60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1392 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1392  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 		 315 aa  659    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2154  Alpha-N-arabinofuranosidase  67.3 
 
 		 315 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0709531  normal  0.0185421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2053  Alpha-N-arabinofuranosidase  66.98 
 
 		 315 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0777  ribosomal protein L11 methyltransferase  66.35 
 
 		 314 aa  434  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4015  Alpha-N-arabinofuranosidase  60.59 
 
 		 316 aa  386  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.374265 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  58.44 
 
 		 648 aa  365  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  52.77 
 
 		 580 aa  352  5e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0787  Alpha-L-arabinofuranosidase  57.7 
 
 		 362 aa  347  1e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000245228  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  55.52 
 
 		 316 aa  346  2e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  54.4 
 
 		 505 aa  345  6e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  56.31 
 
 		 316 aa  345  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0162  alpha-N-arabinofuranosidase 2  55.99 
 
 		 316 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0160  alpha-N-arabinofuranosidase 2  55.99 
 
 		 316 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  55.99 
 
 		 316 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  55.99 
 
 		 316 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1990  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.92 
 
 		 378 aa  334  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1984  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.92 
 
 		 378 aa  333  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1547  putative beta-xylosidase  53.75 
 
 		 344 aa  330  1e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000631807  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2077  glycoside hydrolase family protein  53.47 
 
 		 377 aa  329  3e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183532 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  52.06 
 
 		 341 aa  324  1e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03050  predicted beta-xylosidase  52.23 
 
 		 340 aa  322  4e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2055  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.5 
 
 		 369 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2151  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.83 
 
 		 392 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923723  normal  0.103273 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.16 
 
 		 426 aa  297  1e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2078  glycoside hydrolase family protein  46.79 
 
 		 333 aa  294  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000171617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1991  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.48 
 
 		 333 aa  293  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535361  hitchhiker  0.0025818 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1983  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.48 
 
 		 333 aa  293  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131157  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.22 
 
 		 340 aa  209  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.18 
 
 		 350 aa  203  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3081  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.27 
 
 		 347 aa  195  9e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.174999 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.38 
 
 		 355 aa  190  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2025  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.03 
 
 		 376 aa  186  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.620669  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.15 
 
 		 507 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  32.7 
 
 		 355 aa  150  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02533  glycosyl hydrolase, family 43, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01660)  35.86 
 
 		 329 aa  149  6e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.57 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  30.82 
 
 		 2073 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  31.23 
 
 		 349 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.66 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.04 
 
 		 466 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2083  glycoside hydrolase family protein  28.85 
 
 		 634 aa  132  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179948  decreased coverage  0.0000000321687 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  30.82 
 
 		 502 aa  132  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1979  glycoside hydrolase family protein  28.85 
 
 		 634 aa  132  9e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00334232  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1996  glycoside hydrolase family protein  28.85 
 
 		 634 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718487  hitchhiker  0.0000398389 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.28 
 
 		 628 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  30.25 
 
 		 607 aa  129  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  29.34 
 
 		 627 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000434172  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1544  putative beta-xylosidase  25.56 
 
 		 710 aa  82  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.099307  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  27.1 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4199  glycoside hydrolase family 43  23.3 
 
 		 1278 aa  67  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  27.16 
 
 		 713 aa  66.6  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  27.78 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  26.09 
 
 		 699 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  25.75 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  26.83 
 
 		 334 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  23.24 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 384 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  26.17 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  25.59 
 
 		 340 aa  47  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  23.25 
 
 		 495 aa  42.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>