More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3751 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  48.14 
 
 		 823 aa  727    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  43.22 
 
 		 871 aa  644    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  42.2 
 
 		 869 aa  651    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  41.98 
 
 		 869 aa  645    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  43.09 
 
 		 870 aa  662    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  42.67 
 
 		 872 aa  664    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  42.23 
 
 		 872 aa  645    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3751  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 855 aa  1739    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  44.68 
 
 		 891 aa  635    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  43.72 
 
 		 870 aa  674    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  42.84 
 
 		 870 aa  646    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  44.39 
 
 		 872 aa  665    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  44.37 
 
 		 889 aa  667    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  45.58 
 
 		 868 aa  644    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  40.31 
 
 		 932 aa  635  1e-180  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  41.39 
 
 		 873 aa  630  1e-179  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  41.67 
 
 		 896 aa  628  1e-178  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  41.87 
 
 		 900 aa  624  1e-177  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  41.94 
 
 		 872 aa  624  1e-177  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  42.67 
 
 		 862 aa  620  1e-176  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  39.98 
 
 		 863 aa  617  1e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  42.72 
 
 		 875 aa  614  9.999999999999999e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  42.23 
 
 		 881 aa  610  1e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  42.07 
 
 		 882 aa  610  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  44.26 
 
 		 880 aa  602  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  42.17 
 
 		 853 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  39.62 
 
 		 867 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  42.76 
 
 		 910 aa  600  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  41.42 
 
 		 871 aa  600  1e-170  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  43.57 
 
 		 898 aa  602  1e-170  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  42.58 
 
 		 910 aa  601  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0142  DNA mismatch repair protein MutS  42.76 
 
 		 898 aa  600  1e-170  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  43.49 
 
 		 863 aa  601  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  40.95 
 
 		 872 aa  599  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  38.71 
 
 		 869 aa  600  1e-170  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  42.05 
 
 		 897 aa  598  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  41.26 
 
 		 859 aa  596  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  42.81 
 
 		 855 aa  593  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  41.05 
 
 		 873 aa  594  1e-168  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0047  DNA mismatch repair protein MutS  44.09 
 
 		 908 aa  593  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3466  DNA mismatch repair protein MutS  44.54 
 
 		 877 aa  592  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  41.56 
 
 		 855 aa  592  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  41.56 
 
 		 855 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  40.37 
 
 		 858 aa  592  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  41.79 
 
 		 855 aa  589  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  39.54 
 
 		 837 aa  591  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  44.29 
 
 		 881 aa  590  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  38.35 
 
 		 910 aa  590  1e-167  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  38.4 
 
 		 910 aa  591  1e-167  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  44.35 
 
 		 850 aa  588  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0032  DNA mismatch repair protein MutS  44.23 
 
 		 880 aa  588  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  41.56 
 
 		 859 aa  586  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  40.62 
 
 		 928 aa  587  1e-166  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  39.28 
 
 		 864 aa  587  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  38.87 
 
 		 887 aa  587  1e-166  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  40.9 
 
 		 888 aa  588  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  39.3 
 
 		 863 aa  588  1e-166  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  41.13 
 
 		 857 aa  588  1e-166  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  40.05 
 
 		 891 aa  583  1.0000000000000001e-165  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  40.67 
 
 		 888 aa  585  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  40.82 
 
 		 868 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  38.64 
 
 		 894 aa  583  1.0000000000000001e-165  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  41.6 
 
 		 860 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  38.36 
 
 		 860 aa  583  1.0000000000000001e-165  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  42 
 
 		 857 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  38.55 
 
 		 858 aa  582  1e-164  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  38.59 
 
 		 855 aa  581  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  41.7 
 
 		 872 aa  579  1e-164  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  43.69 
 
 		 882 aa  579  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  42 
 
 		 857 aa  582  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0423  DNA mismatch repair protein MutS  42.4 
 
 		 883 aa  580  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  45.04 
 
 		 882 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  43.56 
 
 		 872 aa  582  1e-164  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  40.19 
 
 		 878 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2157  DNA mismatch repair protein MutS  45.22 
 
 		 882 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.404203  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  41.53 
 
 		 874 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  42 
 
 		 880 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2247  DNA mismatch repair protein MutS  44.99 
 
 		 882 aa  575  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136567  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  41.49 
 
 		 854 aa  575  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  39.6 
 
 		 892 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0363  DNA mismatch repair protein MutS  42.76 
 
 		 882 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  40.76 
 
 		 885 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0174  DNA mismatch repair protein MutS  39.52 
 
 		 820 aa  571  1e-161  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  39.29 
 
 		 858 aa  572  1e-161  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  38.7 
 
 		 858 aa  569  1e-161  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  44.28 
 
 		 882 aa  572  1e-161  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0528  DNA mismatch repair protein MutS  42.15 
 
 		 911 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0799066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  39.02 
 
 		 856 aa  571  1e-161  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  41.79 
 
 		 857 aa  572  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  37.64 
 
 		 804 aa  568  1e-160  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  38.24 
 
 		 860 aa  565  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  39.74 
 
 		 887 aa  566  1e-160  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0614  DNA mismatch repair protein MutS  42.37 
 
 		 907 aa  566  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0030  DNA mismatch repair protein MutS  43.62 
 
 		 915 aa  566  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355609 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  40.05 
 
 		 861 aa  568  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  38.97 
 
 		 881 aa  568  1e-160  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  40.5 
 
 		 874 aa  566  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  40.96 
 
 		 864 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0513  DNA mismatch repair protein MutS  41.84 
 
 		 907 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  38.99 
 
 		 856 aa  563  1.0000000000000001e-159  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>