More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1716 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1716  parB-like partition protein  100 
 
 		 243 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000788777  normal  0.421921 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  26.67 
 
 		 284 aa  85.1  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2024  parB-like partition protein  35.17 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000382297  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  35.14 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  34.46 
 
 		 302 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  30.5 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  32.45 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  34.92 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  30 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  34.97 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  30.5 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  30.5 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  30.3 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  30.3 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  30 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  32.89 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  31.61 
 
 		 292 aa  75.5  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  30.26 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  35.06 
 
 		 294 aa  75.5  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  31.72 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  29.13 
 
 		 303 aa  75.1  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  30.26 
 
 		 256 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  30.5 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4021  parB-like partition protein  33.77 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  29.13 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  31.03 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  33.78 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  33.11 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  31.25 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  37.4 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  33.78 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  29.86 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  36.8 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  31.17 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  29.49 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  31.17 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  30.96 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  30.1 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0252  parB-like partition protein  34.92 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  31.97 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2139  parB-like partition protein  36.11 
 
 		 367 aa  72.4  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187348 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  33.79 
 
 		 281 aa  72  0.000000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  34.43 
 
 		 293 aa  72  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  30.52 
 
 		 290 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  30.52 
 
 		 290 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  26.79 
 
 		 286 aa  71.6  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  26.79 
 
 		 286 aa  71.6  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  30.52 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  30.52 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  30.52 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  30.52 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2438  parB-like partition protein  31.53 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  30.52 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  31.29 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  29.3 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  36.36 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  34.18 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  29.06 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  29 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  31.41 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  31.29 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  33.79 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  25.63 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0509  parB-like partition protein  30.73 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  30.41 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  32.65 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  33.12 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  31.87 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  29.44 
 
 		 391 aa  69.3  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  30.52 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1453  parB-like partition protein  29.87 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  31.25 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  30.67 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 307 aa  68.9  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  29.17 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  29.17 
 
 		 298 aa  68.6  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  31.43 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  31.43 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  30.67 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  34.96 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  31.82 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  33.33 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  29.66 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  29.58 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  33.1 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  29.66 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  30.07 
 
 		 289 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  31.55 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  32.65 
 
 		 321 aa  67  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  33.97 
 
 		 323 aa  67  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  25.31 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  30.07 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2362  ParB family protein  27.5 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  31.22 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  26.92 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  29.76 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  26.58 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  33.58 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  32.79 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  29.76 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>