More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_41967 on replicon NC_009371
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009371  OSTLU_41967  predicted protein  100 
 
 
235 aa  486  1e-136  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.296814  normal  0.0690197 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00420  sister chromatid cohesion-related protein, putative  43.93 
 
 
892 aa  199  3e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45690  predicted protein  39.76 
 
 
1015 aa  171  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136558  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06694  Chromosome transmission fidelity protein 18 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C1D3]  37.88 
 
 
993 aa  102  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0563098 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  29.26 
 
 
418 aa  98.2  9e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2009  replication factor C large subunit  30.6 
 
 
422 aa  97.4  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0003  replication factor C large subunit  29.31 
 
 
422 aa  95.5  6e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0266  replication factor C large subunit  27.31 
 
 
413 aa  94  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0657  replication factor C large subunit  28.7 
 
 
423 aa  90.9  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  hitchhiker  0.00784495 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48947  predicted protein  26.85 
 
 
725 aa  87.8  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00599657 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0004  replication factor C large subunit  27.51 
 
 
421 aa  87  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01320  purine nucleotide binding protein, putative  26.83 
 
 
1001 aa  86.7  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1352  replication factor C large subunit  32.48 
 
 
484 aa  86.3  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0629  replication factor C large subunit  31.85 
 
 
484 aa  85.5  7e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1324  replication factor C large subunit  31.85 
 
 
482 aa  85.1  8e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.414275  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  33.12 
 
 
467 aa  85.1  8e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1361  replication factor C large subunit  24.02 
 
 
474 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35815  predicted protein  31.93 
 
 
764 aa  82.8  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.756935 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1333  replication factor C large subunit  30.77 
 
 
492 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.513611  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0270  ATPase central domain-containing protein  26.41 
 
 
385 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022175 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  30.41 
 
 
454 aa  79  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06303  Replication factor C like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78622]  26.75 
 
 
1092 aa  78.2  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1810  replication factor C large subunit  30.86 
 
 
500 aa  75.9  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0498  replication factor C large subunit  24.78 
 
 
476 aa  71.6  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1828  AAA ATPase central domain protein  32.65 
 
 
405 aa  71.2  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0627242  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  29.8 
 
 
497 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  29.68 
 
 
642 aa  69.3  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30204  predicted protein  23.14 
 
 
498 aa  68.9  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.381291  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  28.19 
 
 
497 aa  68.6  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  24.78 
 
 
483 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2049  replication factor C large subunit  24.45 
 
 
443 aa  68.2  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43994  predicted protein  25.1 
 
 
942 aa  67.4  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  30.61 
 
 
451 aa  67  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  33.81 
 
 
481 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3011  replication factor C large subunit  29.14 
 
 
507 aa  66.6  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.379588  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  28 
 
 
514 aa  66.2  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0507  AAA ATPase central domain protein  29.76 
 
 
437 aa  63.9  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  29.56 
 
 
315 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  28.93 
 
 
315 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  28.93 
 
 
315 aa  58.5  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  27.67 
 
 
315 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  22.69 
 
 
322 aa  57  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1757  replication factor C large subunit  27.03 
 
 
497 aa  56.2  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0412755  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  21.85 
 
 
329 aa  55.5  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  22.27 
 
 
320 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  21.85 
 
 
324 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  21.85 
 
 
328 aa  53.5  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0489  putative cell division protease FtsH-like protein  30.77 
 
 
643 aa  53.5  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  22.46 
 
 
319 aa  52.8  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  21.43 
 
 
326 aa  52  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  21.43 
 
 
329 aa  50.1  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  31.15 
 
 
771 aa  48.9  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  25.17 
 
 
325 aa  49.3  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  22.31 
 
 
326 aa  48.5  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  24.34 
 
 
326 aa  48.5  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  31.93 
 
 
613 aa  48.5  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31554  replication factor ATPase  38.57 
 
 
786 aa  48.5  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.000494738  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl672  cell division protein  32.54 
 
 
650 aa  48.1  0.0001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  23.33 
 
 
347 aa  48.1  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  39.53 
 
 
682 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.53 
 
 
672 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  32.74 
 
 
379 aa  47.8  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0441  putative cell division protease FtsH-like protein  30.12 
 
 
641 aa  48.1  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.375713  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.93 
 
 
615 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  22.89 
 
 
341 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.53 
 
 
672 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  40.7 
 
 
681 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.53 
 
 
685 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.259213 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.45 
 
 
614 aa  47.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.36 
 
 
612 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.5 
 
 
760 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0357  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.76 
 
 
613 aa  47.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0125367  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43936  predicted protein  26.03 
 
 
1223 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.36 
 
 
620 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1566  AAA ATPase central domain protein  31.58 
 
 
625 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.20815  hitchhiker  0.00245284 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1606  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.48 
 
 
660 aa  47.4  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.53 
 
 
671 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.37 
 
 
687 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.53 
 
 
679 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  38.37 
 
 
689 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0538  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.37 
 
 
659 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673684  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  39.53 
 
 
656 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2987  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.37 
 
 
669 aa  47.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.832035  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.53 
 
 
669 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0616  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.37 
 
 
662 aa  47  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  31.33 
 
 
613 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0642  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.53 
 
 
616 aa  47  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.53 
 
 
634 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.99 
 
 
347 aa  47  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.7 
 
 
743 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2460  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.53 
 
 
635 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  39.53 
 
 
635 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  38.37 
 
 
753 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.48 
 
 
628 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2188  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.48 
 
 
649 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350229  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.53 
 
 
635 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01240  membrane protease FtsH catalytic subunit  38.37 
 
 
696 aa  47  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.7 
 
 
653 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2104  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.21 
 
 
677 aa  46.6  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1721  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.48 
 
 
628 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.54064  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>