More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3348 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
241 aa  483  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.612268  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.57 
 
 
242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00878668  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1474  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  34.22 
 
 
246 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.45819  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2852  putative oxidoreductase protein  40.1 
 
 
264 aa  119  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.91402  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0163958 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0745  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase NodG  38.86 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451524  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1386  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.04 
 
 
258 aa  111  8.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1200  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase NodG  38.1 
 
 
245 aa  111  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354003  hitchhiker  0.00226725 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1572  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.17 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1576  putative D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase (BDH) oxidoreductase protein  35 
 
 
260 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1528  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase NodG  37.62 
 
 
245 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.150562  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2355  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39 
 
 
288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 
233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1057  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase NodG  37.62 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0775551 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3138  oxidoreductase protein  36.79 
 
 
262 aa  109  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.77 
 
 
235 aa  110  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
266 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.30636 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
229 aa  108  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 
278 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1651  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.34 
 
 
259 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.787332  normal  0.0473698 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1981  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.34 
 
 
259 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0575  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.91 
 
 
258 aa  106  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
274 aa  105  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.686827  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0980  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.05 
 
 
238 aa  105  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633587  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 
265 aa  105  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.17 
 
 
239 aa  105  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475837  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1972  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.49 
 
 
255 aa  105  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336427  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 
260 aa  105  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0372  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.35 
 
 
250 aa  105  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0528215 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1897  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.19 
 
 
256 aa  105  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0333934 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1768  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase NodG  35.71 
 
 
245 aa  105  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.323162  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 
255 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.432373 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 
262 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.36 
 
 
238 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1751  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.07 
 
 
257 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.56 
 
 
264 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0546  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.62 
 
 
258 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346829 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2585  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.49 
 
 
256 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102816  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0657  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 
292 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.65557 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  37.44 
 
 
255 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 
265 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.542454 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4708  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.14 
 
 
279 aa  102  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.270996  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 
263 aa  102  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0549693 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2157  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 
252 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166791  normal  0.301941 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0814  putative short-chain dehydrogenase/reductase  33.99 
 
 
257 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.968056 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12520  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  36.79 
 
 
263 aa  102  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
249 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.476786  normal  0.058074 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1156  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.49 
 
 
258 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1122  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.06 
 
 
263 aa  102  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0416  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.97 
 
 
245 aa  102  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11510  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
264 aa  102  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0610  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.75 
 
 
268 aa  102  8e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0701  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.18 
 
 
247 aa  101  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000555171 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1769  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.9 
 
 
245 aa  101  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14190  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  38.97 
 
 
264 aa  101  9e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.785349  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 
266 aa  101  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
266 aa  101  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3449  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 
263 aa  101  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.95 
 
 
254 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.51 
 
 
266 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197141 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2857  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.23 
 
 
265 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4347  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.68 
 
 
247 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.296553  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
236 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 
264 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.53126  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.95 
 
 
254 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3166  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.04 
 
 
266 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.65 
 
 
251 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383425 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
236 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497428  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1874  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.88 
 
 
245 aa  101  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00756891  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1779  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, putative  30.64 
 
 
263 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.13 
 
 
224 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38394  predicted protein  33.98 
 
 
276 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00142595  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.06 
 
 
257 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3784  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 
264 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0333055  hitchhiker  0.00262398 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 
239 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2801  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 
248 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1187  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 
256 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.206395 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1607  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
248 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000319104  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.43 
 
 
263 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.622858  normal  0.939609 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 
264 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4500  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.88 
 
 
258 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2069  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.33 
 
 
256 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343315  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1507  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.26 
 
 
257 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0183743 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 
292 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 
347 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 
292 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1277  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  35.71 
 
 
247 aa  100  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.038158  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0458  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.3 
 
 
245 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 
249 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.012898 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1436  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.82 
 
 
257 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798692 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1505  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
286 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 
285 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136189  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4355  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.56 
 
 
256 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.3 
 
 
245 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.82564  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.24 
 
 
225 aa  99.4  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
247 aa  99.4  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.474555  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1680  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.77 
 
 
252 aa  99.8  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.509013  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_5780  predicted protein  34.54 
 
 
194 aa  99.8  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.155733  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1951  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.67 
 
 
247 aa  99.8  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262535 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>