230 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.678182  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2071  ABC transporter related  70.09 
 
 		 230 aa  310  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2834  ABC transporter related  53.28 
 
 		 358 aa  238  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.698538  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4455  ABC transporter related  53.46 
 
 		 369 aa  229  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.044613  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  51.64 
 
 		 352 aa  223  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1841  ABC transporter related  53.27 
 
 		 361 aa  222  4e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1465  ABC transporter related  49.55 
 
 		 371 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.778579  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2479  ABC transporter related  47.03 
 
 		 339 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  48.4 
 
 		 356 aa  219  3.9999999999999997e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0542  ABC transporter related  50 
 
 		 346 aa  218  6e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.999499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1133  ABC transporter related  53.11 
 
 		 259 aa  217  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2734  ABC transporter related  47.03 
 
 		 339 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.367354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  50.92 
 
 		 364 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.78 
 
 		 372 aa  215  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3201  ABC transporter component  50.91 
 
 		 359 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  47.47 
 
 		 364 aa  213  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  46.49 
 
 		 366 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3229  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.93 
 
 		 408 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1077  ABC transporter related  50.24 
 
 		 382 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  48.18 
 
 		 355 aa  211  5.999999999999999e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  50 
 
 		 359 aa  211  7e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.77 
 
 		 362 aa  211  7e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  47.73 
 
 		 355 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2417  ABC transporter related  48.37 
 
 		 350 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.830263  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2456  ABC transporter related  48.37 
 
 		 350 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.913422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2462  ABC transporter related  48.37 
 
 		 350 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5505  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.4 
 
 		 362 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0976565 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  49.08 
 
 		 373 aa  210  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0122  ABC transporter related  45.91 
 
 		 347 aa  209  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.617953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.98 
 
 		 366 aa  209  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7604  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.17 
 
 		 413 aa  209  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17640  polyamine transport protein PotA  49.09 
 
 		 363 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2238  ABC transporter related protein  48.86 
 
 		 384 aa  208  6e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3482  ABC transporter related protein  47.35 
 
 		 384 aa  208  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.815806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3778  ABC transporter related  48.84 
 
 		 356 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.37317  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5375  ABC transporter related  46.79 
 
 		 387 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0766723  normal  0.734389 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3188  putative ABC transporter ATP-binding protein  47.95 
 
 		 378 aa  206  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  48.43 
 
 		 363 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3233  ABC transporter related  48.18 
 
 		 344 aa  206  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.611679  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3737  ABC transporter related  46.82 
 
 		 349 aa  206  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6133  ABC transporter related  48.62 
 
 		 351 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269314  normal  0.315029 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  48.36 
 
 		 363 aa  206  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  49.32 
 
 		 372 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1946  ABC transporter related  44.89 
 
 		 353 aa  205  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.259748 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.61 
 
 		 346 aa  205  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  48.87 
 
 		 372 aa  205  5e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1534  polyamine transport protein PotA  49.54 
 
 		 359 aa  205  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  48.92 
 
 		 402 aa  204  7e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6545  ABC transporter related  48.62 
 
 		 351 aa  204  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.423857 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4455  ABC transporter related protein  47.51 
 
 		 378 aa  204  7e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  46.98 
 
 		 363 aa  204  8e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3702  ABC transporter related  48.61 
 
 		 357 aa  204  9e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1613  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  48.61 
 
 		 365 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1465  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  50.45 
 
 		 352 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476678  normal  0.124115 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2267  ABC transporter related protein  54.19 
 
 		 351 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.64 
 
 		 379 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1504  ABC transporter related  49.77 
 
 		 350 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.310407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.25 
 
 		 355 aa  203  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  46.33 
 
 		 386 aa  202  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1587  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.53 
 
 		 376 aa  202  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.167194 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0809  ABC transporter, ATP-binding protein  47.69 
 
 		 350 aa  202  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0662  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 		 347 aa  202  4e-51  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2869  ABC transporter related  46.51 
 
 		 361 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0665765 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3216  ABC transporter related  46.51 
 
 		 361 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5129  ABC transporter related  49.77 
 
 		 370 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.701996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1610  ABC transporter related  46.98 
 
 		 330 aa  202  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.054116  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2651  ABC transporter related  50.23 
 
 		 348 aa  202  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220335  normal  0.549326 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4660  ABC transporter related  49.55 
 
 		 347 aa  201  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2621  ABC transporter-related protein  48.37 
 
 		 353 aa  202  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.295311  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1398  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.5 
 
 		 327 aa  201  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.240911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1439  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.5 
 
 		 327 aa  201  6e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000273581  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.42 
 
 		 354 aa  201  6e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1375  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.5 
 
 		 327 aa  201  6e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000557634 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0759  ABC transporter, ATP-binding protein  47.69 
 
 		 350 aa  201  6e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.850542  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1177  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.5 
 
 		 331 aa  201  7e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1179  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.5 
 
 		 331 aa  201  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00519424  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0351  ABC transporter related  47.69 
 
 		 366 aa  201  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1199  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  44.5 
 
 		 331 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00119118  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1297  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  44.5 
 
 		 331 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2939  ABC transporter ATP-binding protein  46.4 
 
 		 358 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.878604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.15 
 
 		 351 aa  200  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3237  ABC transporter related  48.17 
 
 		 353 aa  200  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.543822  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  47.25 
 
 		 342 aa  200  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  46.79 
 
 		 348 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2068  ABC transporter related  48.83 
 
 		 364 aa  201  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0179  ABC transporter related  48.66 
 
 		 388 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.25 
 
 		 351 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0496  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  47.53 
 
 		 359 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.366469 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0279  ABC transporter, ATPase subunit  47.06 
 
 		 386 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213397  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  48.83 
 
 		 373 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4007  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.5 
 
 		 327 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.124331  hitchhiker  0.00000000114894 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  47.16 
 
 		 342 aa  200  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  50.23 
 
 		 355 aa  199  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1337  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.5 
 
 		 327 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.819184  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  47.25 
 
 		 371 aa  200  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  45.98 
 
 		 348 aa  199  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2371  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.33 
 
 		 393 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1007  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.5 
 
 		 327 aa  199  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  42.47 
 
 		 358 aa  199  3e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  46.79 
 
 		 364 aa  199  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>