More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_13181 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_13181  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  100 
 
 		 320 aa  660    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.974044  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  85.94 
 
 		 320 aa  588  1e-167  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  86.25 
 
 		 320 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  85.62 
 
 		 320 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  63.12 
 
 		 320 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  61.56 
 
 		 320 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  60.31 
 
 		 320 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  60.31 
 
 		 320 aa  433  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16011  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  59.38 
 
 		 324 aa  431  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.975575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0761  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  59.06 
 
 		 324 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  50.81 
 
 		 323 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  50.81 
 
 		 323 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  46.56 
 
 		 320 aa  327  2.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  48.7 
 
 		 339 aa  324  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  43.53 
 
 		 332 aa  321  9.000000000000001e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  44.3 
 
 		 328 aa  316  3e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  44.55 
 
 		 327 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3162  NmrA-like  44.58 
 
 		 325 aa  293  3e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.186566  hitchhiker  0.00806133 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47864  predicted protein  40.52 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  26.17 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.8 
 
 		 291 aa  89.4  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  26.12 
 
 		 291 aa  87.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6307  NmrA family protein  27.53 
 
 		 306 aa  86.3  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  27.23 
 
 		 287 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  27.23 
 
 		 287 aa  85.9  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  27.23 
 
 		 287 aa  85.9  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  26.79 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  24.6 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  25.11 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  24.26 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  26.42 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  25.78 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.68 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  24.66 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  24.22 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.37 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  29.87 
 
 		 216 aa  72.4  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  25 
 
 		 257 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.06 
 
 		 227 aa  72.4  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  26.24 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  25.99 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  22.84 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  30.67 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1791  NmrA family protein  29.39 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  24.79 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.9 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  22.79 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.88 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  20.95 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.82 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.470267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.31 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2445  NmrA family protein  21.58 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.385594  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4557  hypothetical protein  28.57 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278817  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0242  saccharopine dehydrogenase related protein  32.73 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0479  NmrA family protein  26.88 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.31 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1587  NmrA family protein  24.23 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428697  normal  0.242272 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  23.96 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3102  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  31.61 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  30.32 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3711  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.21 
 
 		 429 aa  62.8  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.712619  normal  0.892725 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5821  NmrA family protein  30.13 
 
 		 250 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  24.88 
 
 		 297 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0384  hypothetical protein  22.71 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.08 
 
 		 212 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  25.55 
 
 		 357 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  21.92 
 
 		 512 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1032  NmrA family protein  27.04 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.860276  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  21.05 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  27.6 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  25.73 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.21 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  23.25 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  21.97 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0745309  normal  0.267287 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4675  NmrA family protein  24.58 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.764449 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.69 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000606737 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  25.62 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  26.73 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.82 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  27.66 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  22.02 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  22.27 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  24.79 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2517  NmrA family protein  27.52 
 
 		 251 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.45 
 
 		 214 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3907  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.3708 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  26.92 
 
 		 222 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1312  NmrA family protein  21.72 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.14 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0560564  normal  0.509097 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1016  hypothetical protein  24.66 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.861732  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  18.67 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2126  NmrA family protein  28.14 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  20.48 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2467  NmrA family protein  21.01 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.311321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>