More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0424 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0424  NusB antitermination factor  100 
 
 		 294 aa  595  1e-169  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.518961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1708  NusB antitermination factor  38.14 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  39.02 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  39.02 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  39.02 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1391  NusB antitermination factor  43.75 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.243809  normal  0.057141 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  42.05 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  40.23 
 
 		 145 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1002  NusB antitermination factor  28.97 
 
 		 151 aa  73.9  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  36.84 
 
 		 156 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  40.74 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12640  NusB antitermination factor  41.67 
 
 		 137 aa  73.6  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0537288 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  33.94 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  33.94 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  40 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  34.86 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0342122 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  43.42 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  33.94 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12640  transcription antitermination factor NusB  35.34 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0196868  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  36.59 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  38.3 
 
 		 143 aa  72  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  41.25 
 
 		 138 aa  72  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  33.94 
 
 		 130 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  33.94 
 
 		 130 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  33.94 
 
 		 130 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  33.94 
 
 		 130 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  33.94 
 
 		 130 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  33.94 
 
 		 130 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  38.2 
 
 		 143 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1657  transcription antitermination protein NusB  44.29 
 
 		 136 aa  71.2  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2006  NusB antitermination factor  38.96 
 
 		 136 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000909018 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  32.69 
 
 		 142 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  43.42 
 
 		 142 aa  70.5  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  36.25 
 
 		 145 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  36.78 
 
 		 155 aa  70.5  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  38.55 
 
 		 143 aa  70.9  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  38.75 
 
 		 130 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  41.03 
 
 		 141 aa  70.9  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2854  transcription antitermination factor NusB  41.25 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026824  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0403  transcription antitermination protein NusB  43.02 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  33.94 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04396  transcription antitermination protein NusB  46.25 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371265  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  37.76 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  33.33 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  32.99 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  34.12 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2269  NusB antitermination factor  48.57 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  40.96 
 
 		 139 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  40.54 
 
 		 165 aa  68.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  38.37 
 
 		 153 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  31.11 
 
 		 154 aa  68.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  34.95 
 
 		 145 aa  68.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3008  NusB antitermination factor  37.78 
 
 		 136 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3601  transcription antitermination factor NusB  39.39 
 
 		 163 aa  67.8  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  36.84 
 
 		 145 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0164  NusB antitermination factor  42.86 
 
 		 165 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  46.58 
 
 		 140 aa  67.4  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0422  hypothetical protein  31.78 
 
 		 378 aa  67  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1315  transcription antitermination protein NusB  45.12 
 
 		 140 aa  67  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0431  transcription antitermination protein NusB  42.68 
 
 		 132 aa  67  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.232136  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0405  transcription antitermination protein NusB  41.38 
 
 		 132 aa  67  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1531  transcription antitermination protein NusB  37.37 
 
 		 160 aa  67  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0468647  normal  0.834868 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1747  transcription antitermination factor NusB  42.11 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  37.62 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  37.62 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  36.46 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1844  transcription antitermination protein NusB  50 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  37.93 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  37.62 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  38.37 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  35.71 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1904  transcription antitermination protein NusB  50 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  35.23 
 
 		 145 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0880  NusB antitermination factor  36.59 
 
 		 137 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  33.93 
 
 		 154 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  43.06 
 
 		 129 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  43.06 
 
 		 129 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  36.67 
 
 		 135 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  36.67 
 
 		 135 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1333  transcription antitermination protein NusB  43.53 
 
 		 131 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1576  transcription antitermination protein NusB  39.08 
 
 		 132 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2032  NusB antitermination factor  45.71 
 
 		 153 aa  64.3  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17920  NusB antitermination factor  34.34 
 
 		 138 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  34.38 
 
 		 146 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0698  NusB antitermination factor  36.78 
 
 		 169 aa  65.1  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0030  transcription antitermination protein NusB  36.78 
 
 		 131 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  36.9 
 
 		 138 aa  64.3  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2418  transcription antitermination factor NusB  35.29 
 
 		 135 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  35.29 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  31.96 
 
 		 130 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  34.52 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  38.27 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  39.29 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1085  transcription antitermination protein NusB  39.44 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.770091  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  41.43 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0822  transcription antitermination protein NusB  36.14 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.932634  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  30.77 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  37.5 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3146  NusB antitermination factor  40 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>