64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2356 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2356  protein related to arylsulfate sulfotransferase involved in siderophore biosynthesis  100 
 
 
148 aa  302  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876457  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2735  arylsulfate sulfotransferase-related protein  84.78 
 
 
106 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.746879  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0867  hypothetical protein  86.36 
 
 
230 aa  122  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0870  helix-turn-helix, Fis-type  98.25 
 
 
353 aa  122  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.465972 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3088  hypothetical protein  96.55 
 
 
116 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.60135  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2933  ParB-like nuclease  96.43 
 
 
177 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1541  helix-turn-helix, Fis-type  69.44 
 
 
495 aa  102  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0254  helix-turn-helix, Fis-type  64.1 
 
 
785 aa  101  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3099  helix-turn-helix, Fis-type  80.7 
 
 
479 aa  100  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2355  hypothetical protein  58.9 
 
 
84 aa  94.4  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109968  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6108  hypothetical protein  59.21 
 
 
95 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.225397  normal  0.808357 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3273  hypothetical protein  58.9 
 
 
87 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0114868  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2734  hypothetical protein  60 
 
 
84 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3362  hypothetical protein  57.33 
 
 
91 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17875  hitchhiker  0.00920636 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4016  hypothetical protein  61.19 
 
 
92 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1665  hypothetical protein  61.43 
 
 
92 aa  88.2  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0362395 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2028  hypothetical protein  61.76 
 
 
94 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.226085  normal  0.18086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2893  hypothetical protein  53.16 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.573635  normal  0.0754283 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2788  hypothetical protein  52.86 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4519  hypothetical protein  52.31 
 
 
74 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0693  hypothetical protein  45.24 
 
 
88 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0577698  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0597  siderophore biosynthesis protein-like protein  52.46 
 
 
86 aa  70.1  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.125526 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2208  hypothetical protein  52.31 
 
 
86 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1097  hypothetical protein  45.21 
 
 
82 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0868984 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1983  hypothetical protein  51.47 
 
 
79 aa  67.4  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0140836  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0773  hypothetical protein  47.14 
 
 
87 aa  65.5  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2335  hypothetical protein  47.69 
 
 
99 aa  63.5  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.114366  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2444  arylsulfate sulfotransferase-like protein  44.44 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.96992  normal  0.401253 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2826  hypothetical protein  48.44 
 
 
80 aa  63.5  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.026004  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1906  hypothetical protein  55 
 
 
91 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1454  uncharacterized arylsulfate sulfotransferase-like protein  50 
 
 
76 aa  62.4  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.741638  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2029  hypothetical protein  47.22 
 
 
84 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0014169  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1364  hypothetical protein  42.67 
 
 
83 aa  61.6  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.741087  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1407  hypothetical protein  42.67 
 
 
83 aa  61.6  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2805  hypothetical protein  55 
 
 
74 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3211  hypothetical protein  46.88 
 
 
85 aa  61.2  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2395  hypothetical protein  51.67 
 
 
83 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.212026  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2050  hypothetical protein  41.54 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.387597 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1140  hypothetical protein  41.43 
 
 
82 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0719  hypothetical protein  42.42 
 
 
72 aa  57.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.628477 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2546  hypothetical protein  51.67 
 
 
74 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.301102  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2135  hypothetical protein  42.19 
 
 
73 aa  57  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.367063  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0810  hypothetical protein  42.19 
 
 
73 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.542346 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2256  hypothetical protein  44.44 
 
 
82 aa  55.5  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1045  hypothetical protein  43.33 
 
 
68 aa  54.7  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.818924  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4600  hypothetical protein  42.19 
 
 
79 aa  53.9  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1770  hypothetical protein  42.42 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  28.71 
 
 
213 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1704  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002901  hypothetical protein  34.72 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1463  hypothetical protein  40.68 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.481537 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03059  hypothetical protein  33.33 
 
 
98 aa  47.8  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0063  hypothetical protein  35.14 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.883633  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4268  hypothetical protein  30 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.359077  decreased coverage  0.00834069 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5256  hypothetical protein  48.72 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44914  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2940  hypothetical protein  30.38 
 
 
119 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  normal  0.665558 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3868  hypothetical protein  34.29 
 
 
91 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0188377 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2767  hypothetical protein  33 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5816  hypothetical protein  46.15 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1993  hypothetical protein  30.68 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.887404  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3509  hypothetical protein  29.27 
 
 
116 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3367  hypothetical protein  30.67 
 
 
89 aa  41.6  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0796854  normal  0.25879 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3804  hypothetical protein  32 
 
 
116 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1386  hypothetical protein  35.21 
 
 
87 aa  40  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>