More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_38395 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3269  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  95.45 
 
 		 396 aa  724    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38395  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  100 
 
 		 396 aa  775    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0159861 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1616  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  62.47 
 
 		 397 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0928775 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1543  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  62.57 
 
 		 395 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4767  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  63.56 
 
 		 399 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321733  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1598  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  61.94 
 
 		 400 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.671811  normal  0.334674 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1520  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  61.52 
 
 		 395 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1361  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  57.03 
 
 		 389 aa  409  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1142  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  62.43 
 
 		 400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1622  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  62.43 
 
 		 400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2057  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  61.52 
 
 		 399 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.408634  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1889  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  61.52 
 
 		 399 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.169622  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2445  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  61.24 
 
 		 399 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1903  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  61.52 
 
 		 399 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00844359  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0843  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  60.96 
 
 		 399 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.427222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0317  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  60.96 
 
 		 399 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00333189  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1662  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  60.96 
 
 		 399 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.018049  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0910  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.42 
 
 		 393 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0841  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.55 
 
 		 393 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.85215 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0889  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.53 
 
 		 384 aa  332  6e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000000756331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  51.89 
 
 		 415 aa  329  7e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3745  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.91 
 
 		 423 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3422  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.91 
 
 		 469 aa  305  6e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2937  RND family efflux transporter MFP subunit  46.96 
 
 		 391 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2482  RND family efflux transporter MFP subunit  48.44 
 
 		 391 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3588  secretion protein HlyD  51.13 
 
 		 415 aa  297  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  48.9 
 
 		 398 aa  293  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.44 
 
 		 391 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.297905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2314  RND family efflux transporter MFP subunit  47.88 
 
 		 391 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2893  secretion protein HlyD  45.36 
 
 		 385 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127871  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2758  secretion protein HlyD  44.74 
 
 		 385 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  46.76 
 
 		 430 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.38 
 
 		 424 aa  283  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  43.9 
 
 		 428 aa  281  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  45.43 
 
 		 430 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2283  secretion protein HlyD  46.33 
 
 		 386 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00947214 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  39.27 
 
 		 392 aa  271  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0323  RND family efflux transporter MFP subunit  44.06 
 
 		 433 aa  271  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60850  multidrug efflux RND membrane fusion protein  45.61 
 
 		 387 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0389  RND family efflux transporter MFP subunit  43.6 
 
 		 434 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.52 
 
 		 410 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3714  RND family efflux transporter MFP subunit  45.29 
 
 		 408 aa  266  7e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132208 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0318  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.72 
 
 		 436 aa  265  8e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.199682  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  42.78 
 
 		 412 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2817  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexC  42.74 
 
 		 378 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2256  RND family efflux transporter MFP subunit  46.48 
 
 		 404 aa  263  4.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  42.27 
 
 		 381 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2427  RND family efflux transporter MFP subunit  43.7 
 
 		 380 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.412114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2887  RND family efflux transporter MFP subunit  46.5 
 
 		 430 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303028  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3704  RND family efflux transporter MFP subunit  41.76 
 
 		 379 aa  261  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.11 
 
 		 433 aa  259  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  42.93 
 
 		 423 aa  259  4e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  42.28 
 
 		 385 aa  260  4e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.01 
 
 		 385 aa  258  9e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  42.23 
 
 		 400 aa  258  9e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  42.01 
 
 		 385 aa  258  9e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000310651  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.21 
 
 		 422 aa  258  9e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0441  RND family efflux transporter MFP subunit  42.01 
 
 		 385 aa  258  9e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3750  acriflavine resistance protein E  42.01 
 
 		 385 aa  258  9e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00329123  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.62 
 
 		 411 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4582  acriflavine resistance protein E  42.01 
 
 		 385 aa  258  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  0.314671 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03123  cytoplasmic membrane lipoprotein  41.73 
 
 		 385 aa  256  5e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03074  hypothetical protein  41.73 
 
 		 385 aa  256  5e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  41.51 
 
 		 385 aa  256  5e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  40.22 
 
 		 395 aa  256  6e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  40.22 
 
 		 395 aa  256  6e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  40.22 
 
 		 388 aa  256  7e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3582  acriflavine resistance protein E  43.28 
 
 		 385 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.372723  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3655  acriflavine resistance protein E  43.28 
 
 		 385 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.369196 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3689  acriflavine resistance protein E  43.28 
 
 		 385 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.10776 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5858  RND family efflux transporter MFP subunit  45.08 
 
 		 409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.965315  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2593  multidrug resistance protein, AcrA/AcrE family  44.76 
 
 		 386 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.800698  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3583  acriflavine resistance protein E  43.01 
 
 		 385 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  38.89 
 
 		 405 aa  253  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5240  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexC precursor  45.59 
 
 		 387 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  41.5 
 
 		 397 aa  253  6e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2680  secretion protein HlyD  42.63 
 
 		 393 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.957988  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  40.05 
 
 		 394 aa  249  9e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  40.21 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  39.22 
 
 		 418 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  39.22 
 
 		 418 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  40.76 
 
 		 409 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  39.26 
 
 		 418 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  40.76 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  36.39 
 
 		 394 aa  244  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3527  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.56 
 
 		 446 aa  244  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  40.49 
 
 		 409 aa  243  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  40.49 
 
 		 397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.49 
 
 		 397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  40.49 
 
 		 397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  40.49 
 
 		 397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  37.95 
 
 		 426 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  40.49 
 
 		 397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  40.49 
 
 		 397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  38.86 
 
 		 383 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3651  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.62 
 
 		 441 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  39.13 
 
 		 442 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.98 
 
 		 395 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3327  RND family efflux transporter MFP subunit  39.62 
 
 		 441 aa  241  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01880  Secretion protein HlyD  42.09 
 
 		 383 aa  239  9e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>