More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_67550 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_67550  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 141 aa  266  7e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0955895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5849  putative transcriptional regulator  92.91 
 
 		 141 aa  229  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00369897  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1990  transcriptional regulator, MerR family  75.71 
 
 		 147 aa  207  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0033  MerR family transcriptional regulator  76.19 
 
 		 164 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.696294  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3541  MerR family transcriptional regulator  67.38 
 
 		 141 aa  177  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2683  MerR family transcriptional regulator  75 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.903809  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1858  MerR family transcriptional regulator  75 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15558  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2694  MerR family transcriptional regulator  75 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0035  MerR family transcriptional regulator  75 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4022  MerR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 141 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605309  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3269  MerR family transcriptional regulator  75 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0248  MerR family transcriptional regulator  75.41 
 
 		 183 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.849473  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1905  MerR family transcriptional regulator  65.25 
 
 		 141 aa  174  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.380273  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0423  MerR family transcriptional regulator  68.66 
 
 		 140 aa  174  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0035  MerR family transcriptional regulator  74.19 
 
 		 142 aa  174  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2837  MerR family transcriptional regulator  71.09 
 
 		 133 aa  173  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4236  MerR family transcriptional regulator  65.71 
 
 		 141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4130  MerR family transcriptional regulator  65.71 
 
 		 141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal  0.465162 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3389  MerR family transcriptional regulator  65.71 
 
 		 141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879982 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4462  MerR family transcriptional regulator  67.97 
 
 		 141 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2579  MerR family transcriptional regulator  67.97 
 
 		 143 aa  166  8e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136218  normal  0.025304 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01184  Transcriptional regulator, MerR family protein  61.54 
 
 		 137 aa  164  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2682  putative regulatory protein  64.18 
 
 		 172 aa  161  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.537318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2902  regulatory protein, MerR  62.79 
 
 		 143 aa  160  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3347  MerR family transcriptional regulator  60.9 
 
 		 144 aa  157  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4691  MerR family transcriptional regulator  63.78 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3439  MerR family transcriptional regulator  62.9 
 
 		 136 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1595  MerR family transcriptional regulator  56.72 
 
 		 139 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.146181 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0382  MerR family transcriptional regulator  59.84 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4273  MerR family transcriptional regulator  55.64 
 
 		 139 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1460  transcriptional regulator, MerR family  55.12 
 
 		 151 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0645797  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4260  MerR family transcriptional regulator  60.16 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.49412 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3837  MerR family transcriptional regulator  57.36 
 
 		 139 aa  140  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265561  normal  0.533813 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2614  MerR family transcriptional regulator  55.47 
 
 		 141 aa  140  5e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.144793 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3589  MerR family transcriptional regulator  53.38 
 
 		 137 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000248  transcriptional regulator  53.17 
 
 		 135 aa  137  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2311  transcriptional regulator, MerR family  58.59 
 
 		 135 aa  133  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113317  normal  0.278177 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3141  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  38.4 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.814433  normal  0.503062 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1546  MerR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 161 aa  70.1  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.548833  normal  0.109608 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2060  transcriptional regulator SoxR  37.7 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0056  soxR protein  35.71 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0560475  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3680  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3280  MerR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6360  transcriptional regulator, MerR family  36.69 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1579  MerR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0323657  normal  0.536322 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5717  transcriptional regulator, MerR family  40.54 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3920  MerR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.692968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3152  MerR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.335124  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3453  MerR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0445527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0537  MerR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0631  MerR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.170706 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03935  DNA-binding transcriptional dual regulator, Fe-S center for redox-sensing  38.71 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.015828  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3929  transcriptional regulator, MerR family  38.71 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5566  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  38.71 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.953635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000675  redox-sensitive transcriptional activator soxR  35.96 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.27209  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03895  hypothetical protein  38.71 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0184757  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3964  MerR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0321214 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4305  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  38.71 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4581  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  38.71 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06555  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  33.93 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4616  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  38.71 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0225  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  36.04 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0548  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.16 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10940  transcriptional regulator, MerR family  38.6 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4611  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  38.71 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0111034  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  37.8 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4517  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  38.71 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4610  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  38.71 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.327282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4525  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  38.71 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3642  transcriptional regulator, MerR family  36.67 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4661  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  38.71 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1029  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  37.01 
 
 		 161 aa  62  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4538  transcriptional activator for superoxide response; Fe-S center for redox-sensing (MerR family)  39.52 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485722  normal  0.455986 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1915  putative transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1565  transcriptional regulator, MerR family protein  28.23 
 
 		 146 aa  62  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.183057  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1443  MerR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  0.0519631 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1053  MerR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4525  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  37.9 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5131  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 166 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533425  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2489  putative transcriptional regulator, MerR family  36.61 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00633728 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01780  transcriptional regulator, MerR family  42.15 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.95899 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2276  MerR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 184 aa  62  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101998  hitchhiker  0.00000024461 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1612  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  42.55 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0553  DNA-binding transcriptional regulator CueR  30.43 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.985745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0607  DNA-binding transcriptional regulator CueR  30.43 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0563  DNA-binding transcriptional regulator CueR  30.43 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0546  DNA-binding transcriptional regulator CueR  30.43 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35170  putative redox-sensing activator of soxS  36.07 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0267  MerR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3026  transcriptional regulator, MerR family  31.5 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2125  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  31.45 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0226644  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1189  MerR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6249  MerR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.256623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1830  MerR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00524998  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1260  transcriptional regulator  34.4 
 
 		 131 aa  60.1  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3972  MerR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>