299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4675 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4675  NmrA family protein  100 
 
 		 254 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.764449 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4738  NmrA family protein  89.76 
 
 		 254 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210315  normal  0.761332 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2517  NmrA family protein  74.21 
 
 		 251 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2773  NmrA family protein  72.8 
 
 		 251 aa  374  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298271  normal  0.534883 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4281  NmrA family protein  68.27 
 
 		 250 aa  347  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5821  NmrA family protein  66.53 
 
 		 250 aa  339  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5436  NmrA family protein  67.35 
 
 		 251 aa  328  4e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2341  NmrA family protein  64.14 
 
 		 251 aa  317  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2275  NmrA-like  61.54 
 
 		 251 aa  314  7e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.489802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5446  NmrA family protein  62.3 
 
 		 267 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.16 
 
 		 251 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5577  NmrA family protein  62 
 
 		 251 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5169  NmrA-like protein  57.37 
 
 		 251 aa  301  8.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269967  hitchhiker  0.0024207 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7641  NmrA family protein  64.26 
 
 		 251 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787849  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5255  NmrA-like  59.04 
 
 		 251 aa  298  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5604  NmrA family protein  59.04 
 
 		 251 aa  298  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.09 
 
 		 254 aa  296  3e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4624  NmrA family protein  58.23 
 
 		 251 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000639596 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1115  NmrA-like  56.3 
 
 		 273 aa  293  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000012808 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1579  NAD-dependent epimerase/dehydratase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  55.6 
 
 		 250 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5558  NmrA family protein  56.28 
 
 		 247 aa  279  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.69 
 
 		 258 aa  277  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.716316  hitchhiker  0.0000000415542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.69 
 
 		 258 aa  277  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5787  NmrA family protein  55.92 
 
 		 247 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7959  NmrA family protein  54.37 
 
 		 252 aa  274  8e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.757877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2924  NmrA-like  55.2 
 
 		 250 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4349  NmrA family protein  54.07 
 
 		 250 aa  268  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.971724  normal  0.637435 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1995  NmrA family protein  53.33 
 
 		 255 aa  265  5e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0905  NmrA family protein  52.24 
 
 		 251 aa  257  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.596498  normal  0.269728 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3956  GCN5-related N-acetyltransferase  56.5 
 
 		 402 aa  251  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0442969 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 		 251 aa  250  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5191  NmrA family protein  50 
 
 		 250 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102681  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5001  NmrA family protein  53.47 
 
 		 252 aa  247  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2101  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  51.65 
 
 		 244 aa  245  6e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5307  NmrA family protein  52.65 
 
 		 254 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5460  NmrA family protein  50.4 
 
 		 250 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13563  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4925  NmrA-like protein  52.65 
 
 		 252 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5014  NmrA family protein  52.65 
 
 		 252 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.519146  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.04 
 
 		 249 aa  236  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4025  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  56.28 
 
 		 249 aa  236  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4579  NmrA family protein  45.34 
 
 		 250 aa  231  7.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.421298 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4584  NmrA family protein  45.34 
 
 		 250 aa  231  7.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.907742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0904  NmrA family protein  45.53 
 
 		 246 aa  227  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.705633  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0991  NmrA family protein  47.7 
 
 		 243 aa  211  7e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.61 
 
 		 246 aa  208  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3574  NmrA family protein  45.53 
 
 		 244 aa  188  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5747  NmrA family protein  40.73 
 
 		 247 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5436  hypothetical protein  43.67 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9038  hypothetical protein  39.27 
 
 		 247 aa  181  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0611  NmrA family protein  38.46 
 
 		 253 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5437  hypothetical protein  62.41 
 
 		 137 aa  176  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2094  NmrA family protein  44.94 
 
 		 246 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.29 
 
 		 248 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3222  NmrA family protein  37.9 
 
 		 264 aa  165  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3002  NmrA family protein  37.65 
 
 		 249 aa  160  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.284221  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05170  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  36.29 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3992  NmrA family protein  34.68 
 
 		 248 aa  142  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20710  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  39.62 
 
 		 251 aa  142  6e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4049  hypothetical protein  36.95 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000562723  normal  0.100478 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1560  hypothetical protein  34.66 
 
 		 263 aa  132  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0351056  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01680  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  39.25 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576893  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.24 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05940  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  32.79 
 
 		 252 aa  115  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511116  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4374  hypothetical protein  33.2 
 
 		 244 aa  115  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.04339  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8718  NmrA family protein  34.38 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  hitchhiker  0.00954025 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3102  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.53 
 
 		 248 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4557  hypothetical protein  33.33 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278817  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.84 
 
 		 250 aa  99.8  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1659  NmrA family protein  31.95 
 
 		 264 aa  95.5  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4107  NmrA family protein  32.88 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.824515 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1652  hypothetical protein  28.12 
 
 		 255 aa  85.9  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27560  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  30.14 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.235843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1698  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.96 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0228  NmrA family protein  29.6 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3321  NmrA family protein  29.71 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.3 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.13 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.19 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.68 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1279  hypothetical protein  31.69 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0266126  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0940  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.46 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.681358  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  27.6 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.43 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.36 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  28.64 
 
 		 341 aa  67  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.36 
 
 		 320 aa  67  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.48 
 
 		 320 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.4 
 
 		 459 aa  66.2  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0520232 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.16 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.54 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.19 
 
 		 291 aa  65.5  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1163  NmrA family protein  27.98 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00319088  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.49 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.08 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1515  NmrA family protein  31.48 
 
 		 278 aa  62  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.199707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>