283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_48630 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_48630  putative MFS transporter  100 
 
 		 409 aa  798    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0171421  normal  0.0121812 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  41.22 
 
 		 434 aa  297  3e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1258  putative MFS transporter family protein  37.26 
 
 		 442 aa  270  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0854  major facilitator transporter  36.89 
 
 		 432 aa  261  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1995  major facilitator superfamily MFS_1  34.69 
 
 		 464 aa  256  7e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230146  hitchhiker  0.000000379141 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  36.82 
 
 		 426 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2468  major facilitator transporter  34.32 
 
 		 460 aa  252  7e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0361847  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2352  major facilitator transporter  35.01 
 
 		 460 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2363  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 464 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2847  putative MFS transporter family protein  34.64 
 
 		 427 aa  248  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.778144  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  31.32 
 
 		 412 aa  159  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  29.14 
 
 		 412 aa  149  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  28.88 
 
 		 413 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  31.27 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  28.61 
 
 		 412 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  28.88 
 
 		 412 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4024  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959779  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1696  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 		 392 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 381 aa  122  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1293  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 392 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0756412  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  24.11 
 
 		 424 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 417 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  23.82 
 
 		 424 aa  110  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 393 aa  109  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 407 aa  104  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  25.49 
 
 		 423 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  25.8 
 
 		 423 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3789  efflux transporter, putative  29.28 
 
 		 406 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0557908 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  25.19 
 
 		 423 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  25.19 
 
 		 423 aa  99.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  25.19 
 
 		 423 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  25.19 
 
 		 423 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 424 aa  98.6  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  27.52 
 
 		 423 aa  98.6  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 398 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  25.77 
 
 		 432 aa  94.4  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  24.11 
 
 		 424 aa  92.4  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  24.21 
 
 		 423 aa  92  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  24.32 
 
 		 423 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2112  major facilitator superfamily MFS_1  22.82 
 
 		 395 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000539855  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2124  putative MFS-type transporter YdeE  22.82 
 
 		 395 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0942294  normal  0.976791 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  26.32 
 
 		 397 aa  90.1  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 450 aa  89.7  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01493  predicted transporter  22.82 
 
 		 395 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.045441  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1623  putative MFS-type transporter YdeE  22.82 
 
 		 395 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000326131  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01504  hypothetical protein  22.82 
 
 		 395 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2148  putative MFS-type transporter YdeE  22.82 
 
 		 395 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.355886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1630  putative MFS-type transporter YdeE  22.86 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0579751  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  23.66 
 
 		 423 aa  87  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1742  putative MFS-type transporter YdeE  22.54 
 
 		 395 aa  87  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0931308  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1618  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 412 aa  86.7  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 450 aa  86.3  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  27.47 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1621  putative MFS-type transporter YdeE  24.51 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.314977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1688  putative MFS-type transporter YdeE  24.65 
 
 		 395 aa  82.8  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1629  putative MFS-type transporter YdeE  24.65 
 
 		 395 aa  82.8  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1654  putative MFS-type transporter YdeE  25.98 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00100245  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0144  major facilitator superfamily permease  26.85 
 
 		 438 aa  80.9  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00484994  normal  0.343397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  23.3 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  23.3 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  24.15 
 
 		 404 aa  79.7  0.00000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  22.91 
 
 		 398 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  23.21 
 
 		 393 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  23.24 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  23.24 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1849  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  26.55 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  24.2 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  22.37 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  22.92 
 
 		 393 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0013  major facilitator transporter  22.03 
 
 		 400 aa  75.9  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3391  major facilitator family protein  22.37 
 
 		 399 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.271693  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  24.15 
 
 		 397 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  24.67 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  24.67 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  21.89 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  24.35 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  21.86 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  24.09 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1813  major facilitator superfamily permease  23.97 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000665519  hitchhiker  0.0000000329219 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  24.09 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  24.09 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  23.2 
 
 		 421 aa  73.6  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 414 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  22.25 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  22.43 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  22.7 
 
 		 393 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  22.25 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  24.09 
 
 		 397 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  24.09 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  22.01 
 
 		 418 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  21.96 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  21.64 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>