More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0269 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1998  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.93 
 
 		 563 aa  685    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.237018  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.51 
 
 		 559 aa  755    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2845  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.43 
 
 		 559 aa  718    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.493421  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.8 
 
 		 555 aa  660    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0809  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.47 
 
 		 560 aa  724    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.62 
 
 		 557 aa  650    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.98 
 
 		 557 aa  653    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1466  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.1 
 
 		 558 aa  754    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000105508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.15 
 
 		 558 aa  714    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406197  hitchhiker  0.00000247304 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0269  putative ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 561 aa  1151    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0661  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.5 
 
 		 560 aa  724    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1687  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.9 
 
 		 557 aa  637    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00296418  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5309  ABC transporter related protein  57.71 
 
 		 559 aa  649    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.12 
 
 		 561 aa  772    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.15 
 
 		 558 aa  743    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2495  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.24 
 
 		 558 aa  735    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2991  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.77 
 
 		 559 aa  736    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.69 
 
 		 559 aa  753    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.76 
 
 		 561 aa  764    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.95 
 
 		 561 aa  728    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.73 
 
 		 556 aa  645    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.11 
 
 		 559 aa  656    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5234  ABC transporter related protein  63.83 
 
 		 555 aa  737    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2580  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.65 
 
 		 560 aa  763    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.471915  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3426  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.76 
 
 		 561 aa  764    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1448  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.23 
 
 		 555 aa  665    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391667  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4119  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.84 
 
 		 555 aa  719    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1058  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.68 
 
 		 560 aa  733    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08326  putative ATP-binding component of ABC transporter  56.35 
 
 		 564 aa  658    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0893  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.73 
 
 		 560 aa  717    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.100195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.76 
 
 		 561 aa  759    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.03 
 
 		 556 aa  716    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2916  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.27 
 
 		 563 aa  664    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0621526  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.52 
 
 		 551 aa  641    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.8 
 
 		 555 aa  662    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1002  ABC transporter related protein  57.76 
 
 		 551 aa  638    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.856091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1137  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.25 
 
 		 560 aa  725    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000210355  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.15 
 
 		 561 aa  755    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.86 
 
 		 559 aa  744    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6251  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.3 
 
 		 549 aa  635    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.223769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1013  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.89 
 
 		 555 aa  635    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2460  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.11 
 
 		 559 aa  637    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.561949  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3414  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.51 
 
 		 555 aa  641    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2147  ABC transporter related protein  56.36 
 
 		 558 aa  632  1e-180  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0877  ABC transporter related protein  55.43 
 
 		 555 aa  632  1e-180  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1183  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.7 
 
 		 554 aa  632  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.976373 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.89 
 
 		 555 aa  632  1e-180  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1093  putative ABC transporter ATP-binding protein  55 
 
 		 555 aa  633  1e-180  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.53945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1159  putative ABC transporter ATP-binding protein  55 
 
 		 555 aa  633  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1093  putative ABC transporter ATP-binding protein  55 
 
 		 555 aa  632  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3472  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.64 
 
 		 555 aa  629  1e-179  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.16 
 
 		 551 aa  630  1e-179  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1032  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.33 
 
 		 555 aa  629  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144291  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2152  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.58 
 
 		 556 aa  629  1e-179  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875259  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6356  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.55 
 
 		 550 aa  628  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.109322 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1864  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.36 
 
 		 560 aa  629  1e-179  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.733773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2781  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.92 
 
 		 555 aa  629  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.957442  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2392  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.63 
 
 		 551 aa  625  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.935698  normal  0.570925 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.35 
 
 		 551 aa  625  1e-178  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.35 
 
 		 551 aa  625  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.14 
 
 		 550 aa  625  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.08 
 
 		 559 aa  626  1e-178  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7137  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.83 
 
 		 550 aa  625  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.52 
 
 		 551 aa  627  1e-178  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0840  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.35 
 
 		 553 aa  625  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.35 
 
 		 551 aa  624  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1919  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.3 
 
 		 549 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1141  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.97 
 
 		 555 aa  623  1e-177  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776403  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3221  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.74 
 
 		 589 aa  621  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.87 
 
 		 670 aa  624  1e-177  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2891  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.7 
 
 		 559 aa  624  1e-177  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.315278  decreased coverage  0.00408651 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.89 
 
 		 559 aa  623  1e-177  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1208  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.38 
 
 		 555 aa  620  1e-176  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1060  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.17 
 
 		 554 aa  618  1e-176  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298194  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3162  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.38 
 
 		 555 aa  620  1e-176  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.322679  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1379  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.61 
 
 		 554 aa  620  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.621698  hitchhiker  0.000163615 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2810  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.38 
 
 		 555 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2485  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.63 
 
 		 550 aa  619  1e-176  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.445071  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3163  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.38 
 
 		 555 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2911  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.01 
 
 		 550 aa  618  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.608005  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0229  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.38 
 
 		 555 aa  620  1e-176  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4129  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.94 
 
 		 549 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3306  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.38 
 
 		 555 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3883  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.71 
 
 		 559 aa  615  1e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3489  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.35 
 
 		 555 aa  616  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3159  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.38 
 
 		 555 aa  618  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146292 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0889  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.38 
 
 		 554 aa  617  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3618  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.35 
 
 		 555 aa  616  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3452  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.58 
 
 		 549 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.747993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2033  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.94 
 
 		 549 aa  617  1e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0372  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.35 
 
 		 556 aa  616  1e-175  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.56 
 
 		 555 aa  615  1e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1270  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.25 
 
 		 555 aa  617  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158997 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2913  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.26 
 
 		 555 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.010089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3581  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.29 
 
 		 555 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.078032  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0510  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.29 
 
 		 555 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3595  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.29 
 
 		 555 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.431194  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3678  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.45 
 
 		 555 aa  613  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0668  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.29 
 
 		 555 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0822  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.17 
 
 		 555 aa  612  9.999999999999999e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>