75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1710 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1710  transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  438  9.999999999999999e-123  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4675  transcriptional regulator, TetR family  56 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1759  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23280  transcriptional regulator, TetR family  41.24 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0688  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0733  transcriptional regulator  40 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3140  TetR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1859  transcriptional regulator  40.28 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1584  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 204 aa  52  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1939  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.640559  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0393  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 208 aa  48.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1550  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 214 aa  48.1  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.147371  normal  0.894594 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 219 aa  45.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  25.78 
 
 		 189 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3834  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 218 aa  45.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  24.19 
 
 		 204 aa  45.4  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  45.4  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 207 aa  45.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 200 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.42 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  26.42 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.42 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.42 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.42 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  26.42 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.42 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.42 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  27.47 
 
 		 219 aa  42.4  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 223 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.93 
 
 		 218 aa  42.4  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.93 
 
 		 218 aa  42.4  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.93 
 
 		 218 aa  42.4  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 227 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 205 aa  42.4  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4876  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 208 aa  42.4  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 242 aa  42  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0331  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 209 aa  42  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0262  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 198 aa  42  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000117006 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 203 aa  42  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 206 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 206 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 206 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  20.75 
 
 		 209 aa  41.6  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3574  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 187 aa  41.6  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  21.5 
 
 		 220 aa  41.6  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 223 aa  41.6  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>