More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0867 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 558 aa  1131    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  43.94 
 
 		 593 aa  408  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  43.81 
 
 		 595 aa  404  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  39.81 
 
 		 583 aa  360  5e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  42.95 
 
 		 545 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  42.58 
 
 		 588 aa  327  5e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  42.09 
 
 		 541 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  41.84 
 
 		 541 aa  323  7e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  34.2 
 
 		 499 aa  289  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  37.18 
 
 		 654 aa  288  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  36.67 
 
 		 522 aa  268  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  35.96 
 
 		 515 aa  266  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  35.53 
 
 		 509 aa  262  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  32.97 
 
 		 493 aa  248  1e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  33.4 
 
 		 1088 aa  236  9e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  33.4 
 
 		 1088 aa  236  9e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  33.01 
 
 		 1088 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3310  alpha amylase, catalytic region  35.96 
 
 		 575 aa  234  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4167  alpha amylase catalytic region  35.13 
 
 		 574 aa  233  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.718668  hitchhiker  0.00459901 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  32.49 
 
 		 1139 aa  233  6e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  32.02 
 
 		 1110 aa  231  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  34.7 
 
 		 549 aa  230  4e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  33.14 
 
 		 1092 aa  230  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  32.74 
 
 		 1108 aa  229  7e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  32.36 
 
 		 1088 aa  229  9e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4138  alpha amylase catalytic region  35.18 
 
 		 541 aa  229  9e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  30.97 
 
 		 1113 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  34.1 
 
 		 575 aa  228  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  32.95 
 
 		 1115 aa  227  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  32.87 
 
 		 1119 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  33.27 
 
 		 548 aa  224  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  32.16 
 
 		 1088 aa  223  6e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  32.23 
 
 		 591 aa  223  7e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  32.69 
 
 		 551 aa  223  9e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  32.41 
 
 		 1108 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  32.22 
 
 		 1085 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1728  trehalose synthase  32.5 
 
 		 585 aa  221  3.9999999999999997e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  31.63 
 
 		 1121 aa  220  5e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  31.77 
 
 		 1123 aa  220  7e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  31.95 
 
 		 1111 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0589  glycosidases-like  31.24 
 
 		 705 aa  219  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.361866  normal  0.0110561 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1849  alpha-amylase  31.31 
 
 		 524 aa  219  1e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  32.21 
 
 		 1101 aa  219  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4101  trehalose synthase  32.33 
 
 		 610 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  30.98 
 
 		 1112 aa  217  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  31.01 
 
 		 1100 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  32.81 
 
 		 551 aa  217  5.9999999999999996e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1172  alpha amylase domain-containing protein  33.08 
 
 		 1095 aa  217  5.9999999999999996e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1096  trehalose synthase  32.44 
 
 		 587 aa  216  8e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  31.91 
 
 		 601 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  32.12 
 
 		 571 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  32.16 
 
 		 556 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  32.83 
 
 		 1094 aa  215  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  32.11 
 
 		 606 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  32.12 
 
 		 1100 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1837  alpha amylase domain-containing protein  32.19 
 
 		 557 aa  214  3.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0498  alpha amylase domain-containing protein  32.05 
 
 		 553 aa  214  3.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.383316  normal  0.0360992 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  30.5 
 
 		 1116 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10330  trehalose synthase  32.24 
 
 		 588 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  30.69 
 
 		 1100 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  30.95 
 
 		 1088 aa  214  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  30.5 
 
 		 1116 aa  213  7e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  30.75 
 
 		 567 aa  213  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2310  trehalose synthase  33.07 
 
 		 1098 aa  213  7.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.178439  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  29.85 
 
 		 562 aa  213  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  29.37 
 
 		 1114 aa  213  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  30.89 
 
 		 1100 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  31.62 
 
 		 1130 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  31.75 
 
 		 1094 aa  212  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  31.68 
 
 		 1099 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  32.95 
 
 		 1105 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  32.94 
 
 		 540 aa  210  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  33.14 
 
 		 598 aa  210  6e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2978  alpha amylase, catalytic region  30.24 
 
 		 548 aa  210  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.533119  normal  0.0820165 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  32.17 
 
 		 556 aa  210  7e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  32.38 
 
 		 1106 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  32.38 
 
 		 1106 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  31.13 
 
 		 1104 aa  209  9e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  31.21 
 
 		 682 aa  209  9e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  31.32 
 
 		 1100 aa  209  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0035  trehalose synthase  32.35 
 
 		 1109 aa  209  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  30.83 
 
 		 1121 aa  208  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  32.19 
 
 		 1106 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  31.38 
 
 		 1099 aa  208  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  29.23 
 
 		 557 aa  207  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  31.5 
 
 		 572 aa  208  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  32.29 
 
 		 596 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  32.29 
 
 		 596 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  32.29 
 
 		 596 aa  208  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  30.93 
 
 		 1121 aa  207  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2596  alpha amylase, catalytic region  29.53 
 
 		 558 aa  207  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  31.49 
 
 		 1154 aa  207  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  31.95 
 
 		 1100 aa  207  5e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  30.16 
 
 		 577 aa  207  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0738  trehalose synthase  32.63 
 
 		 598 aa  207  5e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  31.77 
 
 		 572 aa  206  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  31.18 
 
 		 1098 aa  206  7e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  31.08 
 
 		 1102 aa  206  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0937  alpha amylase domain-containing protein  29.33 
 
 		 548 aa  206  8e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  30.51 
 
 		 553 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>