186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4109 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 
351 aa  704    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  42.46 
 
 
412 aa  285  5.999999999999999e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  42.42 
 
 
376 aa  273  4.0000000000000004e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  38.4 
 
 
354 aa  261  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  38.22 
 
 
373 aa  253  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3396  hypothetical protein  36.89 
 
 
354 aa  250  3e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  37.07 
 
 
355 aa  249  6e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  37.25 
 
 
353 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  36.78 
 
 
355 aa  247  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3077  hypothetical protein  36.31 
 
 
354 aa  247  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  36.89 
 
 
355 aa  246  6e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3408  hypothetical protein  37.18 
 
 
355 aa  245  9e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  39.2 
 
 
349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3176  hypothetical protein  37.36 
 
 
355 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3427  hypothetical protein  37.36 
 
 
353 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  36.1 
 
 
376 aa  242  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  36.21 
 
 
355 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  39.6 
 
 
348 aa  241  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  36.96 
 
 
370 aa  236  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  36.54 
 
 
372 aa  235  8e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  37.64 
 
 
411 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  37.64 
 
 
411 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  37.36 
 
 
391 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  37.36 
 
 
391 aa  229  7e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  37.36 
 
 
391 aa  229  7e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  37.36 
 
 
411 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  37.36 
 
 
411 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  36.81 
 
 
411 aa  227  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  36.77 
 
 
414 aa  225  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  36.89 
 
 
385 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2410  6-phosphogluconolactonase  32.37 
 
 
352 aa  222  8e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.687945  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6877  6-phosphogluconolactonase  38.62 
 
 
414 aa  222  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0754245  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6187  6-phosphogluconolactonase  38.92 
 
 
350 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  36.49 
 
 
414 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  42.12 
 
 
350 aa  219  3.9999999999999997e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09550  hypothetical protein  38.19 
 
 
388 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  36.49 
 
 
415 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  36.49 
 
 
415 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  36.49 
 
 
415 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  37.28 
 
 
375 aa  216  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  35.65 
 
 
385 aa  215  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0894  hypothetical protein  38.25 
 
 
388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27450  3-carboxymuconate cyclase  35.47 
 
 
363 aa  213  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97504  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  36.02 
 
 
368 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  35.5 
 
 
404 aa  212  7e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  39.94 
 
 
410 aa  212  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  35.47 
 
 
415 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  34.63 
 
 
431 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  32.47 
 
 
353 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  35.47 
 
 
415 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1712  hypothetical protein  33.51 
 
 
394 aa  205  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1875  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3222  hypothetical protein  35.62 
 
 
391 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545614  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2467  hypothetical protein  39.04 
 
 
351 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3768  hypothetical protein  33.24 
 
 
390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1553  hypothetical protein  36.84 
 
 
380 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0578  6-phosphogluconolactonase  33.14 
 
 
342 aa  199  7e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0130  putative 6-phosphogluconolactonase  33.24 
 
 
414 aa  199  7.999999999999999e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0539919 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  35.96 
 
 
372 aa  196  5.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1585  hypothetical protein  40.56 
 
 
345 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1581  6-phosphogluconolactonase  36.67 
 
 
376 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2021  hypothetical protein  33.89 
 
 
376 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145054  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3721  hypothetical protein  33.89 
 
 
380 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324641  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3976  hypothetical protein  39.54 
 
 
353 aa  192  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3411  putative hemagglutinin-related protein  42.9 
 
 
354 aa  192  8e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4700  6-phosphogluconolactonase  32.19 
 
 
374 aa  189  5.999999999999999e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2456  hypothetical protein  34.01 
 
 
341 aa  187  3e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000113329  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0768  3-carboxymuconate cyclase-like protein  28.82 
 
 
338 aa  186  4e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00750799  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0450  6-phosphogluconolactonase  33.7 
 
 
384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3874  putative hemagglutinin-related protein  36.39 
 
 
351 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.978185  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0049  putative hemaggltinin-related protein  34.76 
 
 
418 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3924  hypothetical protein  38.52 
 
 
410 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1157  3-carboxymuconate cyclase  32.28 
 
 
338 aa  177  3e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3595  hypothetical protein  38.05 
 
 
379 aa  176  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0432  putative cycloisomerase  33.89 
 
 
381 aa  175  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3701  6-phosphogluconolactonase  33.99 
 
 
412 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0656  3-carboxymuconate cyclase  31.52 
 
 
342 aa  171  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.702044  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1457  hypothetical protein  30.48 
 
 
342 aa  170  4e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0718826  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1232  hypothetical protein  27.79 
 
 
339 aa  168  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0395677  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3378  putative hemaggltinin-related protein  33.43 
 
 
412 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1978  hypothetical protein  30.55 
 
 
342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2011  hypothetical protein  30.55 
 
 
342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1041  hypothetical protein  27.89 
 
 
339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00230518  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06344  6-phosphogluconolactonase  33.8 
 
 
348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6297  hypothetical protein  33.43 
 
 
367 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5389  3-carboxymuconate cyclase-like protein  36.46 
 
 
361 aa  159  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2650  3-carboxymuconate cyclase  36.33 
 
 
328 aa  159  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2315  putative secreted protein  35.61 
 
 
353 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946326  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4552  putative hemagglutinin-related protein  35.14 
 
 
369 aa  155  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.846091  normal  0.748883 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001405  hypothetical protein  32.48 
 
 
344 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2494  hypothetical protein  30.37 
 
 
377 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2765  hypothetical protein  30.61 
 
 
359 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122713  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1349  6-phosphogluconolactonase  29.48 
 
 
340 aa  142  7e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000593187  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1718  6-phosphogluconolactonase  32.01 
 
 
363 aa  139  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.042506  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2379  6-phosphogluconolactonase  33.43 
 
 
352 aa  137  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.799827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0501  Domain of unknown function DUF2394  32.85 
 
 
365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0647  Domain of unknown function DUF2394  33.42 
 
 
366 aa  134  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0296594  hitchhiker  0.00133017 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2830  6-phosphogluconolactonase  30.09 
 
 
380 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.382874  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31940  3-carboxymuconate cyclase  32.8 
 
 
368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1280  6-phosphogluconolactonase  29.87 
 
 
332 aa  126  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2566  hypothetical protein  32.9 
 
 
332 aa  124  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>