143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_18941 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_18941  NAD binding site:D-amino acid oxidase  100 
 
 		 360 aa  716    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1796  D-amino acid oxidase  91.36 
 
 		 360 aa  633  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229908  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19131  NAD binding site:D-amino acid oxidase  86.63 
 
 		 360 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.119558  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18941  NAD binding site:D-amino acid oxidase  63.23 
 
 		 360 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21851  NAD binding site:D-amino acid oxidase  35.05 
 
 		 370 aa  246  3e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1312  FAD dependent oxidoreductase  35.33 
 
 		 368 aa  242  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18391  NAD binding site:D-amino acid oxidase  34.43 
 
 		 371 aa  220  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.299081  normal  0.626898 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2673  D-amino acid oxidase  29.66 
 
 		 350 aa  216  4e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30031  NAD binding site:D-amino acid oxidase  28.7 
 
 		 372 aa  206  6e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2302  D-amino acid oxidase  30.13 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5037  FAD dependent oxidoreductase  25.97 
 
 		 360 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0520  FAD dependent oxidoreductase  27.35 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0537  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 		 369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1461  FAD dependent oxidoreductase  24.63 
 
 		 379 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942129  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1793  FAD dependent oxidoreductase  26.14 
 
 		 389 aa  102  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.075637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1783  FAD dependent oxidoreductase  25.97 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.359042  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0199  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  25.85 
 
 		 372 aa  92  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  23.35 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1677  hypothetical protein  22.99 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.32351  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  23.35 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  24.25 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  23.85 
 
 		 369 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  23.85 
 
 		 369 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  23.85 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  23.85 
 
 		 369 aa  82  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  23.85 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  23.45 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  23.43 
 
 		 369 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  23.32 
 
 		 652 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  22.19 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  21.86 
 
 		 375 aa  72.8  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  23.08 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1370  FAD dependent oxidoreductase  22.05 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  21.69 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  21.63 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  21.41 
 
 		 371 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  21.63 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  21.2 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  22.25 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  21.41 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  22.35 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  20.92 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  20.92 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  20.92 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  20.6 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  22.51 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  22.5 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  21.49 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  23.68 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  20.51 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  26.01 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  20.68 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  20.44 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  19.72 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  21.01 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  19.41 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  27.14 
 
 		 360 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  21.76 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  21.88 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  21.88 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  19.34 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  22.35 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  25.81 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  21.04 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  20.62 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  22.81 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  23.83 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  23.22 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  20.51 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  20.81 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  19.83 
 
 		 379 aa  55.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1124  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.36 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.548821 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  20 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  18.55 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  21.16 
 
 		 960 aa  55.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 		 365 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  24.75 
 
 		 366 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 365 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  20.29 
 
 		 666 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  20.29 
 
 		 666 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 		 383 aa  53.1  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 		 365 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  19.1 
 
 		 367 aa  52.8  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2587  D-amino-acid dehydrogenase  17.62 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.227233 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  25.11 
 
 		 371 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  20.77 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1523  hypothetical protein  23.37 
 
 		 356 aa  51.2  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1221  D-amino-acid dehydrogenase  17.62 
 
 		 415 aa  51.2  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  17.67 
 
 		 410 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  20.77 
 
 		 375 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  19.26 
 
 		 375 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1748  glycine oxidase  21.41 
 
 		 340 aa  50.8  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0438  glycine oxidase ThiO  21.41 
 
 		 340 aa  50.8  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017801  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  19.3 
 
 		 388 aa  50.4  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8303  D-nopaline dehydrogenase  23.95 
 
 		 356 aa  50.1  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.039629  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  20.94 
 
 		 378 aa  50.1  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  19.26 
 
 		 375 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4020  FAD dependent oxidoreductase  19.9 
 
 		 429 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.471109  normal  0.716709 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  26.14 
 
 		 365 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>