19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_3088 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_3088  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  237  4e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.60135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0870  helix-turn-helix, Fis-type  92.19 
 
 		 353 aa  123  9e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.465972 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0867  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2356  protein related to arylsulfate sulfotransferase involved in siderophore biosynthesis  96.55 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2933  ParB-like nuclease  90.16 
 
 		 177 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3153  hypothetical protein  88.14 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.328653  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3063  hypothetical protein  81.36 
 
 		 87 aa  104  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6190  hypothetical protein  79.66 
 
 		 84 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455436 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3028  hypothetical protein  79.66 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0254  helix-turn-helix, Fis-type  79.31 
 
 		 785 aa  100  9e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1220  hypothetical protein  74.58 
 
 		 88 aa  99  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3515  hypothetical protein  74.58 
 
 		 88 aa  99  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.341735  normal  0.667313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7411  hypothetical protein  74.58 
 
 		 80 aa  97.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3099  helix-turn-helix, Fis-type  78.95 
 
 		 479 aa  98.2  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1541  helix-turn-helix, Fis-type  77.59 
 
 		 495 aa  98.2  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3821  hypothetical protein  80 
 
 		 83 aa  96.3  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.688246  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2127  hypothetical protein  63.51 
 
 		 80 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7716  hypothetical protein  72.13 
 
 		 82 aa  90.5  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.108043 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2654  hypothetical protein  66.1 
 
 		 71 aa  87  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.192048 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>