122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2933 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2933  ParB-like nuclease  100 
 
 		 177 aa  355  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1452  DNA methylase N-4/N-6  70.87 
 
 		 435 aa  157  9e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2231  ParB family protein  52.21 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.119979  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7135  nuclease  55.75 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.782385  hitchhiker  0.0000459905 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2068  nuclease  45.26 
 
 		 463 aa  121  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204845 
 
 
-
 
NC_002936  DET1092  DNA methylase  53.77 
 
 		 421 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4927  nuclease  42.96 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.603092 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0878  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  53.27 
 
 		 464 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643395  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0870  helix-turn-helix, Fis-type  88.33 
 
 		 353 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.465972 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0653  nuclease  59.79 
 
 		 459 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2356  protein related to arylsulfate sulfotransferase involved in siderophore biosynthesis  96.43 
 
 		 148 aa  117  6e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  58.82 
 
 		 471 aa  117  6e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2905  nuclease  52.29 
 
 		 444 aa  117  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117629  normal  0.708215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1249  nuclease  52.29 
 
 		 444 aa  117  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.535856  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3088  hypothetical protein  90.16 
 
 		 116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.60135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0867  hypothetical protein  94.64 
 
 		 230 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  56.84 
 
 		 436 aa  114  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0816  ParB-like nuclease  55.05 
 
 		 247 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.207727  hitchhiker  0.00120051 
 
 
-
 
NC_003296  RS06032  hypothetical protein  58 
 
 		 222 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4924  nuclease  50.98 
 
 		 196 aa  111  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.180395 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  54.37 
 
 		 425 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  54.37 
 
 		 421 aa  108  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  52.34 
 
 		 411 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2055  nuclease  53.12 
 
 		 448 aa  105  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00544489  normal  0.0145428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2753  nuclease  53.12 
 
 		 452 aa  104  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2825  nuclease  53.12 
 
 		 448 aa  105  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1318  nuclease  52.08 
 
 		 452 aa  103  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.09005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2583  nuclease  52.08 
 
 		 452 aa  103  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197601 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2279  ParB domain protein nuclease  52.94 
 
 		 87 aa  102  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0959  nuclease  44.14 
 
 		 396 aa  102  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273915 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1511  nuclease  45.28 
 
 		 178 aa  101  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3400  nuclease  42.28 
 
 		 200 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360285  hitchhiker  0.000000903225 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1546  DNA methylase N-4/N-6  35.51 
 
 		 470 aa  98.2  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.572545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0254  helix-turn-helix, Fis-type  78.57 
 
 		 785 aa  97.8  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0844  hypothetical protein  62.67 
 
 		 441 aa  96.7  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1541  helix-turn-helix, Fis-type  78.57 
 
 		 495 aa  97.1  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3099  helix-turn-helix, Fis-type  78.57 
 
 		 479 aa  97.1  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2654  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  58.97 
 
 		 447 aa  96.7  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01340  conserved hypothetical protein  51.14 
 
 		 131 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2386  hypothetical protein  44.83 
 
 		 459 aa  95.5  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  45.1 
 
 		 421 aa  94  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6266  ParB domain protein nuclease  45.3 
 
 		 212 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697996  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01351  hypothetical protein  53.95 
 
 		 77 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.739231  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6991  ParB domain protein nuclease  39.34 
 
 		 184 aa  87.8  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.71 
 
 		 488 aa  84.3  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0594  prophage LambdaW4, DNA methylase  39.81 
 
 		 408 aa  81.6  0.000000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0766546  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0830  ParB domain protein nuclease  37.5 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00729707  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02830  ParB-like nuclease  36.28 
 
 		 410 aa  78.2  0.00000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0823901  hitchhiker  4.66219e-31 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0070  ParB domain-containing protein  41.05 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  36.89 
 
 		 409 aa  74.3  0.0000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0872  nuclease  38.54 
 
 		 684 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.71 
 
 		 483 aa  58.5  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3268  ParB family protein  39.53 
 
 		 565 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1480  ParB-like nuclease domain-containing protein  33.02 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0066  DNA methylase  32.32 
 
 		 411 aa  55.8  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0599  ParB-like nuclease domain-containing protein  37.84 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0661  ParB-like nuclease domain-containing protein  37.84 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1244  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34 
 
 		 412 aa  55.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1638  ParB-like nuclease  34.44 
 
 		 417 aa  54.7  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0822558  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1729  DNA methylase N-4/N-6  28.41 
 
 		 411 aa  54.7  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0392  DNA methylase, family protein  31.31 
 
 		 413 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3718  ParB domain protein nuclease  32.46 
 
 		 223 aa  53.9  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1156  ParB domain protein nuclease  34.88 
 
 		 442 aa  53.9  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.28535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2842  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32 
 
 		 413 aa  53.9  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.137249  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0563  ParB domain protein nuclease  33.72 
 
 		 462 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3104  ParB domain protein nuclease  33.72 
 
 		 457 aa  52.8  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1149  ParB domain protein nuclease  33.72 
 
 		 422 aa  51.2  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0746  ParB domain protein nuclease  37.93 
 
 		 483 aa  50.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0200895  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  39.13 
 
 		 282 aa  49.7  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3389  hypothetical protein  31.91 
 
 		 296 aa  50.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39686  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1639  DNA methylase N-4/N-6  30.53 
 
 		 432 aa  48.9  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  36.23 
 
 		 272 aa  47.4  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3667  parB-like partition protein  35.56 
 
 		 293 aa  47.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  38.89 
 
 		 298 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0096  ParB family chromosome partitioning protein  31.03 
 
 		 278 aa  45.4  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0136  ParB family chromosome partitioning protein  31.03 
 
 		 278 aa  45.1  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0108  ParB family chromosome partitioning protein  31.03 
 
 		 278 aa  45.1  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  35.9 
 
 		 274 aa  45.4  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  34.25 
 
 		 268 aa  45.1  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2755  parB-like partition protein  29.58 
 
 		 280 aa  44.7  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2276  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.98 
 
 		 403 aa  44.7  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  37.5 
 
 		 293 aa  43.9  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  32.95 
 
 		 272 aa  43.9  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  36.49 
 
 		 294 aa  44.3  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  32.35 
 
 		 283 aa  43.5  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2569  transcriptional regulator  34.57 
 
 		 284 aa  43.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4223  parB-like partition proteins  35.71 
 
 		 430 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  36.76 
 
 		 362 aa  43.5  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2405  parB-like partition protein  28.09 
 
 		 268 aa  43.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  32.56 
 
 		 283 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  33.72 
 
 		 283 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  33.72 
 
 		 256 aa  42.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  32.56 
 
 		 283 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  33.72 
 
 		 256 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1716  parB-like partition protein  37.84 
 
 		 243 aa  42.4  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000788777  normal  0.421921 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  28.16 
 
 		 314 aa  42.4  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0940  parB-like partition protein  26.83 
 
 		 409 aa  42.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  31.03 
 
 		 283 aa  42.4  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  32.56 
 
 		 283 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  39.39 
 
 		 422 aa  42.4  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>