More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1708 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1708  NusB antitermination factor  100 
 
 		 147 aa  298  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1622  NusB antitermination factor  41.55 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  44.12 
 
 		 138 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  45.74 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  38.3 
 
 		 145 aa  104  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  38.3 
 
 		 145 aa  103  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  39.71 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  39.84 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1860  NusB antitermination factor  38.85 
 
 		 153 aa  100  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  38.69 
 
 		 154 aa  100  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  40.74 
 
 		 143 aa  100  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  40.15 
 
 		 145 aa  100  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  40.58 
 
 		 147 aa  99.4  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  37.14 
 
 		 148 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  36.57 
 
 		 138 aa  94.7  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  31.11 
 
 		 154 aa  94.4  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  38.66 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  38.06 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1657  transcription antitermination protein NusB  36.09 
 
 		 136 aa  91.3  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  34.65 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  40 
 
 		 151 aa  89.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  38.24 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  35.82 
 
 		 136 aa  88.6  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  45.12 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  38.58 
 
 		 156 aa  87.8  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  34.59 
 
 		 130 aa  87.8  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1185  transcription antitermination protein NusB  47.19 
 
 		 138 aa  87.8  5e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0066267  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  37.67 
 
 		 183 aa  87  7e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  35.66 
 
 		 143 aa  86.7  9e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  32.62 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  43.43 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  33.33 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1850  transcription antitermination factor NusB  35.07 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  42.27 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  42.27 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  37.08 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  42.27 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  42.57 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  33.59 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  42.27 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  38.2 
 
 		 139 aa  84  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  31.85 
 
 		 130 aa  84  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  36.96 
 
 		 165 aa  84  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  31.85 
 
 		 130 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  31.85 
 
 		 130 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  33.82 
 
 		 140 aa  83.6  8e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  35.66 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  35.66 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  31.85 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  31.85 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  31.85 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  31.85 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  31.85 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  31.85 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  31.85 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  32.37 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  33.86 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1085  transcription antitermination protein NusB  37.98 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.770091  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1988  NusB antitermination factor  44.21 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  37.21 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1616  NusB antitermination factor  39.2 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.686883  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  37.21 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  37.4 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0459  NusB antitermination factor  35 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.730016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0496  NusB antitermination factor  45.24 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  43.96 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  33.08 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  33.87 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0505  NusB antitermination factor  46.51 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0417  NusB antitermination factor  41.76 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  34.97 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  32.09 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  35.96 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4924  NusB antitermination factor  40.43 
 
 		 388 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1020  transcription antitermination protein NusB  34.11 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0554704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1679  NusB antitermination factor  38.68 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  34.85 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0722  transcription termination factor  42.55 
 
 		 325 aa  77.8  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4342  transcription antitermination protein NusB  40.82 
 
 		 209 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  41.03 
 
 		 162 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  41.03 
 
 		 162 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  41.03 
 
 		 162 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  34.23 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1563  NusB antitermination factor  36.5 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01170  transcription antitermination protein NusB  31.29 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1039  transcription antitermination protein NusB  32.31 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000044365  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0424  NusB antitermination factor  38.14 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.518961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2418  transcription antitermination factor NusB  33.07 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0470  NusB antitermination factor  34.78 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.246877  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0807  NusB family protein  44.32 
 
 		 364 aa  75.9  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1191  transcription antitermination protein NusB  33.08 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000719059  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004261  transcription termination protein NusB  31.69 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00012061  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1277  transcription antitermination protein NusB  33.82 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000199863  unclonable  0.0000000000534165 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1043  NusB antitermination factor  34.4 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310425  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1444  NusB antitermination factor  30.3 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4458  transcription antitermination protein NusB  33.81 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12640  transcription antitermination factor NusB  31.25 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0196868  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  38.27 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1315  transcription antitermination protein NusB  34.11 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>