261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2517 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2517  NmrA family protein  100 
 
 		 251 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2773  NmrA family protein  91.2 
 
 		 251 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298271  normal  0.534883 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4738  NmrA family protein  74.8 
 
 		 254 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210315  normal  0.761332 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4675  NmrA family protein  74.21 
 
 		 254 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.764449 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5821  NmrA family protein  68.83 
 
 		 250 aa  358  4e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5436  NmrA family protein  71.84 
 
 		 251 aa  342  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4281  NmrA family protein  66.13 
 
 		 250 aa  340  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5446  NmrA family protein  66.39 
 
 		 267 aa  332  5e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2341  NmrA family protein  68.13 
 
 		 251 aa  324  9e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5577  NmrA family protein  63.97 
 
 		 251 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2275  NmrA-like  62.4 
 
 		 251 aa  317  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.489802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.8 
 
 		 251 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7641  NmrA family protein  65.59 
 
 		 251 aa  307  9e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787849  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5255  NmrA-like  60.89 
 
 		 251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5604  NmrA family protein  60.89 
 
 		 251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4624  NmrA family protein  60.08 
 
 		 251 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000639596 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1115  NmrA-like  59.68 
 
 		 273 aa  303  3.0000000000000004e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000012808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.85 
 
 		 254 aa  285  4e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1579  NAD-dependent epimerase/dehydratase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  57.09 
 
 		 250 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5169  NmrA-like protein  55.78 
 
 		 251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269967  hitchhiker  0.0024207 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2924  NmrA-like  58.87 
 
 		 250 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5558  NmrA family protein  54.66 
 
 		 247 aa  279  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5787  NmrA family protein  55.1 
 
 		 247 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4349  NmrA family protein  53.44 
 
 		 250 aa  276  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.971724  normal  0.637435 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1995  NmrA family protein  56.28 
 
 		 255 aa  270  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7959  NmrA family protein  54 
 
 		 252 aa  264  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.757877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.16 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.76 
 
 		 258 aa  261  6e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.716316  hitchhiker  0.0000000415542 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.82 
 
 		 251 aa  258  6e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3956  GCN5-related N-acetyltransferase  54 
 
 		 402 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0442969 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0905  NmrA family protein  50.82 
 
 		 251 aa  249  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.596498  normal  0.269728 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5001  NmrA family protein  53.63 
 
 		 252 aa  249  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4579  NmrA family protein  48.58 
 
 		 250 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.421298 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4584  NmrA family protein  48.58 
 
 		 250 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.907742 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.41 
 
 		 249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5307  NmrA family protein  53.01 
 
 		 254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4925  NmrA-like protein  52.61 
 
 		 252 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5014  NmrA family protein  52.61 
 
 		 252 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.519146  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5191  NmrA family protein  46.15 
 
 		 250 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102681  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4025  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  54.7 
 
 		 249 aa  228  8e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0904  NmrA family protein  46.34 
 
 		 246 aa  224  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.705633  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5460  NmrA family protein  46.96 
 
 		 250 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13563  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0991  NmrA family protein  51.1 
 
 		 243 aa  215  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2101  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  45.42 
 
 		 244 aa  214  9e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.37 
 
 		 246 aa  203  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5747  NmrA family protein  39.52 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3574  NmrA family protein  43.5 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5436  hypothetical protein  40.57 
 
 		 244 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5437  hypothetical protein  59.7 
 
 		 137 aa  172  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2094  NmrA family protein  42.74 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9038  hypothetical protein  36.03 
 
 		 247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.89 
 
 		 248 aa  159  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0611  NmrA family protein  35.25 
 
 		 253 aa  158  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05170  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  34.68 
 
 		 251 aa  151  8e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3002  NmrA family protein  34.69 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.284221  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3222  NmrA family protein  34.55 
 
 		 264 aa  149  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1560  hypothetical protein  34.8 
 
 		 263 aa  139  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0351056  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3992  NmrA family protein  33.47 
 
 		 248 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20710  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  37.74 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4049  hypothetical protein  34.8 
 
 		 261 aa  132  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000562723  normal  0.100478 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01680  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  34.54 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576893  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.49 
 
 		 252 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8718  NmrA family protein  34.88 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  hitchhiker  0.00954025 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.23 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05940  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  30.62 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511116  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4374  hypothetical protein  29.48 
 
 		 244 aa  97.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.04339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4557  hypothetical protein  32.02 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278817  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3102  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4107  NmrA family protein  31.96 
 
 		 269 aa  87  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.824515 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1659  NmrA family protein  29.39 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27560  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  26.77 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.235843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0228  NmrA family protein  31.63 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.5 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.5 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1652  hypothetical protein  26.67 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1698  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.9 
 
 		 259 aa  75.1  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.2 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.91 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.24 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.11 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1163  NmrA family protein  29.41 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00319088  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1279  hypothetical protein  29.53 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0266126  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.62 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  31.08 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.78 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.05 
 
 		 320 aa  67  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.63 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0940  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.31 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.681358  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.41 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.75 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.4 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.4 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3321  NmrA family protein  28.38 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.4 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.12 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.97826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>